一种ARN数据库系统及其分析构建科学假说的方法

    公开(公告)号:CN106126550B

    公开(公告)日:2019-08-23

    申请号:CN201610428047.7

    申请日:2016-06-15

    Abstract: 本发明公开了一种ARN数据库系统及其分析构建科学假说的方法,以ARN数据库中的3万多条脂肪生成分子调控信息为基础,基于开放的和闭合的两种构建科学假说的方法,根据用户的特定科研目的,可以快速构建出脂肪生成相关的科学假说,并可以根据数据库现有的数据,对各假说进行初步的评价。本发明将数据库技术与基于文献的科学假说建立方法相结合,充分发挥了数据库对于数据的强大储存和整合功能,赋予了基于文献的科学假说建立方法充分的灵活性,为脂肪生成相关基因和通路的发现提供帮助。同时,也可为其他专业数据库的开发利用提供参考依据。

    miR-493启动子区SNPs在秦川牛体尺、肉质性状预测中的应用

    公开(公告)号:CN119410786A

    公开(公告)日:2025-02-11

    申请号:CN202411576146.0

    申请日:2024-11-06

    Abstract: 本发明公开了miR‑493基因启动子区SNPs在秦川牛体尺、肉质性状预测中的应用。本发明发现标记位于miR‑493基因启动子区的四个SNP位点,与秦川牛体斜长、背膘厚性状显著相关。基于这一发现,可通过检测miR‑493上述SNPs位点基因型预测秦川牛体尺和肉质性状;同时,提供了用于SNP位点检测的试剂盒和操作方法,可实现对肉牛群体快速检测并判定个体基因型,用于犊牛早期选种留种,加快肉牛肉用选育进程,节约生产成本。

    一种扩增羚牛微卫星片段的引物组及其应用

    公开(公告)号:CN117210579B

    公开(公告)日:2024-11-15

    申请号:CN202311260182.1

    申请日:2023-09-27

    Abstract: 本发明提供了一种扩增羚牛微卫星片段的引物组以及其应用。将该引物组用于秦岭羚牛的亲子鉴定和分析羚牛种群内近交程度中,有助于圈养秦岭羚牛的亲本管理和繁殖选配,进而能够防止圈养动物由于种群过小所带来的遗传衰退现象,同时也为微卫星分子标记在羚牛种群亲子鉴定和结构研究提供了重要的参考价值。

    牛骨骼肌生成相关MEF2C mRNA m6A甲基化位点的鉴定和功能应用

    公开(公告)号:CN114592067B

    公开(公告)日:2023-03-28

    申请号:CN202210095273.3

    申请日:2022-01-26

    Inventor: 杨昕冉 昝林森

    Abstract: 本发明涉及牛骨骼肌生成相关MEF2C mRNA m6A甲基化位点鉴定,根据m6A‑seq测序的结果,通过生物信息学分析确定MEF2C mRNA上m6A甲基化位点的准确位置,并通过m6A‑IP‑qPCR验证MEF2C mRNA的m6A水平在肌生成中的显著变化;通过m6A位点的同义点突变改变MEF2C的m6A甲基化水平,并影响MEF2C蛋白表达,证明了MEF2C mRNA m6A甲基化具有影响骨骼肌生成的功能;通过双荧光素酶报告系统和RIP实验证明MEF2C的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1轴的调控。为m6A甲基化修饰调控肌肉生长发育的功能研究提供参考,为肉牛的定向选育提供了新的分子标记。

    一种抑制成肌细胞增殖和分化的调控方法

    公开(公告)号:CN109628403B

    公开(公告)日:2022-08-05

    申请号:CN201811548119.7

    申请日:2018-12-18

    Inventor: 宁越 昝林森

    Abstract: 本发明涉及一种抑制成肌细胞增殖和分化的调控方法,根据SMAD5基因CDS区域核苷酸序列全长,设计可靶向沉默SMAD5基因的siRNA,然后通过在线软件挑选可靶向沉默SMAD5基因效果最好的siRNA进行合成,合成的该siRNA命名为siSMAD5片段,其序列为:Sense:CCAUGGAUACAAGCAAUAATT;Antisense:UUAUUGCUUGUAUCCAUGGTT;用siSMAD5片段转染牛成肌细胞,成肌细胞增殖、分化的标志基因MyoG的mRNA水平显著下降,且成肌细胞肌管融合过程也明显受损。该方法简单快速准确,为今后开展调控肌细胞增殖、成肌分化过程提供了新的可靠研究方法。

    一种用于羚牛防盗猎鉴定的引物及其应用

    公开(公告)号:CN113151504A

    公开(公告)日:2021-07-23

    申请号:CN202110539206.1

    申请日:2021-05-18

    Abstract: 本发明提供了一种用于羚牛防盗猎鉴定的引物及其应用,包括Takin‑F和Takin‑R,具体序列为:Takin‑F:5’‑TTCTGCGATTCTGCTTCGTG‑3’;Takin‑R:5’‑CCAGACCCGATGAACACCAG‑3’。对羚牛肌肉组织总RNA的进行转录组测序,根据转录组测序的结果找出了不保守cDNA序列,利用相关生物学分析工具确定了目标cDNA序列,针对此目标cDNA序列设计了特异性引物Takin‑F和Takin‑R,利用特异性引物Takin‑F和Takin‑R鉴定羚牛肌肉组织的提高了鉴定速度和鉴定结果的可靠性;本发明的引物Takin‑F和Takin‑R用于鉴定羚牛肌肉组织特异性时采取荧光定量PCR法,提高了鉴定的灵敏性、特异性和精确性,同时提高了鉴定速度,鉴定结果的观测重复性好、直观性好且可靠性高。

    一种牛丝氨酸苏氨酸激酶STK11干扰腺病毒的构建方法

    公开(公告)号:CN109593785A

    公开(公告)日:2019-04-09

    申请号:CN201811547742.0

    申请日:2018-12-18

    Abstract: 本发明涉及一种牛丝氨酸苏氨酸激酶STK11干扰腺病毒构建方法,首先筛选干扰效率最高的shRNA序列,然后将该shRNA序列与干扰腺病毒载体重组,构建STK11干扰腺病毒;该STK11干扰腺病毒在秦川牛原代前脂肪细胞中进行侵染和干扰效率验证,结果表明侵染效果良好,STK11的表达在mRNA水平上降低76%,蛋白水平也呈显著性下降,可成功实现STK11基因在体细胞中的持续敲低,为今后开展STK11基因功能的相关研究提供了可靠的实验技术。

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