一种判断古DNA样本种族归属的方法

    公开(公告)号:CN115161403A

    公开(公告)日:2022-10-11

    申请号:CN202210564617.0

    申请日:2022-05-23

    Inventor: 夏薇 张治洲

    Abstract: 本发明提供一种基于语言基因多态性SNPs标记的古DNA种族确定方法;通过提取古代样本中的古DNA,对古DNA直接建库并实施全基因组高通量测序,从所测序列中收集13个语言基因(FOXP1,FOXP2,CNTNAP2,RBFOX2,TPK1,DCDC2,KIAA0319,TM4SF20,FLNC,ATP2C2,ROBO1,ROBO2,CMIP,DYX1C1,NFXL1)的147个单核苷酸多态性位点信息,对这些位点信息数字化表征并与一组对照序列做主成分分析(PCA),继而确定古DNA样本是否属于赫哲族或鄂伦春族。

    一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌的酶切方法

    公开(公告)号:CN108949901B

    公开(公告)日:2022-07-15

    申请号:CN201810929537.4

    申请日:2018-08-15

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法,该方法包含以下步骤:(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对,找出各属的代表性序列2‑4个;(2)各属代表性序列的酶切分析,从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种;(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的,比起常规测序鉴定节省大量时间。

    一种定量检测窖泥中甲烷菌含量的方法

    公开(公告)号:CN109251989A

    公开(公告)日:2019-01-22

    申请号:CN201811403485.3

    申请日:2018-11-23

    CPC classification number: C12Q1/689 C12Q1/686 C12Q2600/156 C12Q2545/114

    Abstract: 本发明属于生物技术及食品发酵领域,是一种涉及利用特异性引物定量检测浓香型白酒窖泥中甲烷菌的方法,本发明针对目标甲烷菌在某个分类层面(门纲目科属种六个分类层面均可以)上16S rDNA的特异性,设计出目标甲烷菌的特异性引物。该方法包含以下步骤:(1)目标甲烷菌特异性引物的设计;(2)不同窖泥样本的采集及其宏基因组提取;(3)利用目标甲烷菌特异性引物对上述基因组样本进行QPCR(quantitative polymerase chain reaction)扩增来定量检测不同浓香型白酒窖泥样本中甲烷菌的含量。本发明基于目标甲烷菌16S rDNA的特异性SNP(single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)和SAP(simple allele discriminating PCR)技术设计属特异性PCR(polymerase chain reaction)引物的方法,提供了一种可行的从复杂菌群中利用特异性引物检测甲烷菌的分子生物学方法。

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