公开(公告)号：CN107345255A

公开(公告)日：2017-11-14

申请号：CN201710690605.1

申请日：2017-08-14

申请人： 中国医科大学附属口腔医院

发明人： 吴琳 ,  刘洁 ,  冯丽芳 ,  曹洪娟 ,  刘笑涵

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6869 ,  C12Q2539/113 ,  C12Q2525/207

摘要： 本发明提供一种LIPUS对三维支架材料上MC3T3-E1细胞内RNA表达影响的研究方法，包括：将MC3T3-E1细胞接种到三维支架材料上；将接种完毕的三维支架材料和超声探头浸入水中，保持超声探头和材料的距离为5cm，从材料底部加载LIPUS，加载过程中每2～3天更换一次MC3T3-E1细胞的培养基；停止加载LIPUS后，收集材料上的MC3T3-E1细胞，进行全转录组和miRNA的高通量测序，筛选差异表达的mRNA、lncRNA、miRNA，并结合GO和KEGG进行整合分析。本发明为后续研究LIPUS促进三维材料内成骨分化的分子生物学机制提供可靠数据和新的研究思路。

公开(公告)号：CN1602361A

公开(公告)日：2005-03-30

申请号：CN02824501.6

申请日：2002-11-04

申请人： 视基因公司

发明人： 千钟润

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2539/113 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/101 ,  C12Q2525/155

摘要： 本发明涉及用于通过杂交进行靶核苷酸序列分析的寡核苷酸及该寡核苷酸的应用。该寡核苷酸具有以下通式结构。5′－Xp－Yq－Zr－3′或5’－Zr－Yq－Xp－3′，其中Xp表示第一杂交部分，该第一杂交部分具有与与其杂交的所述样品核酸中的所述靶核酸序列基本互补的特异性杂交核苷酸序列；Yq表示含有至少两个通用碱基或非识别碱基类似物的调控子部分；Zr表示具有预先选定的任意核苷酸序列的第二杂交部分；p，q和r表示核苷酸的数目；X，Y和Z为脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸。

公开(公告)号：CN1420936A

公开(公告)日：2003-05-28

申请号：CN00814824.4

申请日：2000-10-24

申请人： 兰诺龙有限公司

发明人： J·普赖斯 ,  D·尤瓦诺格

IPC分类号： C12Q1/68 ,  C12N5/06

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  A61K35/12 ,  C12N5/0618 ,  C12Q1/6881 ,  C12Q2539/113 ,  C12Q2600/158

摘要： 本发明涉及通过例如差异显示，对选择细胞的基因表达图谱与获自对照细胞的图谱进行比较，鉴定适于在移植治疗中修复神经损伤的多能细胞。

公开(公告)号：CN106845152A

公开(公告)日：2017-06-13

申请号：CN201710064216.8

申请日：2017-02-04

申请人： 北京林业大学

发明人： 张德强

IPC分类号： G06F19/22 ,  C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6858 ,  G16B30/00 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2523/125 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2539/113

摘要： 本发明提供了一种基因组胞嘧啶位点表观基因型分型方法，包括以下步骤：1)对待测样品父母本和子代样本进行重亚硫酸盐全基因组甲基化测序，获得父母本和子代样本基因组序列；2)将父母本和子代样本基因组序列与参考基因组比对获得比对结果，确定待测胞嘧啶位点；3)将比对结果进行染色体坐标排序、reads去重复处理，再通过GATK2‑V3.2对已知胞嘧啶位点上下游5～10bp的序列进行Call SNPs，从而区分子代等位基因序列；4)将已获得的被区分过子代等位基因序列与父母本基因组序列比对，完成胞嘧啶表观基因型分型。本发明首次完成了基因组胞嘧啶位点表观基因型分型，技术成熟，成本低，易于操作与推广应用。

公开(公告)号：CN101316937B

公开(公告)日：2016-05-25

申请号：CN200680044723.5

申请日：2006-11-29

申请人： 莱克瑟津有限责任公司

发明人： A·塞茨

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q1/6844 ,  C12Q1/6853 ,  C12Q2539/113 ,  C12Q2521/131 ,  C12Q2525/179 ,  C12Q2521/107

摘要： 本发明提供扩增样品中一群多核苷酸分子的方法，其特征在于包括下述步骤：a)获取样品或RNA并反转录整条RNA分子从而创制全长cDNA或获取全长cDNA的样品，b)用多核苷酸尾在3’端后在转录的cDNA的3’端加尾，c)用一对引物扩增cDNA，其中第一(3’)引物对cDNA的5’端特异，第二(51)引物对多核苷酸尾的上游部分和cDNA的3’多核苷酸尾上游的最近的1到10个核苷酸特异。

