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公开(公告)号：CN107208118A
公开(公告)日：2017-09-26
申请号：CN201580062513.8
申请日：2015-09-18
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： 普里蒂·法克雅 , 安东尼·P·博加德 , 埃里克·罗兰·努涅斯万那米
CPC classification number: C12N15/52 , C12N9/1205 , C12N9/88 , C12P5/026 , C12P7/04 , C12P7/18 , C12P7/40 , C12P7/42 , C12Y207/0104 , C12Y401/02009 , C12Y401/02022 , Y02E50/343 , C12P7/16
Abstract: 本发明提供了含有用于通过乙酰辅酶A或通过草酰乙酸和乙酰辅酶A提高碳通量的酶途径和/或代谢修饰的非天然微生物。本发明的实施例包括微生物，该微生物具有包含磷酸转酮酶的、获得乙酰辅酶A和草酰乙酸的途径(PK途径)。该微生物还具有(i)增强非磷酸转移酶(非PTS)系统的糖摄取活性的基因修饰，和/或(ii)在微生物的电子传递链(ETC)中的提高ATP生产效率的提高了还原当量可利用性的基因修饰，或两者兼有。所述微生物可以可选地包括(iii)维持、减弱或消除磷酸转移酶系统(PTS)的糖摄取活性的基因修饰。通过乙酰辅酶A和草酰乙酸而提高的碳通量，可用于生产生物衍生化合物，并且微生物可以进一步包括能够生产生物衍生化合物的途径。
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公开(公告)号：CN106191132A
公开(公告)日：2016-12-07
申请号：CN201610552260.9
申请日：2012-02-02
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： M·J·伯克 , A·P·博加德 , 孙军 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 普里蒂·法克雅
CPC classification number: C12P5/02 , C07C1/24 , C07C2521/04 , C07C2521/12 , C07C2521/16 , C07C2523/10 , C07C2523/28 , C07C2523/31 , C07C2523/745 , C07C2527/167 , C07C2527/173 , C12N15/52 , C12P5/026 , C12P7/04 , Y02E50/343 , C07C11/167 , C12N9/0004 , C12N9/0006 , C12N9/001 , C12N9/1029 , C12N9/16 , C12N9/88 , C12Y101/01036 , C12Y103/01008 , C12Y103/08006 , C12Y103/99032 , C12Y203/01009 , C12Y401/0107 , C12Y402/01055 , C12Y402/0112 , C12Y403/01014
Abstract: 本发明提供了具有丁二烯途径的非天然存在的微生物。本发明还提供使用这种生物来生产丁二烯的方法。在一些方面，本文中披露的实施方式涉及用于生产丁二烯的方法，包括(a)在足够量的营养物质和培养基中通过发酵培养产生巴豆醇的非天然存在的微生物；以及(b)将通过培养该非天然存在的微生物所产生的巴豆醇转化为丁二烯。
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公开(公告)号：CN103459602A
公开(公告)日：2013-12-18
申请号：CN201280016837.4
申请日：2012-02-02
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： M·J·伯克 , A·P·博加德 , 孙军 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 普里蒂·法克雅
IPC: C12P5/02
CPC classification number: C12P5/02 , C07C1/24 , C07C2521/04 , C07C2521/12 , C07C2521/16 , C07C2523/10 , C07C2523/28 , C07C2523/31 , C07C2523/745 , C07C2527/167 , C07C2527/173 , C12N15/52 , C12P5/026 , C12P7/04 , Y02E50/343 , C07C11/167
Abstract: 本发明提供了具有丁二烯途径的非天然存在的微生物。本发明还提供使用这种生物来生产丁二烯的方法。在一些方面，本文中披露的实施方式涉及用于生产丁二烯的方法，包括（a）在足够量的营养物质和培养基中通过发酵培养产生巴豆醇的非天然存在的微生物；以及（b）将通过培养该非天然存在的微生物所产生的巴豆醇转化为丁二烯。
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公开(公告)号：CN102066551B
公开(公告)日：2013-10-09
申请号：CN200980119404.X
申请日：2009-03-27
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： A·P·博加德 , 普里蒂·法克雅 , 罗宾·E·奥斯特豪特
CPC classification number: C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/001 , C12N9/1029 , C12N9/1096 , C12N9/80 , C12N9/88 , C12P7/44 , C12P7/46 , C12P7/62 , C12P13/001 , C12P13/005 , C12P13/02 , C12P17/10 , C12Y101/01035 , C12Y102/0101 , C12Y103/01031 , C12Y206/01 , C12Y402/01
