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公开(公告)号：CN111755075A
公开(公告)日：2020-10-09
申请号：CN201910241929.6
申请日：2019-03-28
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开了一种对免疫组库高通量测序样本间序列污染进行过滤的方法。本发明方法包括对免疫组库高通量测序所得有效数据进行泳道内样本间低频过滤、泳道间样本间低频过滤和核苷酸序列多样性过滤的步骤。在免疫组库(TCR&BCR)建库和测序方法中测序污染一直是个无可避免的问题，影响着数据的可信性。但是，在免疫组库的计算机分析研究领域，系统且通用性的污染过滤方法一直缺失。本发明填补了这块空白，针对测序过程中可能的污染源进行准确的过滤，保证了后续数据分析的准确性。
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公开(公告)号：CN107828785A
公开(公告)日：2018-03-23
申请号：CN201711204585.9
申请日：2017-11-27
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12N15/11 , C40B50/06 , C12Q1/6869
CPC classification number: C12N15/11 , C12N15/1096 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12Q2535/122 , C12Q2521/301
Abstract: 本发明公开了用于构建猴子BCR文库的成套试剂与方法。本发明公开的构建猴子BCR文库的成套试剂为成套试剂A或成套试剂B；成套试剂A由成套试剂A1与成套试剂A2组成，成套试剂A1为序列表中序列1-7所示的七条单链DNA，成套试剂A2为在序列表中序列8-17的5′端均标记生物素的十条单链DNA；成套试剂B由成套试剂B1与成套试剂B2组成，成套试剂B1为序列表中序列18-24所示的七条单链DNA，成套试剂B2为在序列表中序列25-34的5′端均标记生物素的十条单链DNA。利用本发明的成套试剂构建的猴子BCR文库覆盖度高。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN113017079A
公开(公告)日：2021-06-25
申请号：CN201911345509.9
申请日：2019-12-24
Applicant: 深圳华大生命科学研究院 , 华大精准营养(深圳)科技有限公司
IPC: A23L33/00 , A23L33/12 , A23L33/105 , A23L33/10 , A61K36/752 , A61P39/06 , A61K31/202 , A61K31/352 , A61K31/05 , A61K31/01 , A61K31/047 , A61K31/122 , A61K31/015
Abstract: 本申请公开了一种具有延缓机体衰老作用的组合物及其应用。本申请组合物的活性成份包括重量份100‑300的鱼油浓缩物EPA、50‑200的鱼油浓缩物DHA、30‑150的柑橘生物类黄酮、10‑30的槲皮素、5‑20的白藜芦醇、5‑15的迷迭香提取物、0.2‑2的番茄红素、0.2‑2的叶黄素、0.1‑0.5的虾青素和5‑20的d‑柠檬烯。本申请的组合物，各组分有机结合、相互协同，使得本申请的组合物能多效应复合提升机体性能，具有整体上综合延缓衰老的效果，抗衰老效果良好。
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公开(公告)号：CN107828785B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201711204585.9
申请日：2017-11-27
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12N15/11 , C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了用于构建猴子BCR文库的成套试剂与方法。本发明公开的构建猴子BCR文库的成套试剂为成套试剂A或成套试剂B；成套试剂A由成套试剂A1与成套试剂A2组成，成套试剂A1为序列表中序列1‑7所示的七条单链DNA，成套试剂A2为在序列表中序列8‑17的5′端均标记生物素的十条单链DNA；成套试剂B由成套试剂B1与成套试剂B2组成，成套试剂B1为序列表中序列18‑24所示的七条单链DNA，成套试剂B2为在序列表中序列25‑34的5′端均标记生物素的十条单链DNA。利用本发明的成套试剂构建的猴子BCR文库覆盖度高。
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公开(公告)号：CN110938683A
公开(公告)日：2020-03-31
申请号：CN201811108518.1
申请日：2018-09-21
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
IPC: C12Q1/6869
Abstract: 一种评估目标区域文库的建库污染程度的方法和优化文库构建的方法，其中评估目标区域文库的建库污染程度的方法包括：提供多个合成模板、真实样本和阴性样本作为建库起始材料，合成模板是指根据所述目标区域的已知序列合成的模板序列，真实样本是指包含目标区域序列的样本，阴性样本是指不含任何核酸材料的样本；在建库用多孔板上分别使用合成模板、真实样本和阴性样本进行文库构建，获得测序文库；对测序文库进行上机测序获得测序数据，然后将测序数据比对到目标区域的参考序列，获得比对正确的有效数据；根据合成模板、真实样本和阴性样本各自的有效数据，评估各文库的污染来源及其比例。该方法能够有效评估和控制建库中的污染。
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公开(公告)号：CN111755075B
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN201910241929.6
申请日：2019-03-28
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开了一种对免疫组库高通量测序样本间序列污染进行过滤的方法。本发明方法包括对免疫组库高通量测序所得有效数据进行泳道内样本间低频过滤、泳道间样本间低频过滤和核苷酸序列多样性过滤的步骤。在免疫组库(TCR&BCR)建库和测序方法中测序污染一直是个无可避免的问题，影响着数据的可信性。但是，在免疫组库的计算机分析研究领域，系统且通用性的污染过滤方法一直缺失。本发明填补了这块空白，针对测序过程中可能的污染源进行准确的过滤，保证了后续数据分析的准确性。
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公开(公告)号：CN107038349B
公开(公告)日：2020-03-31
申请号：CN201610075036.5
申请日：2016-02-03
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开一种确定重排前的V和/或J基因序列的方法，包括：(1)获取待测RNA样品的测序数据，测序数据包括来自TCR、BCR和/或Ig的可变区的多个读段；(2)基于测序数据，依据可变区中的V、J与C基因片段的排列关系，确定读段上的来自V/J基因片段的部分，获得多个V/J区部分；(3)从每个V/J区部分取出至少一段序列作为种子序列，获得包含多个种子序列的种子序列集；(4)依据每个种子序列的V/J区部分的支持数目的差异，对V/J区部分进行聚类，获得多个V/J区部分簇；(5)利用每个V/J区部分簇延伸其所支持的种子序列，获得多个候选的重排前V/J基因序；(6)利用读段对候选的重排前V/J基因序列的支持情况进行过滤，以获得重排前的V/J基因序列。
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