结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒

    公开(公告)号:CN112430657B

    公开(公告)日:2022-09-09

    申请号:CN202011165628.9

    申请日:2020-10-27

    Abstract: 本发明公开了一种结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒。所述的甲基化标志物为分布在ZNF304,LIFR及C20orf194基因上的10个CpG位点。本发明首次在血液和组织DNA中检测了C20orf194、ZNF304、LIFR基因的甲基化水平,并首次使用qMSP以及数字PCR和MethyLight相结合的检测方法,通过优化PCR引物和探针,优化反应体系和反应条件,成功建立了基于qMSP以及ddPCR技术检测人ZNF304、LIFR基因甲基化的检测方法,和已有的基于qPCR技术的人SEPT 9基因甲基化检测方法相比,本发明的检测方法具有更高的特异性。ddPCR方法通过计算甲基化阳性液滴数和甲基化阳性液滴及非甲基化阳性液滴的比值进而对结直肠癌患者ZNF304、LIFR基因甲基化进行定性和定量检测,从而实现对结直肠癌的辅助诊断。

    一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒

    公开(公告)号:CN114908166B

    公开(公告)日:2025-04-22

    申请号:CN202210459156.0

    申请日:2022-04-27

    Abstract: 本发明公开了一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒。所述的甲基化标志物为位于B3GALNT1、C6orf97、FAM72A、FAM72B、LIFR、OSMR、ZNF264及ZNF543基因上的15个目标CpG位点。该15个CpG位点相比于其他类型的癌症组织在结直肠癌组织中呈现特异性高甲基化状态。本发明首次在结直肠癌血浆cfDNA中检测了其中10个CpG位点的甲基化水平,通过优化引物、探针及反应体系,建立了三个多重数字PCR检测体系,该检测方法的检测灵敏度明显优于常规MethyLight检测方法,检测下限可达到0.032%。多重数字PCR通过计算每毫升血浆中的甲基化分子拷贝数对该7个扩增片段的甲基化水平进行定性和定量,结果表明其具有成为结直肠癌无创诊断标志物的潜力,同时具有一定的识别结直肠腺瘤及区分其他肿瘤患者的能力。

    一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒

    公开(公告)号:CN114908166A

    公开(公告)日:2022-08-16

    申请号:CN202210459156.0

    申请日:2022-04-27

    Abstract: 本发明公开了一组与结直肠癌相关的特异性甲基化标志物及其检测试剂盒。所述的甲基化标志物为位于B3GALNT1、C6orf97、FAM72A、FAM72B、LIFR、OSMR、ZNF264及ZNF543基因上的15个目标CpG位点。该15个CpG位点相比于其他类型的癌症组织在结直肠癌组织中呈现特异性高甲基化状态。本发明首次在结直肠癌血浆cfDNA中检测了其中10个CpG位点的甲基化水平,通过优化引物、探针及反应体系,建立了三个多重数字PCR检测体系,该检测方法的检测灵敏度明显优于常规MethyLight检测方法,检测下限可达到0.032%。多重数字PCR通过计算每毫升血浆中的甲基化分子拷贝数对该7个扩增片段的甲基化水平进行定性和定量,结果表明其具有成为结直肠癌无创诊断标志物的潜力,同时具有一定的识别结直肠腺瘤及区分其他肿瘤患者的能力。

    结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒

    公开(公告)号:CN112430657A

    公开(公告)日:2021-03-02

    申请号:CN202011165628.9

    申请日:2020-10-27

    Abstract: 本发明公开了一种结直肠癌相关的甲基化标志物以及用于检测结直肠癌的试剂盒。所述的甲基化标志物为分布在ZNF304,LIFR及C20orf194基因上的10个CpG位点。本发明首次在血液和组织DNA中检测了C20orf194、ZNF304、LIFR基因的甲基化水平,并首次使用qMSP以及数字PCR和MethyLight相结合的检测方法,通过优化PCR引物和探针,优化反应体系和反应条件,成功建立了基于qMSP以及ddPCR技术检测人ZNF304、LIFR基因甲基化的检测方法,和已有的基于qPCR技术的人SEPT 9基因甲基化检测方法相比,本发明的检测方法具有更高的特异性。ddPCR方法通过计算甲基化阳性液滴数和甲基化阳性液滴及非甲基化阳性液滴的比值进而对结直肠癌患者ZNF304、LIFR基因甲基化进行定性和定量检测,从而实现对结直肠癌的辅助诊断。

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