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公开(公告)号:CN117965747A
公开(公告)日:2024-05-03
申请号:CN202311838867.X
申请日:2023-12-28
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及分子生物学和分子生态学领域,具体公开了一种检测达氏鲟eDNA的引物和探针,通过设计特异性的达氏鲟的RPA引物和探针组合,采用重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条(RPA‑LFD)检测技术,能够实现快速、便捷地检测达氏鲟eDNA,并且灵敏高,特异强,从而实现野外实时监测达氏鲟。
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公开(公告)号:CN117721213A
公开(公告)日:2024-03-19
申请号:CN202311727119.4
申请日:2023-12-15
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于分子生物学和分子生态学技术领域,具体公开了利用qPCR检测入侵物种鳄雀鳝的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明创新了引物设计方法,筛选出四种优势鳄雀鳝qPCR引物探针组合,结合优化的PCR反应体系和条件,能够在多种鱼类DNA背景下检测出鳄雀鳝DNA,进而实现qPCR技术与环境eDNA检测的结合。本发明检测方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视,适合野外实时监测研究,真正实现无创野外实时监测鳄雀鳝群体动向。
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公开(公告)号:CN118813831A
公开(公告)日:2024-10-22
申请号:CN202411232003.8
申请日:2024-09-03
Applicant: 上海海洋大学 , 上海市环境科学研究院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于多重PCR扩增的长江江豚环境DNA检测方法,包括以下步骤:(1)利用多重PCR方法建立检测长江江豚环境DNA用的引物组合;(2)水样抽提:采集水样,然后用微孔滤膜抽滤水样,抽滤后将滤膜放至灭菌离心管;(3)eDNA提取:利用CTAB法提取滤膜上的eDNA;(4)多重PCR扩增:利用步骤(1)中所述的引物组合对提取所得eDNA进行多重PCR扩增反应,得到扩增产物;(5)电泳检测:对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,电泳结束后在凝胶成像仪中观察亮带情况以判断有无长江江豚的存在。本发明利用多重PCR技术多位点引物组合,检测长江江豚环境DNA的存在,具有较高的特异性、灵敏性和准确性。
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公开(公告)号:CN115231721B
公开(公告)日:2023-11-14
申请号:CN202210754981.3
申请日:2022-06-29
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种用于环境DNA的过滤器,属于环境DNA领域。它包括滤器底座、滤膜支架、滤膜、防静电隔网、滤棉、限位压网、滤器上盖和防爆卡;所述滤膜支架设在滤器底座的内部,所述滤膜完整平铺在滤膜支架上,并固定在滤器底座上;所述限位压网、滤棉、防静电隔网、滤膜依次相互平铺;本发明可缩短过滤时间,提高在过滤效率,提取出的DNA上清液体积是原有单一滤膜法体积的4倍,设置防静电网,将滤棉和滤膜相隔开,不会造成静电;在滤器上盖和滤器底座上由防爆卡固定,可避免因除防爆卡外的整个装置承受过大压力时发生爆开的情况。
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公开(公告)号:CN109486924A
公开(公告)日:2019-03-19
申请号:CN201811406204.X
申请日:2018-11-23
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法,包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库;其中串联条形码为6bp长度的DNA序列,且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记,大大减少污染数据不能被识别的可能性,极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。
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公开(公告)号:CN118048462A
公开(公告)日:2024-05-17
申请号:CN202311838868.4
申请日:2023-12-28
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及分子生物学和分子生态学领域,具体公开了一种检测中国大鲵环境DNA的引物和探针。通过设计中国大鲵环境DNA的特异性RPA引物和探针并组合,采用重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条(RPA‑LFD)检测技术,并且结合eDNA样本提取方法的改进,能够快速、便捷、高灵敏度和特异性地检测中国大鲵环境DNA,实现在野外实时监测中国大鲵。
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公开(公告)号:CN115231721A
公开(公告)日:2022-10-25
申请号:CN202210754981.3
申请日:2022-06-29
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C02F9/02
Abstract: 本发明公开了一种用于环境DNA的过滤器,属于环境DNA领域。它包括滤器底座、滤膜支架、滤膜、防静电隔网、滤棉、限位压网、滤器上盖和防爆卡;所述滤膜支架设在滤器底座的内部,所述滤膜完整平铺在滤膜支架上,并固定在滤器底座上;所述卡位压网、滤棉、防静电隔网、滤膜依次相互平铺;本发明可缩短过滤时间,提高在过滤效率,提取出的DNA上清液体积是原有单一滤膜法体积的4倍,设置防静电网,将滤棉和滤膜相隔开,不会造成静电;在滤器上盖和滤器底座上由防爆卡固定,可避免因除防爆卡外的整个装置承受过大压力时发生爆开的情况。
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公开(公告)号:CN109911305A
公开(公告)日:2019-06-21
申请号:CN201910044842.X
申请日:2019-01-17
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明公开了一种半自动化的枪头装盒装置,包括外壳,所述外壳内部设置有进料部、调整部、注射部和接收部,所述进料部的出口与调整部的入口连通,所述调整部的出口与注射部的入口连通,所述注射部下方设置接收部,所述进料部包括传送装置,传送装置内部设置分流装置,所述传送装置末端处于调整部的上方,所述调整部包括两块导向板围成的V形结构,V形结构的下端留有缝隙,导向板下端的外侧设置第三传送带,两块导向板下端的缝隙大于两边第三传送带之间的缝隙,所述第三传送带的走向与进料部内部的传送装置走向垂直,本半自动化的枪头装盒装置结构紧凑,使用成本低,适合小型实验室使用。
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公开(公告)号:CN118962165A
公开(公告)日:2024-11-15
申请号:CN202411071624.2
申请日:2024-08-06
Abstract: 本发明公开了一种离岸水样自动采样和水环境数据采集平台,包括水面载具、水下采样及数据收集系统、通讯及数据传输系统和岸基控制系统,所述水面载具用于离岸自航行、视觉环境感知、定位和水样采集、收集;所述水下采样及数据收集系统用于水样采集、水环境数据收集和水下影像资料录制;所述通讯及数据传输系统用于实时通讯和数据传输;所述岸基控制系统用于对平台进行远程无线控制。本发明采用上述的一种离岸水样自动采样和水环境数据采集平台,可实现远距离遥控水样自动采集、各种水环境参数检测及影像资料的记录,解决了目前海洋、江河湖泊中环境DNA水样获取和水环境数据采集时依赖人搭载船舶载具成本高、安全性差和作业流程复杂的问题。
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公开(公告)号:CN117844947A
公开(公告)日:2024-04-09
申请号:CN202311724649.3
申请日:2023-12-15
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域,具体公开了利用多重PCR检测水中入侵物种拟柱孢藻的引物组合、试剂盒及方法。本发明创新了引物设计方法,筛选出六种优势拟柱孢藻多重PCR引物组合,结合优化的PCR反应体系和条件,能够在多种类蓝藻背景下检测出拟柱孢藻DNA,解决了环境eDNA检测存在的难题,能够将多重PCR检测与环境eDNA检测结合,实现更精准地监测拟柱孢藻的动向。本发明检测方法可有效节省时间,节省成本,灵敏性高、特异性强、效率高、专业要求低,当目标物种浓度低时检出率更为良好,且可以通过胶图判断。
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