用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质

    公开(公告)号:CN117171308A

    公开(公告)日:2023-12-05

    申请号:CN202310945983.5

    申请日:2023-07-28

    Abstract: 本发明涉及一种用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质。该方法包括:基于历史数据集合和/或与用户相关联的数据集合,构建参考数据集合;针对用户输入的问询记录,生成调整后的问询语句;将参考数据集合和所生成的问询语句进行匹配,以便确定与问询语句匹配的参考数据集合的候选项目标识;将所生成的调整后的问询语句匹配到目标应答信息输出类型,以便基于目标应答信息输出类型和候选项目标识而生成条件关键词和问题关键词;以及基于目标需求类型、条件关键词和问题关键词,生成关于问询记录的应答信息。本发明能够高效率、高质量、自动化地实现针对科研数据分析问询问题的应答结果输出合。

    生成目标对象的肿瘤检测数据的方法、设备和介质

    公开(公告)号:CN114974412B

    公开(公告)日:2023-02-10

    申请号:CN202210794329.4

    申请日:2022-07-05

    Inventor: 王凯 陈惠

    Abstract: 本发明涉及一种生成目标对象的肿瘤检测报告数据的方法、设备和介质。该方法包括:获取关于多个目标对象的临床信息和关于多个目标对象的待测样本的测序下机数据,用以生成比对结果数据;基于比对结果数据,生成关于待测样本的多种变异的阳性结果信息;基于多种变异的阳性结果信息和所获取的对照关系数据,生成关于待测样本的变异结果的临床注释信息表,临床注释信息表包括多个字段;以及基于所生成的临床注释信息表、检测报告模板和关于检测报告模板的操作信息,生成目标对象的肿瘤检测报告数据,检测报告模板至少包括多个注释标识和对应变量值。本发明能够灵活兼容不同测序仪器对输出数据的固有差异化设置而实现肿瘤检测数据的按需生成。

    生成目标对象的肿瘤检测数据的方法、设备和介质

    公开(公告)号:CN114974412A

    公开(公告)日:2022-08-30

    申请号:CN202210794329.4

    申请日:2022-07-05

    Inventor: 王凯 陈惠

    Abstract: 本发明涉及一种生成目标对象的肿瘤检测报告数据的方法、设备和介质。该方法包括:获取关于多个目标对象的临床信息和关于多个目标对象的待测样本的测序下机数据,用以生成比对结果数据;基于比对结果数据,生成关于待测样本的多种变异的阳性结果信息;基于多种变异的阳性结果信息和所获取的对照关系数据,生成关于待测样本的变异结果的临床注释信息表,临床注释信息表包括多个字段;以及基于所生成的临床注释信息表、检测报告模板和关于检测报告模板的操作信息,生成目标对象的肿瘤检测报告数据,检测报告模板至少包括多个注释标识和对应变量值。本发明能够灵活兼容不同测序仪器对输出数据的固有差异化设置而实现肿瘤检测数据的按需生成。

    用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质

    公开(公告)号:CN117171308B

    公开(公告)日:2024-09-17

    申请号:CN202310945983.5

    申请日:2023-07-28

    Abstract: 本发明涉及一种用于生成科研数据分析应答信息的方法、设备和介质。该方法包括:基于历史数据集合和/或与用户相关联的数据集合,构建参考数据集合;针对用户输入的问询记录,生成调整后的问询语句;将参考数据集合和所生成的问询语句进行匹配,以便确定与问询语句匹配的参考数据集合的候选项目标识;将所生成的调整后的问询语句匹配到目标应答信息输出类型,以便基于目标应答信息输出类型和候选项目标识而生成条件关键词和问题关键词;以及基于目标需求类型、条件关键词和问题关键词,生成关于问询记录的应答信息。本发明能够高效率、高质量、自动化地实现针对科研数据分析问询问题的应答结果输出合。

    基于知识库和大语言模型的互动式知识交互系统

    公开(公告)号:CN118013001A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410088472.0

