一种福尔马林固定组织非靶标代谢组学研究的样品前处理方法

    公开(公告)号:CN105424429A

    公开(公告)日:2016-03-23

    申请号:CN201510741890.6

    申请日:2015-11-04

    CPC classification number: G01N1/28

    Abstract: 本发明公开了一种福尔马林固定组织非靶标代谢组学研究的样品前处理方法。采用本发明的方法能够直接使用福尔马林固定组织,以UPLC-Q-TOF MSMS为分析平台进行组织代谢组学分析研究,解决了组织样本采集和保存中遇到的难题,方法简单快速。此外,采用本发明方法能同时提取组织中的极性和非极性物质,可以检测到更多的组织中的代谢产物,更有利于全面的观察组织代谢或病理的变化,同时发现更可靠的差异代谢产物及生物标志物,从而推动组织非靶标代谢组学的进展,并且有助于后期生物标志物的验证及相应检测试剂盒的开发。

    一种福尔马林固定组织非靶标代谢组学研究的样品前处理方法

    公开(公告)号:CN105424429B

    公开(公告)日:2018-03-06

    申请号:CN201510741890.6

    申请日:2015-11-04

    Abstract: 本发明公开了一种福尔马林固定组织非靶标代谢组学研究的样品前处理方法。采用本发明的方法能够直接使用福尔马林固定组织,以UPLC‑Q‑TOF MSMS为分析平台进行组织代谢组学分析研究,解决了组织样本采集和保存中遇到的难题,方法简单快速。此外,采用本发明方法能同时提取组织中的极性和非极性物质,可以检测到更多的组织中的代谢产物,更有利于全面的观察组织代谢或病理的变化,同时发现更可靠的差异代谢产物及生物标志物,从而推动组织非靶标代谢组学的进展,并且有助于后期生物标志物的验证及相应检测试剂盒的开发。

    中国北方大肠癌患者hMSH2基因的新突变及其用途

    公开(公告)号:CN102634521A

    公开(公告)日:2012-08-15

    申请号:CN201210057687.3

    申请日:2012-03-07

    Abstract: 本发明公开了中国北方大肠癌患者hMSH2基因的新突变及其用途,它涉及中国北方Lynch syndrome大肠癌患者的hMSH2基因的一种新的突变类型。本发明在1/14例Lynch syndrome大肠癌患者中发现一种新的突变,即:在GeneBank登录号为NM_0002511所示的序列基础上发生以下突变:在c.1127后插入7个碱基AACAACA并在c.1129后缺失三个碱基AAG。本发明在已报道hMSH2基因突变基础上更丰富了hMSH2基因在大肠癌患者中的突变谱。为大肠癌患者的分子诊断和治疗提供了理论基础。

    一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒

    公开(公告)号:CN114908166B

    公开(公告)日:2025-04-22

    申请号:CN202210459156.0

    申请日:2022-04-27

    Abstract: 本发明公开了一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒。所述的甲基化标志物为位于B3GALNT1、C6orf97、FAM72A、FAM72B、LIFR、OSMR、ZNF264及ZNF543基因上的15个目标CpG位点。该15个CpG位点相比于其他类型的癌症组织在结直肠癌组织中呈现特异性高甲基化状态。本发明首次在结直肠癌血浆cfDNA中检测了其中10个CpG位点的甲基化水平,通过优化引物、探针及反应体系,建立了三个多重数字PCR检测体系,该检测方法的检测灵敏度明显优于常规MethyLight检测方法,检测下限可达到0.032%。多重数字PCR通过计算每毫升血浆中的甲基化分子拷贝数对该7个扩增片段的甲基化水平进行定性和定量,结果表明其具有成为结直肠癌无创诊断标志物的潜力,同时具有一定的识别结直肠腺瘤及区分其他肿瘤患者的能力。

    一组用于结直肠癌诊断的血液多金属离子组合及其应用

    公开(公告)号:CN117169320A

    公开(公告)日:2023-12-05

    申请号:CN202310989412.1

    申请日:2023-08-07

    Abstract: 本发明公开了一种用于诊断结直肠癌的外周血多金属离子诊断组合及其应用。所述的多金属离子诊断组合由钛(Titanium,Ti)、铅(Lead,Pb)、钒(Vanadium,V)、铬(Chromium,Cr)和砷(Arsenic,AS)组成。本发明通过电感耦合等离子体技术与质谱技术,检测结直肠癌患者和正常对照人群外周血中的金属离子水平,筛选差异金属离子;通过机器学习算法建模分析,筛选出结直肠癌的多金属离子诊断组合;通过在不同地区病例对照人群血浆中验证,评价多金属离子诊断组合对结直肠癌的诊断能力。基于筛选的外周血多金属离子诊断组合,建立了可用于结直肠癌诊断的快速的、灵敏的、特异的标准方法体系,为大规模人群筛检及临床诊断结直肠癌提供了技术手段。

