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公开(公告)号:CN116030883A
公开(公告)日:2023-04-28
申请号:CN202111253270.X
申请日:2021-10-27
Applicant: 华为云计算技术有限公司 , 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请实施例提供了一种蛋白质结构预测方法、装置、设备及存储介质。该方法包括:对于待预测的蛋白质,在基于该蛋白质的氨基酸序列获取到多个多序列比对结果之后,利用蛋白质结构预测模型,得到与该多个多序列比对结果一一对应的多个结构信息,从中挑选出符合目标条件的结构信息。其中,多序列比对结果指示该氨基酸序列的多个同源氨基酸序列,由于同源的两个氨基酸序列对应的蛋白质的空间结构往往是接近的,因此根据多序列比对结果能够较为准确地预测出该蛋白质的空间结构。另外,上述方法利用了蛋白质结构预测模型的泛化能力,将蛋白质对应的多个多序列比对结果都参与到蛋白质结构的预测过程中,从而有效提高了蛋白质结构预测的准确率和效率。
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公开(公告)号:CN118571308A
公开(公告)日:2024-08-30
申请号:CN202310436968.8
申请日:2023-04-21
Applicant: 华为云计算技术有限公司 , 北京大学
Abstract: 本申请实施例提供了一种基于元动力学的靶点发现方法及相关装置,应用于生物、医药、药物设计领域。该方法包括:对配体结构和受体结构进行动力学模拟,使得配体结构在动力学模拟过程中遍历受体结构表面;确定配体结构在受体结构表面的各个结合位点的目标信息;根据各个结合位点的目标信息的排序输出确定受体结构的口袋信息。在这个过程中,通过一次遍历就可以获得多个结合位点,能够使得受体构象搜索的范围更广,并减小了计算量,提高了结合位点的发现效率。
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公开(公告)号:CN118629538A
公开(公告)日:2024-09-10
申请号:CN202310200273.X
申请日:2023-03-03
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16C20/50
Abstract: 本公开的实施例提供了用于药物设计的方法、装置、设备、介质和程序产品。用于药物设计的方法包括获取表示蛋白质三维结构的蛋白质数据和表示待与蛋白质三维结构结合的初始分子的初始分子数据。该方法还包括:基于蛋白质数据和初始分子数据,确定表示初始分子中的第一分子片段的第一分子片段数据。该方法还包括:基于第一分子片段数据和初始分子数据,生成表示目标分子的目标分子数据。通过本公开的实施例,针对蛋白质三维结构,通过在初始分子中自动确定的分子片段并基于所确定的分子片段来优化初始分子,可以有针对性地实现对药物分子的片段式人工智能优化,从而降低药物发现的时间和人力成本。
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公开(公告)号:CN115620902A
公开(公告)日:2023-01-17
申请号:CN202210028933.6
申请日:2022-01-11
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16H50/30 , G16H50/20 , G16H50/50 , G06F18/214 , G06F18/24 , G06N3/0499 , G06N3/08
Abstract: 本申请公开了一种预测生存风险率(hazard ratio,HR)的方法及装置,涉及人工智能技术领域。该方法包括:获取待预测样本的数据。将待预测样本的数据输入至预设模型,通过预设模型对待预测样本的数据进行处理,得到用于表示该待预测样本的生存风险的生存风险率HR。其中,该预设模型包括门控网络和多个专家网络,该门控网络用于根据待预测样本的数据确定每个专家网络对应的权重系数,生存风险率为根据每个专家网络对应的权重系数对多个专家网络的输出值加权求和获得的结果。
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公开(公告)号:CN114664391A
公开(公告)日:2022-06-24
申请号:CN202011538932.3
申请日:2020-12-23
Applicant: 华为云计算技术有限公司
Abstract: 本申请实施例公开了一种分子特征确定的方法、相关装置以及设备,用于提升所确定的分子特征的准确度。本申请实施例方法中,先获取目标分子图,再基于目标分子图,获取N个节点特征以及M个边特征,且N和M均为大于1的整数,进一步地利用经过预训练的分子表征模型对N个节点特征以及M个边特征进行处理,得到目标分子特征,经过预训练的分子表征模型包括编码器和解码器,在预训练分子表征模型时,编码器用于对训练分子图的特征进行编码,解码器用于将编码器的编码结果重建为简化分子线性输入规范SMILES表达式,编码器和解码器的参数被迭代调整。
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公开(公告)号:CN117253544A
公开(公告)日:2023-12-19
申请号:CN202210645440.7
申请日:2022-06-08
Applicant: 华为云计算技术有限公司
Abstract: 本申请涉及人工智能的生物医药应用领域,尤其涉及一种噬菌体宿主预测方法、装置及存储介质。所述方法包括:获取目标基因组,目标基因组包括目标噬菌体的基因组和目标细菌的基因组;根据目标基因组进行基因的注释得到基因组序列,基因组序列包括目标噬菌体吸附并裂解目标细菌的生命过程中的至少一个基因序列;根据基因组序列进行噬菌体宿主预测得到预测结果,预测结果指示目标噬菌体与目标细菌之间的相互作用情况。由于基因的注释在噬菌体吸附并裂解细菌中起到非常重要的作用,且是特异性的,因此本申请实施例通过对目标噬菌体和目标细菌的基因组进行基因的注释并作为输入参数来进行噬菌体宿主预测,保证了噬菌体宿主预测的准确性和高效性。
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公开(公告)号:CN117174185A
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202211019436.6
申请日:2022-08-24
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16C10/00 , G16C20/50 , G06N3/08 , G06N3/0464
Abstract: 本申请提供了人工智能领域一种分子优化方法以及装置,基于伊辛模型来构造目标函数,并使用量子退火算法来进行求解,从而可以高效准确地求解得到最优的分子结构。该方法包括:首先,获取第一数据集合和属性集合,该第一数据集合中包括多组数据,该多组数据可以用于表示多种分子结构,每组数据可以表示至少一种分子结构,属性集合中包括表示多种分子结构的属性的值,每组数据具有对应的至少一种分子属性,如分子的韧性、毒性或者溶解性等属性;根据第一数据集合以及属性集合构造目标函数;随后通过量子退火算法对目标函数进行求解,得到分子序列,该分子序列可以用于表示求解得到的分子结构。
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公开(公告)号:CN116935975A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202210334013.7
申请日:2022-03-31
Applicant: 华为云计算技术有限公司
Abstract: 本申请提供了一种分子生成方法及相关装置,分子生成方法包括:接收用户在终端输入的约束条件,约束条件用于指示分子的属性需要满足的条件,分子的属性包括分子的分子量、水溶性、脂溶性、生物活性、可合成性、与特定分子的对接结合性、与源分子的相似度、所包含的特定子结构、药代动力学和毒性中的任意一项或多项;根据约束条件生成第一分子集合,第一分子集合包括一个或多个分子;向终端返回第一分子集合中一个或多个分子的信息。根据本申请提供的分子生成方法生成分子,能够提高分子生成效率,节省时间成本及人力物力财力等成本。
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