公开(公告)号：CN114592067A

公开(公告)日：2022-06-07

申请号：CN202210095273.3

申请日：2022-01-26

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 杨昕冉 ,  昝林森

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6809 ,  C12N15/10 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/66

Abstract: 本发明提供了牛骨骼肌生成相关MEF2C mRNA m6A甲基化位点鉴定方法，根据m6A‑seq测序的结果，通过生物信息学分析确定MEF2C mRNA上m6A甲基化位点的准确位置，并通过m6A‑IP‑qPCR验证MEF2C mRNA的m6A水平在肌生成中的显著变化；提供了在牛中鉴定MEF2CmRNA m6A甲基化水平的引物序列和方法；通过m6A位点的同义点突变改变MEF2C的m6A甲基化水平，并影响MEF2C蛋白表达，证明了MEF2C mRNA m6A甲基化具有影响骨骼肌生成的功能；提供了检测MEF2C受m6A甲基化修饰调控的方法，通过双荧光素酶报告系统和RIP实验证明MEF2C的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1轴的调控。本发明为m6A甲基化修饰调控肌肉生长发育的功能研究提供参考，为肉牛的定向选育提供了一种新的分子标记。

公开(公告)号：CN114480670A

公开(公告)日：2022-05-13

申请号：CN202210111782.0

申请日：2022-01-26

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 杨昕冉 ,  昝林森

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/10 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/66

Abstract: 本发明提供了牛骨骼肌分化相关DNA去甲基化酶TET1的mRNA上m6A甲基化位点的鉴定方法，提供了鉴定TET1的m6A甲基化水平的引物序列和方法，根据m6A‑seq测序和m6A‑IP‑qPCR鉴定了TET1的m6A水平在成肌分化中的变化；通过m6A位点的同义突变改变TET1的m6A甲基化水平，证明了TET1的m6A甲基化具有影响骨骼肌分化的功能；提供了检测TET1受m6A甲基化修饰调控的方法，通过双荧光素酶报告系统和RIP实验证明TET1的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1的调控；提供了检测DNA甲基化影响m6A甲基化修饰的方法，证明了牛骨骼肌分化中DNA甲基化与RNA甲基化的互作。为m6A甲基化修饰调控肌肉生长发育的功能研究提供参考，鉴定了骨骼肌发育中的一种新的互作机制，为肉牛的定向选育提供了一种新的分子标记。

公开(公告)号：CN114480670B

公开(公告)日：2022-12-06

申请号：CN202210111782.0

申请日：2022-01-26

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 杨昕冉 ,  昝林森

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6809 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/10 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/66

Abstract: 本发明涉及牛骨骼肌分化相关DNA甲基化酶TET1与m6A甲基化酶METTL3互作鉴定和应用，提供了鉴定TET1的m6A甲基化水平的引物序列和方法，根据m6A‑seq测序和m6A‑IP‑qPCR鉴定了TET1的m6A水平在成肌分化中的变化；通过m6A位点的同义突变改变TET1的m6A甲基化水平，证明了TET1的m6A甲基化具有影响骨骼肌分化功能；提供了检测TET1受m6A甲基化修饰调控方法，证明TET1的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1的调控；提供了检测DNA甲基化影响m6A甲基化修饰方法，证明了牛骨骼肌分化中DNA甲基化与RNA甲基化的互作，为肉牛的定向选育提供了一种新的分子标记。

公开(公告)号：CN114592067B

公开(公告)日：2023-03-28

申请号：CN202210095273.3

申请日：2022-01-26

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 杨昕冉 ,  昝林森

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/6809 ,  C12N15/10 ,  G01N33/68 ,  C12Q1/66

Abstract: 本发明涉及牛骨骼肌生成相关MEF2C mRNA m6A甲基化位点鉴定，根据m6A‑seq测序的结果，通过生物信息学分析确定MEF2C mRNA上m6A甲基化位点的准确位置，并通过m6A‑IP‑qPCR验证MEF2C mRNA的m6A水平在肌生成中的显著变化；通过m6A位点的同义点突变改变MEF2C的m6A甲基化水平，并影响MEF2C蛋白表达，证明了MEF2C mRNA m6A甲基化具有影响骨骼肌生成的功能；通过双荧光素酶报告系统和RIP实验证明MEF2C的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1轴的调控。为m6A甲基化修饰调控肌肉生长发育的功能研究提供参考，为肉牛的定向选育提供了新的分子标记。