一种基于热力学优化的特异性核酸杂交方法

    公开(公告)号:CN104513855B

    公开(公告)日:2017-02-22

    申请号:CN201410707763.X

    申请日:2014-11-28

    Abstract: 本发明涉及一种基于热力学优化的高特异性核酸杂交方法,包括:该方法主要根据核酸反应热力学最近邻模型,计算DNA以及RNA反应的热力学参数,从理论上阐明探针特异性的理论极限,同时计算出不同单碱基突变的特异性差异与热力学性质,并在计算机上模拟预测出不同的核酸反应结果;设计出具有理论优化过的具有高特异性的核酸探针。本发明基于热力学计算设计出的探针特异性达到了理论上最优结果;稳定性好,保存时间长;检测过程及其简单;且检测时间短;检测过程不受环境温度影响,同时不受溶液中盐离子浓度影响;该方法能够满足临床需求,在医学方面具有很好的应用前景。

    一组人肺腺癌和人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物

    公开(公告)号:CN104131108B

    公开(公告)日:2016-06-29

    申请号:CN201410397937.7

    申请日:2014-08-13

    Abstract: 本发明涉及生物技术领域,特别是涉及一组人肺腺癌和人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物、相关试剂盒以及他们的用途。本发明提供一组人肺腺癌和/或人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物,所述LncRNA生物标志物包括:uc001gzl.3、ENST00000434223、uc004bbl.1、ENST00000540136和NR_034174。本发明所提供的人肺腺癌和/或人结直肠癌诊断用LncRNA生物标志物,可用来区分人早期肺腺癌和人结直肠癌,其区分早期肺腺癌和配对正常肺组织的AUC可达0.978,灵敏度和特异性分别为92%和98%。而对于结直肠癌样本的诊断其AUC亦可达到0.963,灵敏度和特异性分别为94.4%和88.9%。

    一种基于热力学优化的高特异性核酸杂交方法

    公开(公告)号:CN104513855A

    公开(公告)日:2015-04-15

    申请号:CN201410707763.X

    申请日:2014-11-28

    Abstract: 本发明涉及一种基于热力学优化的高特异性核酸杂交方法,包括:该方法主要根据核酸反应热力学最近邻模型,计算DNA以及RNA反应的热力学参数,从理论上阐明探针特异性的理论极限,同时计算出不同单碱基突变的特异性差异与热力学性质,并在计算机上模拟预测出不同的核酸反应结果;设计出具有理论优化过的具有高特异性的核酸探针。本发明基于热力学计算设计出的探针特异性达到了理论上最优结果;稳定性好,保存时间长;检测过程及其简单;且检测时间短;检测过程不受环境温度影响,同时不受溶液中盐离子浓度影响;该方法能够满足临床需求,在医学方面具有很好的应用前景。

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