Abstract: 本发明提供了一种非天然存在的微生物生物体，其具有己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径。所述微生物生物体含有至少一种编码己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径中各自的酶的外源性核酸。本发明另外提供了产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的方法。该方法可以包括在产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的条件下和足以产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的时间内培养产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的微生物生物体，其中所述微生物生物体以足以产生各自产物的量表达至少一种编码己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径酶的外源性核酸。
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公开(公告)号：CN102066551A
公开(公告)日：2011-05-18
申请号：CN200980119404.X
申请日：2009-03-27
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： A·P·博加德 , 普里蒂·法克雅 , 罗宾·E·奥斯特豪特
CPC classification number: C12N15/52 , C12N9/0006 , C12N9/0008 , C12N9/001 , C12N9/1029 , C12N9/1096 , C12N9/80 , C12N9/88 , C12P7/44 , C12P7/46 , C12P7/62 , C12P13/001 , C12P13/005 , C12P13/02 , C12P17/10 , C12Y101/01035 , C12Y102/0101 , C12Y103/01031 , C12Y206/01 , C12Y402/01
Abstract: 本发明提供了一种非天然存在的微生物生物体，其具有己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径。所述微生物生物体含有至少一种编码己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径中各自的酶的外源性核酸。本发明另外提供了产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的方法。该方法可以包括在产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的条件下和足以产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的时间内培养产生己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺的微生物生物体，其中所述微生物生物体以足以产生各自产物的量表达至少一种编码己二酸、6-氨基己酸或己内酰胺途径酶的外源性核酸。
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公开(公告)号：CN118879602A
公开(公告)日：2024-11-01
申请号：CN202410991976.3
申请日：2014-12-23
Applicant: 基因组股份公司
IPC: C12N1/21 , C12P7/625 , C12P7/62 , C12P7/18 , C12P7/42 , C12P5/02 , C12P17/10 , C12P7/40 , C12P7/04 , C12P13/00 , C12P7/16 , C12R1/19
Abstract: 本发明关于具有增加的碳通量效率的方法和生物，涉及一种非天然存在的微生物，其包括琥珀酰基‑CoA合成酶或转移酶的第一衰减以及琥珀酰基‑CoA转化酶或编码在具有琥珀酰基‑CoA到琥珀酸的净转化的多步骤途径之内的产琥珀酸酶的基因的至少第二衰减。
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公开(公告)号：CN115322261A
公开(公告)日：2022-11-11
申请号：CN202211008808.5
申请日：2016-10-27
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 本申请记载了融合蛋白，所述融合蛋白包括甲醇脱氢酶(MeDH)和至少一种其他多肽，所述至少一种其他多肽例如3‑己酮糖‑6‑磷酸脱氢酶(HPS)或6‑磷酸‑3‑己酮糖异构酶(PHI)，所述6‑磷酸‑3‑己酮糖异构酶例如DHAS合成酶或果糖‑6‑磷酸醛缩酶或例如DHA合成酶或DHA激酶。该融合蛋白可以以局部方式促进甲醇转化为甲醛，然后转化为磷酸酮糖如己酮糖‑6‑磷酸，或然后转化为DHA和G3P。当在细胞中表达时，融合蛋白可以促进甲醇吸收并快速转化为磷酸酮糖或转化为DHA和D3P，其又可用于生产期望的生物产品的途径中。有利的是，快速转化为磷酸酮糖或DHA和G3P可以避免细胞中的甲醛不良积累。本申请还记载了表达该融合蛋白的工程细胞，其可选地包括一种或多种额外的代谢途径转基因、甲醇代谢途径基因、目标产物途径基因、包括所述细胞的细胞培养物组合物、用于提高细胞产生所述目标产物或其中间体的方法、包括所述目标产物或其中间体的组合物，和从所述目标产物或其中间体制得的产物。
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公开(公告)号：CN111705028A
公开(公告)日：2020-09-25
申请号：CN202010532775.9
申请日：2013-06-03
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： 普里蒂·法克雅 , A·P·博加德 , S·J·万殿 , 罗宾·E·奥斯特豪特 , 约翰·D·特拉威克 , 迈克尔·P·库钦斯卡斯 , 布莱恩·斯蒂尔 , M·J·伯克
Abstract: 本发明提供具有4-羟基丁酸酯、1,4-丁二醇或其它产物途径且能够产生4-羟基丁酸酯、1,4-丁二醇或其它产物的非天然微生物，其中所述微生物包含一或多种遗传修饰。本发明另外提供使用所述微生物产生4-羟基丁酸酯、1,4-丁二醇或其它产物或相关产物的方法。
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