公开(公告)号：CN117912570B

公开(公告)日：2024-05-14

申请号：CN202410313618.7

申请日：2024-03-19

Applicant: 北京科技大学

Inventor： 艾冬梅 ,  张天鹏 ,  张林桐 ,  杜洋 ,  李雨珈 ,  邢永莲

IPC: G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明提供一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统，涉及数据处理技术领域，方法包括：获取样本数据；提取样本数据的基因特征；分析确定出正常组与癌症组之间具有差异性的基因特征；计算基因特征之间的相关性；通过马尔可夫毯滤波算法，对基因特征进行冗余特征消除，得到最优特征集合；构建加权基因共表达网络；确定枢纽基因；对枢纽基因进行聚类分析，并对各类基因模块中的基因特征的表达量进行汇总，得到模块特征基因；对枢纽基因、模块特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细胞含量进行特征组合，得到多种组合特征；通过逻辑回归模型，基于各种组合特征对样本数据进行分类；基于分类结果，确定分类效果最佳的组合特征。

公开(公告)号：CN117912570A

公开(公告)日：2024-04-19

申请号：CN202410313618.7

申请日：2024-03-19

Applicant: 北京科技大学

Inventor： 艾冬梅 ,  张天鹏 ,  张林桐 ,  杜洋 ,  李雨珈 ,  邢永莲

IPC: G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明提供一种基于基因共表达网络的分类特征确定方法及系统，涉及数据处理技术领域，方法包括：获取样本数据；提取样本数据的基因特征；分析确定出正常组与癌症组之间具有差异性的基因特征；计算基因特征之间的相关性；通过马尔可夫毯滤波算法，对基因特征进行冗余特征消除，得到最优特征集合；构建加权基因共表达网络；确定枢纽基因；对枢纽基因进行聚类分析，并对各类基因模块中的基因特征的表达量进行汇总，得到模块特征基因；对枢纽基因、模块特征基因、癌症组织浸润微生物含量以及免疫细胞含量进行特征组合，得到多种组合特征；通过逻辑回归模型，基于各种组合特征对样本数据进行分类；基于分类结果，确定分类效果最佳的组合特征。