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公开(公告)号：CN113539369B
公开(公告)日：2022-03-25
申请号：CN202110804351.8
申请日：2021-07-14
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明提供了一种基于kraken2单条序列kmer评分和整体基于taxonomy结构统计的生信分析方法，所述方法能够降低生信分析假阳性，提高物种检测准确度，适用于二代宏基因组测序分析。
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公开(公告)号：CN113611359B
公开(公告)日：2022-08-05
申请号：CN202110927474.0
申请日：2021-08-13
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号： G16B20/20
摘要： 本发明提供一种通过降维聚类分群提高宏基因组测序数据菌种组装效率的方法，所述方法通过k‑mer频率或频数统计，在组装前进行降维预分群，能够显著提高宏基因组组装效率，组装时间至少减少一半以上，同时保证生信鉴定的有效性和准确性。
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公开(公告)号：CN115985400B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202211545623.8
申请日：2022-12-02
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种宏基因组多重比对序列重分配方法及应用。所述方法对宏基因组测序数据快速分类，基于分类树报告提取小宏基因组参考序列数据库，通过快速比对划分最小分类单元及比对序列独立子集，模拟计算唯一比对率，构建多重比对序列重分配概率模型，进而实现快速准确的物种序列丰度评估。
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公开(公告)号：CN113611359A
公开(公告)日：2021-11-05
申请号：CN202110927474.0
申请日：2021-08-13
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号： G16B20/20
摘要： 本发明提供一种通过降维聚类分群提高宏基因组测序数据菌种组装效率的方法，所述方法通过k‑mer频率或频数统计，在组装前进行降维预分群，能够显著提高宏基因组组装效率，组装时间至少减少一半以上，同时保证生信鉴定的有效性和准确性。
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公开(公告)号：CN113539369A
公开(公告)日：2021-10-22
申请号：CN202110804351.8
申请日：2021-07-14
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号： G16B30/10
摘要： 本发明提供了一种基于kraken2单条序列kmer评分和整体基于taxonomy结构统计的生信分析方法，所述方法能够降低生信分析假阳性，提高物种检测准确度，适用于二代宏基因组测序分析。
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公开(公告)号：CN115985400A
公开(公告)日：2023-04-18
申请号：CN202211545623.8
申请日：2022-12-02
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种宏基因组多重比对序列重分配方法及应用。所述方法对宏基因组测序数据快速分类，基于分类树报告提取小宏基因组参考序列数据库，通过快速比对划分最小分类单元及比对序列独立子集，模拟计算唯一比对率，构建多重比对序列重分配概率模型，进而实现快速准确的物种序列丰度评估。
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公开(公告)号：CN116564405B
公开(公告)日：2023-12-15
申请号：CN202310423663.3
申请日：2023-04-19
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种基于平均无序度的基因组测序突变位点过滤算法，可用于突变位点假阳过滤。
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公开(公告)号：CN116564405A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202310423663.3
申请日：2023-04-19
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本申请属于生信分析技术领域，具体涉及一种基于平均无序度的基因组测序突变位点过滤算法，可用于突变位点假阳过滤。
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公开(公告)号：CN113658638B
公开(公告)日：2022-06-03
申请号：CN202110965392.5
申请日：2021-08-20
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司
摘要： 本发明提供一种生信分析过程中肿瘤纯度矫正方法以及基于NGS平台的同源重组缺陷的检测方法，本发明方法通过比较临床样本与阴性样本在目标区域的测序深度和单核苷酸多态性位点等位基因频率的差异，有效校正肿瘤纯度和倍性，实现HRD评估。
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公开(公告)号：CN114334004B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202111472221.5
申请日：2021-12-04
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要： 本发明属于生信分析领域，具体涉及一种病原微生物测序数据快速比对鉴定方法及其应用，所述方法基于自研分类算法分组快速比对，通过复分类算法统计分析获得病原微生物鉴定和相对定量。
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