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公开(公告)号:CN113539369B
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN202110804351.8
申请日:2021-07-14
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号: G16B30/10
摘要: 本发明提供了一种基于kraken2单条序列kmer评分和整体基于taxonomy结构统计的生信分析方法,所述方法能够降低生信分析假阳性,提高物种检测准确度,适用于二代宏基因组测序分析。
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公开(公告)号:CN115985400A
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN202211545623.8
申请日:2022-12-02
申请人: 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要: 本申请属于生信分析技术领域,具体涉及一种宏基因组多重比对序列重分配方法及应用。所述方法对宏基因组测序数据快速分类,基于分类树报告提取小宏基因组参考序列数据库,通过快速比对划分最小分类单元及比对序列独立子集,模拟计算唯一比对率,构建多重比对序列重分配概率模型,进而实现快速准确的物种序列丰度评估。
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公开(公告)号:CN115985400B
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202211545623.8
申请日:2022-12-02
申请人: 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要: 本申请属于生信分析技术领域,具体涉及一种宏基因组多重比对序列重分配方法及应用。所述方法对宏基因组测序数据快速分类,基于分类树报告提取小宏基因组参考序列数据库,通过快速比对划分最小分类单元及比对序列独立子集,模拟计算唯一比对率,构建多重比对序列重分配概率模型,进而实现快速准确的物种序列丰度评估。
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公开(公告)号:CN113539369A
公开(公告)日:2021-10-22
申请号:CN202110804351.8
申请日:2021-07-14
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
IPC分类号: G16B30/10
摘要: 本发明提供了一种基于kraken2单条序列kmer评分和整体基于taxonomy结构统计的生信分析方法,所述方法能够降低生信分析假阳性,提高物种检测准确度,适用于二代宏基因组测序分析。
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公开(公告)号:CN114300055A
公开(公告)日:2022-04-08
申请号:CN202111629600.0
申请日:2021-12-28
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要: 本发明提供一种通过降维分群和校正基因组长度优化宏基因组纳米孔测序数据定量的方法,所述方法能够提高宏基因组数据的定量准确度,与传统定量方法相比,相关性平均提高50%左右。
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公开(公告)号:CN114300055B
公开(公告)日:2023-04-25
申请号:CN202111629600.0
申请日:2021-12-28
申请人: 江苏先声医学诊断有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
摘要: 本发明提供一种通过降维分群和校正基因组长度优化宏基因组纳米孔测序数据定量的方法,所述方法能够提高宏基因组数据的定量准确度,与传统定量方法相比,相关性平均提高50%左右。
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公开(公告)号:CN112992277B
公开(公告)日:2021-10-26
申请号:CN202110293491.3
申请日:2021-03-18
申请人: 南京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要: 本发明提供了一种微生物基因组数据库构建方法及其应用。本发明的微生物基因组数据库构建方法使用基因组打断后加标签方式构建数据库,同时对多物种共有序列和特异序列标签化,并构建物种特异序列间比对分值矩阵,实现快速准确的获知序列来源。
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公开(公告)号:CN112992277A
公开(公告)日:2021-06-18
申请号:CN202110293491.3
申请日:2021-03-18
申请人: 南京先声医学检验有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司 , 南京先声诊断技术有限公司
摘要: 本发明提供了一种微生物基因组数据库构建方法及其应用。本发明的微生物基因组数据库构建方法使用基因组打断后加标签方式构建数据库,同时对多物种共有序列和特异序列标签化,并构建物种特异序列间比对分值矩阵,实现快速准确的获知序列来源。
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