    一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒

    公开(公告)号:CN114908166A

    公开(公告)日:2022-08-16

    申请号:CN202210459156.0

    申请日:2022-04-27

    Abstract: 本发明公开了一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒。所述的甲基化标志物为位于B3GALNT1、C6orf97、FAM72A、FAM72B、LIFR、OSMR、ZNF264及ZNF543基因上的15个目标CpG位点。该15个CpG位点相比于其他类型的癌症组织在结直肠癌组织中呈现特异性高甲基化状态。本发明首次在结直肠癌血浆cfDNA中检测了其中10个CpG位点的甲基化水平,通过优化引物、探针及反应体系,建立了三个多重数字PCR检测体系,该检测方法的检测灵敏度明显优于常规MethyLight检测方法,检测下限可达到0.032%。多重数字PCR通过计算每毫升血浆中的甲基化分子拷贝数对该7个扩增片段的甲基化水平进行定性和定量,结果表明其具有成为结直肠癌无创诊断标志物的潜力,同时具有一定的识别结直肠腺瘤及区分其他肿瘤患者的能力。

    结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒

    公开(公告)号:CN112430657A

    公开(公告)日:2021-03-02

    申请号:CN202011165628.9

    申请日:2020-10-27

    Abstract: 本发明公开了一种结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒。所述的甲基化标志物为分布在ZNF304,LIFR及C20orf194基因上的10个CpG位点。本发明首次在血液和组织DNA中检测了C20orf194、ZNF304、LIFR基因的甲基化水平,并首次使用qMSP以及数字PCR和MethyLight相结合的检测方法,通过优化PCR引物和探针,优化反应体系和反应条件,成功建立了基于qMSP以及ddPCR技术检测人ZNF304、LIFR基因甲基化的检测方法,和已有的基于qPCR技术的人SEPT 9基因甲基化检测方法相比,本发明的检测方法具有更高的特异性。ddPCR方法通过计算甲基化阳性液滴数和甲基化阳性液滴及非甲基化阳性液滴的比值进而对结直肠癌患者ZNF304、LIFR基因甲基化进行定性和定量检测,从而实现对结直肠癌的辅助诊断。

    结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒

    公开(公告)号:CN112430657B

    公开(公告)日:2022-09-09

    申请号:CN202011165628.9

    申请日:2020-10-27

    Abstract: 本发明公开了一种结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒。所述的甲基化标志物为分布在ZNF304,LIFR及C20orf194基因上的10个CpG位点。本发明首次在血液和组织DNA中检测了C20orf194、ZNF304、LIFR基因的甲基化水平,并首次使用qMSP以及数字PCR和MethyLight相结合的检测方法,通过优化PCR引物和探针,优化反应体系和反应条件,成功建立了基于qMSP以及ddPCR技术检测人ZNF304、LIFR基因甲基化的检测方法,和已有的基于qPCR技术的人SEPT 9基因甲基化检测方法相比,本发明的检测方法具有更高的特异性。ddPCR方法通过计算甲基化阳性液滴数和甲基化阳性液滴及非甲基化阳性液滴的比值进而对结直肠癌患者ZNF304、LIFR基因甲基化进行定性和定量检测,从而实现对结直肠癌的辅助诊断。

    一种用于早期筛检大肠癌相关IGF2基因甲基化表型的引物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN105543379B

    公开(公告)日:2019-02-19

    申请号:CN201610056369.3

    申请日:2016-01-27

    Abstract: 本发明公开了一种用于早期筛检大肠癌相关IGF2基因甲基化表型的引物、试剂盒及其应用,属于疾病的早期筛检与防治领域。所述引物通过MS‑HRM方法检测IGF2基因启动子区CpG岛的甲基化表型,其中正向引物具有如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,反向引物具有如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。研究表明,采用该引物对待测硫化后的DNA进行MS‑HRM分析,可以判断待检样品是否为人大肠癌高危人群。进一步的,本发明还提出了包含上述引物的试剂盒。采用本发明的引物或试剂盒筛检大肠癌,具有高通量、灵敏度高和特异性好等特点,能够在人外周血白细胞DNA水平上实现便捷快速地筛检大肠癌高危人群。

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