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公开(公告)号:CN104250663B
公开(公告)日:2017-09-15
申请号:CN201310259709.9
申请日:2013-06-27
Applicant: 北京大学
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6827 , C12Q1/6855 , C12Q1/6874 , C12Q2523/125 , C12Q2525/155 , C12Q2531/113
Abstract: 甲基化CpG岛的高通量测序检测方法,包括:用修饰剂处理DNA样品,将DNA样品中的胞嘧啶转换为尿嘧啶,而5’甲基胞嘧啶不变;所得片段用引物A和DNA聚合酶扩增,获得一端能够锚定接头引物C的片段;所得片段用引物B和DNA聚合酶扩增,获得富集甲基化CpG岛且两端能够分别锚定接头引物C和D的片段;所得片段用接头引物C、D和DNA聚合酶进行PCR指数扩增,获得扩增产物;扩增产物分离纯化,构成高通量测序文库、上机测序及数据分析。在高CpG频率引物对修饰剂转换的基因组DNA中的甲基化CpG岛进行富集性扩增的同时通过三步PCR反应将接头序列连接到待测目的片段,以富集甲基化CpG岛及构建高通量测序文库。
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公开(公告)号:CN104250663A
公开(公告)日:2014-12-31
申请号:CN201310259709.9
申请日:2013-06-27
Applicant: 北京大学
CPC classification number: C12Q1/6858 , C12Q1/6827 , C12Q1/6855 , C12Q1/6874 , C12Q1/6869 , C12Q2523/125 , C12Q2531/113 , C12Q2525/155 , C12Q2535/122
Abstract: 甲基化CpG岛的高通量测序检测方法,包括:用修饰剂处理DNA样品,将DNA样品中的胞嘧啶转换为尿嘧啶,而5’甲基胞嘧啶不变;所得片段用引物A和DNA聚合酶扩增,获得一端能够锚定接头引物C的片段;所得片段用引物B和DNA聚合酶扩增,获得富集甲基化CpG岛且两端能够分别锚定接头引物C和D的片段;所得片段用接头引物C、D和DNA聚合酶进行PCR指数扩增,获得扩增产物;扩增产物分离纯化,构成高通量测序文库、上机测序及数据分析。在高CpG频率引物对修饰剂转换的基因组DNA中的甲基化CpG岛进行富集性扩增的同时通过三步PCR反应将接头序列连接到待测目的片段,以富集甲基化CpG岛及构建高通量测序文库。
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