一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法

    公开(公告)号:CN117409962A

    公开(公告)日:2024-01-16

    申请号:CN202311721701.X

    申请日:2023-12-14

    Abstract: 本发明提供一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法,涉及数据处理技术领域,方法包括:通过基因调控网络,确定关键调控基因;根据免疫细胞比例,确定差异免疫细胞;根据关键调控基因和差异免疫细胞,对样本进行分类,确定出肿瘤组与正常组;确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度;构建微生物相互作用网络;对微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序,将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物。在本发明中,可以找到肿瘤类样本高风险组与低风险组间具备差异的关键微生物,为肿瘤诊断确定可靠的微生物特征,提升肿瘤预后治疗的科学性。

    一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法

    公开(公告)号:CN117409962B

    公开(公告)日:2024-03-29

    申请号:CN202311721701.X

    申请日:2023-12-14

    Abstract: 本发明提供一种基于基因调控网络的微生物标记物的筛选方法,涉及数据处理技术领域,方法包括:通过基因调控网络,确定关键调控基因;根据免疫细胞比例,确定差异免疫细胞;根据关键调控基因和差异免疫细胞,对样本进行分类,确定出肿瘤组与正常组;确定肿瘤组样本中的各类微生物的丰度;构建微生物相互作用网络;对微生物相互作用网络中的节点按照MCC值由高到低的顺序进行排序,将排序靠前的第一预设数量的微生物确定为关键微生物。在本发明中,可以找到肿瘤类样本高风险组与低风险组间具备差异的关键微生物,为肿瘤诊断确定可靠的微生物特征,提升肿瘤预后治疗的科学性。

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