公开(公告)号：CN118918962A

公开(公告)日：2024-11-08

申请号：CN202411032469.3

申请日：2024-07-30

申请人： 哈尔滨工业大学

发明人： 蒋庆华 ,  丁倩 ,  许召春 ,  王平平 ,  蔡一灯 ,  杨文艺 ,  薛广富 ,  阙锦昊

IPC分类号： G16B40/00 ,  G16B20/00 ,  G16B25/00 ,  G16B15/00 ,  G06F18/2132 ,  G06F18/2136 ,  G06F18/211 ,  G06F18/23 ,  G06N5/04

摘要： 本发明涉及生物信息学领域，具体公开了一种基于单细胞转录组数据的细胞间通讯推断方法，包括步骤：单细胞数据预处理；基于矩阵分解的联合学习模型；识别基因表达模式及细胞亚群；细胞间通讯的推断统计模型的构建。基于本发明模型能够有效地探索基因的表达模式，并进一步揭示细胞的身份和功能；结合细胞间和细胞内的相关通讯信号，提出了识别细胞间通讯的推断统计模型。本发明克服了连接细胞内外的通讯途径难以预测的问题，通过对细胞内部状态和相互关系的深入理解，提高了细胞间通讯网络推断的性能，有助于更全面地理解潜在的生物过程。

公开(公告)号：CN118711671A

公开(公告)日：2024-09-27

申请号：CN202410747250.5

申请日：2024-06-11

申请人： 哈尔滨工业大学

发明人： 蒋庆华 ,  杨文艺 ,  许召春 ,  蔡一灯 ,  薛广富 ,  阙锦昊

IPC分类号： G16B40/00 ,  G16B5/00 ,  G16B20/00 ,  G16B20/20 ,  G16B25/10 ,  G06N3/042 ,  G06N3/045 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/08

摘要： 本发明公开了一种针对空间转录组数据的细胞间通讯智能识别方法，方法包括：对单细胞转录组和空间转录组数据进行预处理；利用注意力机制探索组学数据中存在的深层联系，整合单细胞转录组和空间转录组数据；通过基于子图的机制，挖掘每个细胞的局域特征和全局特征；结合图注意力神经网络，提出在单细胞分辨率上识别细胞间通讯的智能算法。本发明克服了单细胞转录组和空间转录组数据的局限性，解决了细胞间通讯的精准识别和解析问题，有助于更全面地揭示细胞之间的协同调控，进一步加深对复杂生物过程的理解。