一种批量生物数据处理方法、装置及介质

    公开(公告)号:CN116705171B

    公开(公告)日:2024-04-05

    申请号:CN202310588835.2

    申请日:2023-05-24

    申请人: 西北大学

    发明人: 刘睿 吴刚 郭松涛

    摘要: 本发明涉及批量生物数据处理方法,包括:获取用户输入的初始命令行命令;获取所述用户针对所述初始命令行命令输入的标记信息,所述标记信息包括所述初始命令行命令中携带的生物信息文件的输入信息和/或输出信息;根据所述标记信息,向所述用户响应对应的关联控制界面,以供用户通过所述关联控制界面输入所述输入信息对应的待输入的生物信息文件的匹配策略,和/或待输出的生物信息文件的输出规则,以及批量命令转换规则;根据所述待输入的生物信息文件的匹配策略,和/或待输出的生物信息文件的输出规则,并结合所述批量命令转换规则,生成针对若干生物信息文件进行处理的批量命令行命令;执行所述批量命令行命令,并向所述用户反馈执行结果。

    用于川金丝猴亲权鉴定的微卫星检测方法、位点组合及引物组合、试剂盒与应用

    公开(公告)号:CN115216546A

    公开(公告)日:2022-10-21

    申请号:CN202210353012.7

    申请日:2022-04-02

    申请人: 西北大学

    摘要: 本发明提供一种用于川金丝猴亲权鉴定的微卫星检测方法、位点组合及引物组合、试剂盒与应用,解决现有微卫星位点标记技术进行川金丝猴亲权鉴定中存在鉴定结果不够准确的技术问题。首先确定19对微卫星位点组合,核心重复序列为四碱基重复,重复序列重复次数在8次以上,产物在100‑300bp;根据19对微卫星位点组合合成相应微卫星位点引物;之后,利用合成的相应微卫星引物组合及川金丝猴个体的基因组DNA,进行PCR扩增反应,获得扩增产物;最后利用毛细管电泳检测方法,检测扩增产物的微卫星多态性;分析检测结果,实现川金丝猴的高精度亲权鉴定,精确度达到99.99%,具有快速、准确、简便和实现成本较低的优点。

    一种自然场景下的金丝猴躯体分割算法

    公开(公告)号:CN110287777B

    公开(公告)日:2021-06-08

    申请号:CN201910405596.6

    申请日:2019-05-16

    申请人: 西北大学

    摘要: 本发明公开了一种自然场景下的金丝猴躯体分割算法,该算法包括构造语义分割网络,实现端到端的图像分割;对所述的语义分割网络进行训练,保存训练后的网络模型用于待分割图像的分割检测;所述的语义分割网络包括分类网络、融合部分以及输出部分,分类网络用于对输入图像进行特征提取并进行像素级的分类,得到置信图;特征融合层有两个,分别融合最底两层、三层的分割网络,提高识别准确率,实现跨层连接;输出部分最终输出与原始图像大小一致的高分辨率的类热力图。本发明有效地提高了检测准确率,可以较好地解决金丝猴身体被分为多个部分的问题。

    一种基于S-TLD的川金丝猴面部检测和追踪方法

    公开(公告)号:CN105825168B

    公开(公告)日:2019-07-02

    申请号:CN201610072508.1

    申请日:2016-02-02

    申请人: 西北大学

    IPC分类号: G06K9/00

    摘要: 本发明公开了一种基于S‑TLD的川金丝猴面部检测和追踪方法,属于图像处理领域。所述发明包括获取川金丝猴的肤色和毛色图片,确定川金丝猴的面部特征库,使用SVM分类器对所述面部特征库中的特征进行优化,得到优化后的SVM网络模型,获取待识别的视频图像,结合所述SVM模型,在所述视频图像中对川金丝猴进行定位,基于TLD理论对定位后的川金丝猴进行追踪。通过使用备用分类器SVM,使得该追踪方法在背景复杂、目标运动幅度大或重新回到视频中的情况下有较高的追踪精度。同时针对金丝猴自身的特性,如复杂的面部纹理特征、动作极其敏捷迅速。本发明使用了LBP算子提取金丝猴面部特征,使得在光照变化、面部多尺度变化的情况下保证了追踪的正确性和速度。

    一种批量生物数据处理方法、装置及介质

    公开(公告)号:CN116705171A

    公开(公告)日:2023-09-05

    申请号:CN202310588835.2

    申请日:2023-05-24

    申请人: 西北大学

    发明人: 刘睿 吴刚 郭松涛

    摘要: 本发明涉及批量生物数据处理方法,包括:获取用户输入的初始命令行命令;获取所述用户针对所述初始命令行命令输入的标记信息,所述标记信息包括所述初始命令行命令中携带的生物信息文件的输入信息和/或输出信息;根据所述标记信息,向所述用户响应对应的关联控制界面,以供用户通过所述关联控制界面输入所述输入信息对应的待输入的生物信息文件的匹配策略,和/或待输出的生物信息文件的输出规则,以及批量命令转换规则;根据所述待输入的生物信息文件的匹配策略,和/或待输出的生物信息文件的输出规则,并结合所述批量命令转换规则,生成针对若干生物信息文件进行处理的批量命令行命令;执行所述批量命令行命令,并向所述用户反馈执行结果。