公开(公告)号：CN104293892A

公开(公告)日：2015-01-21

申请号：CN201310298676.9

申请日：2013-07-16

申请人： 北京林业大学

发明人： 张德强 ,  王博文 ,  杜庆章

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6816 ,  C12Q2539/113

摘要： 本发明公开了一种检测核基因组中与表型性状相关基因的方法。该方法包括以下步骤：S1，测量F1代杂交群体的目标表型性状，选取极端的目标表型性状；S2，提取极端的目标表型性状个体的RNA，采用BSA法分组后构建表达谱基因芯片；S3，根据表达谱基因芯片的信息找出表达有差异的基因，该基因即为核基因组中与目标表型性状相关基因。应用本发明的技术方案，通过多次测量筛选F1代杂交群体的目标表型性状，从中挑选具有稳定极端目标表型性状的个体，应用BSA法混合分组构建基因池，从而突出目标表型性状的差异，结合基因芯片技术使大量基因同时进行杂交，通过分析芯片结果筛选出与目标表型性状相关的差异表达基因。

公开(公告)号：CN104805182A

公开(公告)日：2015-07-29

申请号：CN201510148540.9

申请日：2015-03-31

申请人： 江汉大学 ,  农业部科技发展中心

发明人： 魏传斌 ,  彭海 ,  陈红 ,  张静 ,  高利芬

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6895 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2600/156 ,  C12Q2539/113

摘要： 本发明公开了一种测定杂交水稻新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括：获得变异位点；确定待测水稻品种的测试区域；构建数据库；确定抽样量后，随机抽样混合并提取混合样本的DNA；制备引物；利用引物对混合样本的DNA进行扩增，扩增产物用于构建高通量测序文库；对高通量测序文库进行高通量测序，得到测序片段组；分析测序片段组，获得待测水稻品种基因型和杂株基因型；比较获得近似品种、变异位点和变异位点率；获得杂株品种后，计算杂株率；利用变异位点、变异位点率和杂株率，判断待测水稻品种特异性、一致性和稳定性。所述方法能够准确、完整地判断待测水稻品种的特异性、稳定性与一致性，且测试速度更快。

公开(公告)号：CN102985561B

公开(公告)日：2015-04-01

申请号：CN201180022971.0

申请日：2011-04-14

申请人： 维里纳塔健康公司

发明人： 里查德·P·拉瓦

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  G06F19/18 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2537/16 ,  C12Q2539/113

摘要： 本发明提供了一种能够在包含胎儿和母体核酸的母体样品中检测单个或多个胎儿染色体非整倍性并且验证已作出正确的确定的方法。该方法适用于在多个样品中确定任何感兴趣的序列的拷贝数变异(CNV)，这些样品包含来源于两个不同基因组的基因组核酸的混合物，并且已知或怀疑这两个不同基因组在一个或多个感兴趣的序列的量方面不同。该方法至少适用于无创性产前诊断的实施，并且适用于与健康个体对比患病的个体中序列表达差异有关的病状的诊断和监测。

公开(公告)号：CN1578841A

公开(公告)日：2005-02-09

申请号：CN02822509.0

申请日：2002-09-19

申请人： 视基因公司

发明人： 千锺润

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6809 ,  C12Q1/686 ,  C12Q2539/113 ,  C12Q2525/161 ,  C12Q2525/101 ,  C12Q2525/155

摘要： 本发明涉及用于提高在核酸扩增中退火特异性的退火控制引物和该退火控制引物在所有涉及核酸扩增技术领域的应用。本发明的引物包括(a)具有与与其杂交的模板核酸上的位点基本互补的杂交核苷酸序列的3′－末端部分；(b)具有预先选择的任意核苷酸序列的5′－末端部分；及(c)位于该3′－和5′－末端部分之间的调控子部分，该调控子部分含有至少一个通用碱基或非识别碱基类似物，从而该调控子部分能够结合退火温度条件调节该引物的退火部分。

公开(公告)号：CN106399510A

公开(公告)日：2017-02-15

申请号：CN201610849797.1

申请日：2016-09-26

申请人： 南昌大学第二附属医院

发明人： 黄波 ,  王小中 ,  邹叶青 ,  刘静 ,  徐颜美 ,  闵清华

IPC分类号： C12Q1/68

CPC分类号： C12Q1/6883 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q2600/158 ,  C12Q2600/178 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2539/113

摘要： 本发明提供一种尿液外泌体miRNA的分析方法，包括尿液标本的收集，外泌体及其总RNA的提取，cDNA文库的建立及Illumina测序，测序结果的处理和注释，获取样本miRNA表达量的表达信息。通过高通量测序技术，对尿液标本外泌体miRNA分析处理，获取miRNA的表达信息；通过建立IgA肾病患者和健康对照者的数据库，利用靶基因功能预测深入研究差异表达的miRNA,深入研究这些差异表达的miRNA将有助于进一步阐明IgA肾病的发病及致病机理，为IgA肾病的诊断提供新的方法及理论基础。该方法设计合理可行，能够有效的建立一种无创的精准的差异表达的miRNA方法，为临床诊治工作提供新的思路。