    申请日:2024-01-22

    Abstract: 本申请涉及一种基于知识库和大语言模型的互动式知识交互系统。系统包括:交互接口模块,用于接收用户输入的问答请求,问答请求中包含有待查询的医学问题的描述数据;大语言模型模块,用于通过自由式输入或引导式输入将描述数据输入语言识别模型,并获取语言识别模型输出的医学问题的分类信息;知识库模块,用于根据医学问题的分类信息,确定医学问题对应的知识库,在医学问题对应的知识库中查询医学问题对应的回答数据;对话式输出和追问模块,用于根据医学问题对应的回答数据,以及用户再次输入的医学问题,形成连续多轮对话,并对连续多轮对话进行再学习,以实现自由式问答和引导式问答。采用本方法能够提高获取的医学知识的准确度。

    用于识别阳性重排的方法、计算设备和计算机存储介质

    公开(公告)号:CN114496073B

    公开(公告)日:2022-11-08

    申请号:CN202210073465.4

    申请日:2022-01-21

    Inventor: 王凯 陈惠

    Abstract: 本公开涉及一种用于识别阳性重排的方法、计算设备和计算机存储介质。该方法包括:获取关于待测样本的比对结果数据;提取支持多种重排的跨断点的多个支持读长;针对多种重排中的每种重排,记录支持读长的对应断点之前预定长度和对应断点之后的预定长度范围之内的每个基因组位置上关于多种碱基的碱基类型数据,以便生成关于支持读长的对应断点的第一碱基类型数据;以及生成关于参考基因组的对应断点的第二碱基类型数据;基于第一碱基类型数据和第二碱基类型数据,生成输入特征;以及经由重排预测模型生成关于阳性重排的预测结果。本公开能够自动、高通量地并且高准确性地识别阳性重排。

    用于检测RNA水平基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质

    公开(公告)号:CN111292809B

    公开(公告)日:2021-03-16

    申请号:CN202010066733.0

    申请日:2020-01-20

    Inventor: 王凯 陈惠

    Abstract: 本公开涉及一种用于检测RNA水平基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质。该方法包括:接收全基因组比对信息和全转录组比对信息;针对成对失调读长进行聚类,以生成多个大簇;针对符合第一预定条件的大簇进行全基因组层面的基因注释,以便基于对应基因生成用于标识大簇的第一基因组合名称;基于全转录组比对信息,针对多个成对读长进行全转录组层面的基因注释,以便基于对应基因生成用于标识多个成对读长的第二基因组合名称;以及识别第一基因组合名称和第二基因组合名称所关联的相同的对应基因,以便将相同的对应基因确定为潜在的融合基因。本公开有助于对假阳性的快速正确识别,能够明显降低基因融合检测结果的假阳性。

    检测NTRK基因家族融合基因的探针库、试剂、试剂盒及应用

    公开(公告)号:CN111235242B

    公开(公告)日:2020-08-14

    申请号:CN202010352390.4

    申请日:2020-04-28

    Abstract: 本发明提供了一种用于检测NTRK基因家族融合基因的探针库、包括其的检测试剂、该检测试剂在制备用于检测NTRK基因家族融合基因的试剂盒中的应用、相应的试剂盒以及检测方法,其中的探针库包括:第一探针群和第二探针群,其中,NTRK基因家族融合基因的检测基于DNA层面和RNA层面结合进行;第一探针群用于DNA层面检测捕获、第二探针群用于RNA层面检测捕获,第一探针群包括核苷酸系列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.170中所示的任意一条或多条探针;第二探针群包括核苷酸系列如SEQ ID NO.21‑EQ ID NO.170中的任意一条或多条探针。

    DNA重排区域及相应RNA产物检测方法、设备以及存储介质

    公开(公告)号:CN108229100B

    公开(公告)日:2018-08-24

    申请号:CN201810497054.1

    申请日:2018-05-22

    Inventor: 陈惠 王凯 秦公炜

    Abstract: 本发明提供了一种DNA重排区域及相应RNA产物检测方法、设备以及存储介质,其中的DNA重排区域检测方法,包括以下步骤:接收待测样本的比对信息;获取聚类得到多个小簇;按成对的两个映射对应的两个小簇相同的关系分别进行合并得到各个大簇判断各个大簇是否满足预定对数;分别判断各个对数满足预定对数的大簇是否满足预定比对特异性条件;分别对满足比对特异性条件的大簇中按对应的小簇相同的所有映射为一组分别对每组进行预定过滤;判定两个组被预定过滤后都留下的大簇中的所有映射对应的区域为待测样本的一个实际的DNA重排区域在该参考基因组上的映射区域,相应的大簇为支持该DNA重排区域的支持大簇。

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