公开(公告)号：CN109486924A

公开(公告)日：2019-03-19

申请号：CN201811406204.X

申请日：2018-11-23

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 李晨虹 ,  王颖 ,  袁昊

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法，包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库；其中串联条形码为6bp长度的DNA序列，且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记，大大减少污染数据不能被识别的可能性，极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。

公开(公告)号：CN115992204A

公开(公告)日：2023-04-21

申请号：CN202210999993.2

申请日：2022-08-19

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 李晨虹 ,  陈文隽 ,  王颖 ,  刘芊芊

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/11 ,  C40B50/06 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体涉及线粒体DNA的基因文库的建立方法和获取线粒体基因组序列的方法。建立文库的方法为：(1)样本总DNA与RNA探针杂交后，捕获靶序列；(2)收集靶序列并进行扩增，获得扩增后的线粒体DNA。扩增后的DNA进行破碎、平末端修复、连接测序接头和索引PCR，构建文库。所获得基因文库进行测序，并对测序后的结果进行组装。本发明的方案，在构建测序文库之前即对原始的长片段线粒体DNA进行富集，可获得更多线粒体DNA数据，从而提高富集效率，提高线粒体基因组数据量占比和覆盖度，可实现完整组装；同时降低了组装所需的数据量，大大降低测序成本。本发明无需相应物种参考基因组，可以相对快速、经济地获得各种脊椎动物的线粒体全基因组，为建立脊椎动物环境DNA线粒体基因组数据库提供了可行的技术路线。

公开(公告)号：CN109486924B

公开(公告)日：2022-03-01

申请号：CN201811406204.X

申请日：2018-11-23

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 李晨虹 ,  王颖 ,  袁昊

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12N15/11 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法，包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库；其中串联条形码为6bp长度的DNA序列，且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记，大大减少污染数据不能被识别的可能性，极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。

公开(公告)号：CN207885504U

公开(公告)日：2018-09-21

申请号：CN201820066929.8

申请日：2018-01-16

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 吴丛迪 ,  钟锐 ,  王颖 ,  徐灿 ,  姜莺颖

IPC: A01K63/10

Abstract: 本实用新型公开了一种新型双息式水族缸除污装置，包括缸体与虹吸机，缸体的外侧设有虹吸机，虹吸机的一侧固定连接有虹吸管，虹吸管的另一端固定连接有内磁力缸壁擦，内磁力缸壁擦包括内底座，内底座的内部等间距固定安装有刮刀座；避免传统技术中在缸壁擦拭结束之后，由于擦拭后的污物溶于水中，破坏水质，导致每次擦拭后仍需对缸内水体进行部分更换的麻烦步骤；当外磁力缸壁擦在缸体的表面移动时，内磁力缸壁擦也随之活动，此种方式更优于传统手持式缸壁擦，早进行操作时，不必登高、双手不沾水，更加的方便快捷；刮藻刀的一端与缸体的内壁相接触，将其表面的藻类刮下来，藻类经过吸附网之后由虹吸管吸附排除缸体之外。