公开(公告)号：CN110229902A

公开(公告)日：2019-09-13

申请号：CN201910550753.2

申请日：2019-06-24

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司

Inventor： 施巍炜 ,  牟硕 ,  王凯 ,  柳文进 ,  赵松辉

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明提供了一种用于胃癌预后预测的评估基因群的确定方法，其特征在于：基于调控RhoA蛋白活性的RhoA蛋白活性调控通路中包括的基因筛选得到含有多个基因的评估基因群，具体包括以下步骤：步骤1，将RhoA基因调控通路中包括的基因作为备选目标基因集合；步骤2，基于用于筛选的每个胃癌样本的备选目标基因集合中各个基因的表达数据以及RhoA基因的表达数据，按预定确定规则确定待定评估基因群；步骤3，基于包括多个胃癌验证样本的胃癌验证样本群根据预定限定方法确定各个胃癌验证样本得到的胃癌预后为良好的所有预后良好样本和所有胃癌预后为不好的预后不好样本的cox生存分析，确定待定评估基因群是否为能够用于胃癌预后的评估的评估基因群。

公开(公告)号：CN110055334B

公开(公告)日：2019-12-17

申请号：CN201910549657.6

申请日：2019-06-24

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 ,  北京肿瘤医院

Inventor： 施巍炜 ,  沈琳 ,  高静 ,  王凯 ,  柳文进 ,  赵松辉

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种用于胃癌预后预测的评估基因群以及相应的试剂盒，其中的评估基因群基于调控RhoA蛋白活性的RhoA蛋白活性调控通路中包括的基因筛选得到，其中，评估基因群包括以下基因：RHOA、ARHGAP32、ARHGAP4、ARHGAP6、ARHGAP9、ARHGEF17、ARHGEF2、ARHGEF3、BCR、CDC42、CDKN1B、DLEC1、FARP1、NET1、NGEF、OBSCN、PRPF38B、SLC6A5、TSPAN1、VAV2以及VAV3。

公开(公告)号：CN110055334A

公开(公告)日：2019-07-26

申请号：CN201910549657.6

申请日：2019-06-24

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司 ,  北京肿瘤医院

Inventor： 施巍炜 ,  沈琳 ,  高静 ,  王凯 ,  柳文进 ,  赵松辉

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种用于胃癌预后预测的评估基因群以及相应的试剂盒，其中的评估基因群基于调控RhoA蛋白活性的RhoA蛋白活性调控通路中包括的基因筛选得到，其中，评估基因群包括以下基因：RHOA、ARHGAP32、ARHGAP4、ARHGAP6、ARHGAP9、ARHGEF17、ARHGEF2、ARHGEF3、BCR、CDC42、CDKN1B、DLEC1、FARP1、NET1、NGEF、OBSCN、PRPF38B、SLC6A5、TSPAN1、VAV2以及VAV3。

公开(公告)号：CN111863130A

公开(公告)日：2020-10-30

申请号：CN202010650063.7

申请日：2020-07-08

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司

Inventor： 赵松辉 ,  宋越强 ,  王凯

IPC: G16B20/50 ,  G16B20/30 ,  G16B35/20

Abstract: 本发明涉及一种肿瘤免疫治疗预后标志物的筛选方法，包括：获取针对待分析癌种的候选基因群的表达数据、突变数据及临床疗效数据；将所述候选基因群的突变情况与免疫基因组的表达情况做统计学独立性检验，找到与所述免疫基因组相关的基因突变，并按照关联程度由高到低对所述候选基因群中的基因进行排序；其中所述免疫基因组包括CD8A、GZMA、GZMB、IFNγ、EOMES、CXCL9、CXCL10和TBX21；根据前N个基因是否发生突变，分成突变组和非突变组并做生存分析，按照log-rank的变化，选取差异最为显著的M个基因进行保留；将所得基因在独立数据集中进行验证，以确定其突变和预后相关。