公开(公告)号：US20150344837A1

公开(公告)日：2015-12-03

申请号：US14733743

申请日：2015-06-08

Applicant: Synthetic Genomics, Inc.

Inventor： John I. Glass ,  Hamilton O. Smith ,  Clyde A. Hutchison lll ,  Nina Y. Alperovich ,  Nacyra Assad-Garcia

IPC: C12N1/20 ,  C12R1/35 ,  C07K14/30 ,  C12N9/16

CPC classification number: C12N1/20 ,  C07K14/195 ,  C07K14/30 ,  C12N9/16 ,  C12P3/00 ,  C12P7/06 ,  C12R1/35 ,  C12Y301/04046 ,  Y02E50/17

Abstract: The present invention relates, e.g., to a minimal set of protein-coding genes which provides the information required for replication of a free-living organism in a rich bacterial culture medium, wherein (1) the gene set does not comprise the 100 genes listed in Table 2; and/or wherein (2) the gene set comprises the 382 protein-coding genes listed in Table 3 and, optionally, one of more of: a set of three genes encoding ABC transporters for phosphate import (genes MG410, MG411 and MG412; or genes MG289, MG290 and MG291); the lipoprotein-encoding gene MG185 or MG260; and/or the glycerophosphoryl diester phosphodiesterase gene MG293 or MG385.

Abstract translation: 本发明涉及例如提供在富细菌培养基中复制自由活体的所需信息的蛋白质编码基因的最小集合，其中（1）基因组不包括所列出的100个基因 在表2中; 和/或其中（2）基因组包含表3中列出的382个蛋白质编码基因，以及任选地，一组编码ABC转运蛋白的三个基因（基因MG410，MG411和MG412;或 基因MG289，MG290和MG291）; 编码脂蛋白的基因MG185或MG260; 和/或甘油磷酸二酯磷酸二酯酶基因MG293或MG385。

公开(公告)号：US20160319324A1

公开(公告)日：2016-11-03

申请号：US15107481

申请日：2014-12-23

Applicant: THE JOHNS HOPKINS UNIVERSITY

Inventor： Shanthini Sockanathan ,  Sungjin Park

IPC: C12Q1/44 ,  A61K31/714 ,  A61K31/4402 ,  A61K31/165 ,  A61K31/192 ,  A61K31/7048 ,  A61K31/198

CPC classification number: C12Q1/44 ,  A61K31/165 ,  A61K31/192 ,  A61K31/198 ,  A61K31/4402 ,  A61K31/555 ,  A61K31/7048 ,  A61K31/7088 ,  A61K31/713 ,  A61K31/714 ,  C12N9/16 ,  C12Y301/04046 ,  G01N33/5008 ,  G01N2333/916 ,  G01N2500/02 ,  G01N2500/10 ,  G01N2500/20

Abstract: The present invention relates to glycerophosphodiester phosphodiesterase (GDE) proteins. More specifically, the present invention relates to targeting GDE proteins to modulate its glycosylphosphatidylinositol (GPI)-cleaving activity. In a specific embodiment, the present invention provides a GDE modulator that modulates the surface GPI anchor cleavage activity of GDE.

Abstract translation: 本发明涉及甘油磷酸二酯磷酸二酯酶（GDE）蛋白。 更具体地，本发明涉及靶向GDE蛋白以调节其糖基磷脂酰肌醇（GPI）的切割活性。 在具体实施方案中，本发明提供了调节GDE的表面GPI锚定切割活性的GDE调节剂。

公开(公告)号：US20070122826A1

公开(公告)日：2007-05-31

申请号：US11546364

申请日：2006-10-12

Applicant: John Glass ,  Hamilton Smith ,  Clyde Hutchison ,  Nina Alperovich ,  Nacyra Assad-Garcia

Inventor： John Glass ,  Hamilton Smith ,  Clyde Hutchison ,  Nina Alperovich ,  Nacyra Assad-Garcia

IPC: C40B30/06 ,  C40B40/10 ,  C07H21/04 ,  C12P7/06 ,  C12P1/06 ,  C12N9/02 ,  C12N1/21

CPC classification number: C12N1/20 ,  C07K14/195 ,  C07K14/30 ,  C12N9/16 ,  C12P3/00 ,  C12P7/06 ,  C12R1/35 ,  C12Y301/04046 ,  Y02E50/17

Abstract: The present invention relates, e.g., to a minimal set of protein-coding genes which provides the information required for replication of a free-living organism in a rich bacterial culture medium, wherein (1) the gene set does not comprise the 101 genes listed in Table 2; and/or wherein (2) the gene set comprises the 381 protein-coding genes listed in Table 3 and, optionally, one of more of: a set of three genes encoding ABC transporters for phosphate import (genes MG410, MG411 and MG412; or genes MG289, MG290 and MG291); the lipoprotein-encoding gene MG185 or MG260; and/or the glycerophosphoryl diester phosphodiesterase gene MG293 or MG385.

Abstract translation: 本发明涉及例如提供在富细菌培养基中复制自由活体的所需信息的蛋白质编码基因的最小集合，其中（1）基因组不包括所列出的101个基因 在表2中; 和/或其中（2）基因组包含表3中列出的381个蛋白质编码基因，以及任选的一个以下的一个：编码用于磷酸酯进口的ABC转运蛋白的三个基因（基因MG410，MG411和MG412;或 基因MG289，MG290和MG291）; 编码脂蛋白的基因MG185或MG260; 和/或甘油磷酸二酯磷酸二酯酶基因MG293或MG385。