公开(公告)号：CN118675614A

公开(公告)日：2024-09-20

申请号：CN202410603695.6

申请日：2024-05-15

申请人： 江南大学

发明人： 刘延峰 ,  陈坚 ,  堵国成 ,  刘龙 ,  吕雪芹 ,  张佳宁

IPC分类号： G16B25/10 ,  G16B40/00 ,  G06F18/20 ,  C12N15/31

摘要： 本发明涉及基于隐马尔可夫模型预测N‑端编码序列调控基因表达水平的方法，属于生物信息技术领域。本发明统计提高基因表达水平高的天然N‑端编码序列，建立相应的文库，通过隐马尔可夫模型建立文库中氨基酸转移概率矩阵，通过计算一阶或二阶氨基酸转移概率，将所述氨基酸转移概率矩阵用于N‑端编码序列的评估，并应用该方法成功设计得到了能够应用于降低酿酒酵母无义调节的mRNA降解效应的N‑端编码序列，在该效应存在的情况下提高了基因表达的水平。

公开(公告)号：CN117778442B

公开(公告)日：2024-08-09

申请号：CN202311834611.1

申请日：2023-12-28

申请人： 江南大学

发明人： 刘延峰 ,  陈坚 ,  张佳宁 ,  堵国成 ,  刘龙 ,  吕雪芹

IPC分类号： C12N15/81 ,  C12N15/113 ,  C12N15/55 ,  C12N1/19 ,  C12R1/865

摘要： 本发明公开了一种可同时实现CRISPR激活和CRISPR干扰的表达系统及其应用，其中，表达系统包括第一表达框、第二表达框以及第三表达框，第一表达框中含有在非转录因子结合区域插入NCS序列的第一启动子，用于基因表达的激活，第二表达框中含有第二启动子以及位于基因起始密码子之后的NCS序列，用于基因表达的抑制，第三表达框中设置有dCas蛋白突变体以及用于靶向NCS序列的sgRNA。该系统可以同时靶向工程化的启动子，从而产生激活和抑制的效果，利用2个sgRNA同时产生对4个或者更多个基因的调控。

公开(公告)号：CN110734899A

公开(公告)日：2020-01-31

申请号：CN201911056382.9

申请日：2019-10-31

申请人： 江南大学

发明人： 饶志明 ,  段培枫 ,  张佳宁 ,  张显 ,  杨套伟 ,  徐美娟 ,  邵明龙 ,  刘雨 ,  王紫薇 ,  陈妍 ,  陈奇

IPC分类号： C12N9/10 ,  C12N15/54 ,  C12N15/77 ,  C12N1/21 ,  C12R1/15

摘要： 本发明涉及一种酶活提高的蔗糖磷酸化酶突变体及其构建方法和应用，属于基因工程技术领域。本发明所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明所述突变体是在肠膜明串珠菌来源的蔗糖磷酸化酶的基础上，进行定点突变实现蔗糖磷酸化酶酶活的提高的，将突变体在谷氨酸棒杆菌中表达，并用作全细胞催化剂生产2-O-α-D-甘油葡糖苷，在5L发酵罐水平，实现短时间内高效生产大量的2-O-α-D-甘油葡糖苷，这有利于扩大蔗糖磷酸化酶生产2-O-α-D-甘油葡糖苷工业化应用前景，实现大规模工业化应用。

公开(公告)号：CN110791494B

公开(公告)日：2020-12-22

申请号：CN201911191601.4

申请日：2019-11-28

申请人： 江南大学

发明人： 饶志明 ,  王雅玲 ,  陈佳敏 ,  杨套伟 ,  徐美娟 ,  张显 ,  邵明龙 ,  张佳宁 ,  彭安褀 ,  徐淑萍 ,  吴美琪

IPC分类号： C12N9/88 ,  C12N15/60 ,  C12N15/70 ,  C12N1/21 ,  C12P13/04 ,  C12R1/19

摘要： 本发明提供了一种天冬氨酸酶突变体、包含天冬氨酸酶突变体的重组表达载体和重组菌及应用，属于基因工程技术领域；所述天冬氨酸酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。本发明的天冬氨酸酶突变体是在天冬氨酸酶(氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示)的基础上，将第427位谷氨酸突变成了谷氨酰胺。本发明通过将天冬氨酸酶的第427位氨基酸残基突变成谷氨酰胺，改变了活性位点附近的极性环境，更有利于底物反应时的氨供给，从而提高酶活，加强了该酶合成β‑氨基酸的能力，为其工业化生产提供了一种实际有效策略。

