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公开(公告)号：CN117912570B
公开(公告)日：2024-05-14
申请号：CN202410313618.7
申请日：2024-03-19
Applicant: 北京科技大学
Abstract: 本发明提供一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统，涉及数据处理技术领域，方法包括：获取样本数据；提取样本数据的基因特征；分析确定出正常组与癌症组之间具有差异性的基因特征；计算基因特征之间的相关性；通过马尔可夫毯滤波算法，对基因特征进行冗余特征消除，得到最优特征集合；构建加权基因共表达网络；确定枢纽基因；对枢纽基因进行聚类分析，并对各类基因模块中的基因特征的表达量进行汇总，得到模块特征基因；对枢纽基因、模块特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细胞含量进行特征组合，得到多种组合特征；通过逻辑回归模型，基于各种组合特征对样本数据进行分类；基于分类结果，确定分类效果最佳的组合特征。
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公开(公告)号：CN117912570A
公开(公告)日：2024-04-19
申请号：CN202410313618.7
申请日：2024-03-19
Applicant: 北京科技大学
Abstract: 本发明提供一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统，涉及数据处理技术领域，方法包括：获取样本数据；提取样本数据的基因特征；分析确定出正常组与癌症组之间具有差异性的基因特征；计算基因特征之间的相关性；通过马尔可夫毯滤波算法，对基因特征进行冗余特征消除，得到最优特征集合；构建加权基因共表达网络；确定枢纽基因；对枢纽基因进行聚类分析，并对各类基因模块中的基因特征的表达量进行汇总，得到模块特征基因；对枢纽基因、模块特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细胞含量进行特征组合，得到多种组合特征；通过逻辑回归模型，基于各种组合特征对样本数据进行分类；基于分类结果，确定分类效果最佳的组合特征。
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公开(公告)号：CN117409962B
公开(公告)日：2024-03-29
申请号：CN202311721701.X
申请日：2023-12-14
Applicant: 北京科技大学
Abstract: 本发明提供一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法，涉及数据处理技术领域，方法包括：通过基因调控网络，确定关键调控基因；根据免疫细胞比例，确定差异免疫细胞；根据关键调控基因和差异免疫细胞，对样本进行分类，确定出肿瘤组与正常组；确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度；构建微生物相互作用网络；对微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序，将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物。在本发明中，可以找到肿瘤类样本高风险组与低风险组间具备差异的关键微生物，为肿瘤诊断确定可靠的微生物特征，提升肿瘤预后治疗的科学性。
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公开(公告)号：CN117409962A
公开(公告)日：2024-01-16
申请号：CN202311721701.X
申请日：2023-12-14
Applicant: 北京科技大学
Abstract: 本发明提供一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法，涉及数据处理技术领域，方法包括：通过基因调控网络，确定关键调控基因；根据免疫细胞比例，确定差异免疫细胞；根据关键调控基因和差异免疫细胞，对样本进行分类，确定出肿瘤组与正常组；确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度；构建微生物相互作用网络；对微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序，将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物。在本发明中，可以找到肿瘤类样本高风险组与低风险组间具备差异的关键微生物，为肿瘤诊断确定可靠的微生物特征，提升肿瘤预后治疗的科学性。
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