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公开(公告)号:CN109486924B
公开(公告)日:2022-03-01
申请号:CN201811406204.X
申请日:2018-11-23
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法,包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库;其中串联条形码为6bp长度的DNA序列,且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记,大大减少污染数据不能被识别的可能性,极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。
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公开(公告)号:CN109486924A
公开(公告)日:2019-03-19
申请号:CN201811406204.X
申请日:2018-11-23
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法,包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库;其中串联条形码为6bp长度的DNA序列,且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记,大大减少污染数据不能被识别的可能性,极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。
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