公开(公告)号：CN117778444A

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202311853804.1

申请日：2023-12-29

申请人： 江南大学

发明人： 刘延峰 ,  堵国成 ,  陈坚 ,  刘龙 ,  吕雪芹 ,  张佳宁

IPC分类号： C12N15/81 ,  C12N15/65 ,  C12N1/19 ,  C12Q1/6897 ,  C12R1/865

摘要： 本发明涉及一种在酿酒酵母中报告双荧光的表达载体及其应用，涉及分子生物学技术领域。本发明构建了一个表达载体，包含两个反向的目的基因表达框，其中第一目的基因表达框含有第一启动子、绿色荧光蛋白基因编码序列和第一终止子，第二目的基因表达框含有第二启动子、红色荧光蛋白基因编码序列和第二终止子。该表达载体能够应用于表征不同强度的基因表达调控元件，降低了酿酒酵母荧光蛋白检测的高本底效应，鲁棒性强，表达稳定。

公开(公告)号：CN117778442A

公开(公告)日：2024-03-29

申请号：CN202311834611.1

申请日：2023-12-28

申请人： 江南大学

发明人： 刘延峰 ,  陈坚 ,  张佳宁 ,  堵国成 ,  刘龙 ,  吕雪芹

IPC分类号： C12N15/81 ,  C12N15/113 ,  C12N15/55 ,  C12N1/19 ,  C12R1/865

摘要： 本发明公开了一种可同时实现CRISPR激活和CRISPR干扰的表达系统及其应用，其中，表达系统包括第一表达框、第二表达框以及第三表达框，第一表达框中含有在非转录因子结合区域插入NCS序列的第一启动子，用于基因表达的激活，第二表达框中含有第二启动子以及位于基因起始密码子之后的NCS序列，用于基因表达的抑制，第三表达框中设置有dCas蛋白突变体以及用于靶向NCS序列的sgRNA。该系统可以同时靶向工程化的启动子，从而产生激活和抑制的效果，利用2个sgRNA同时产生对4个或者更多个基因的调控。

公开(公告)号：CN110734899B

公开(公告)日：2021-06-18

申请号：CN201911056382.9

申请日：2019-10-31

申请人： 江南大学

发明人： 饶志明 ,  段培枫 ,  张佳宁 ,  张显 ,  杨套伟 ,  徐美娟 ,  邵明龙 ,  刘雨 ,  王紫薇 ,  陈妍 ,  陈奇

IPC分类号： C12N9/10 ,  C12N15/54 ,  C12N15/77 ,  C12N1/21 ,  C12R1/15

摘要： 本发明涉及一种酶活提高的蔗糖磷酸化酶突变体及其构建方法和应用，属于基因工程技术领域。本发明所述突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明所述突变体是在肠膜明串珠菌来源的蔗糖磷酸化酶的基础上，进行定点突变实现蔗糖磷酸化酶酶活的提高的，将突变体在谷氨酸棒杆菌中表达，并用作全细胞催化剂生产2‑O‑α‑D‑甘油葡糖苷，在5L发酵罐水平，实现短时间内高效生产大量的2‑O‑α‑D‑甘油葡糖苷，这有利于扩大蔗糖磷酸化酶生产2‑O‑α‑D‑甘油葡糖苷工业化应用前景，实现大规模工业化应用。

公开(公告)号：CN110791494A

公开(公告)日：2020-02-14

申请号：CN201911191601.4

申请日：2019-11-28

申请人： 江南大学

发明人： 饶志明 ,  王雅玲 ,  陈佳敏 ,  杨套伟 ,  徐美娟 ,  张显 ,  邵明龙 ,  张佳宁 ,  彭安褀 ,  徐淑萍 ,  吴美琪

IPC分类号： C12N9/88 ,  C12N15/60 ,  C12N15/70 ,  C12N1/21 ,  C12P13/04 ,  C12R1/19

摘要： 本发明提供了一种天冬氨酸酶突变体、包含天冬氨酸酶突变体的重组表达载体和重组菌及应用，属于基因工程技术领域；所述天冬氨酸酶突变体的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。本发明的天冬氨酸酶突变体是在天冬氨酸酶(氨基酸序列如SEQ ID NO：3所示)的基础上，将第427位谷氨酸突变成了谷氨酰胺。本发明通过将天冬氨酸酶的第427位氨基酸残基突变成谷氨酰胺，改变了活性位点附近的极性环境，更有利于底物反应时的氨供给，从而提高酶活，加强了该酶合成β-氨基酸的能力，为其工业化生产提供了一种实际有效策略。