公开(公告)号：CN118048462A

公开(公告)日：2024-05-17

申请号：CN202311838868.4

申请日：2023-12-28

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 李晨虹 ,  凌岚馨 ,  陈文隽 ,  王慧芳

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6844 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及分子生物学和分子生态学领域，具体公开了一种检测中国大鲵环境DNA的引物和探针。通过设计中国大鲵环境DNA的特异性RPA引物和探针并组合，采用重组酶聚合酶扩增结合侧流层析试纸条(RPA‑LFD)检测技术，并且结合eDNA样本提取方法的改进，能够快速、便捷、高灵敏度和特异性地检测中国大鲵环境DNA，实现在野外实时监测中国大鲵。

公开(公告)号：CN115992204A

公开(公告)日：2023-04-21

申请号：CN202210999993.2

申请日：2022-08-19

Applicant: 上海海洋大学

Inventor： 李晨虹 ,  陈文隽 ,  王颖 ,  刘芊芊

IPC: C12Q1/6806 ,  C12N15/11 ,  C40B50/06 ,  G16B30/20

Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体涉及线粒体DNA的基因文库的建立方法和获取线粒体基因组序列的方法。建立文库的方法为：(1)样本总DNA与RNA探针杂交后，捕获靶序列；(2)收集靶序列并进行扩增，获得扩增后的线粒体DNA。扩增后的DNA进行破碎、平末端修复、连接测序接头和索引PCR，构建文库。所获得基因文库进行测序，并对测序后的结果进行组装。本发明的方案，在构建测序文库之前即对原始的长片段线粒体DNA进行富集，可获得更多线粒体DNA数据，从而提高富集效率，提高线粒体基因组数据量占比和覆盖度，可实现完整组装；同时降低了组装所需的数据量，大大降低测序成本。本发明无需相应物种参考基因组，可以相对快速、经济地获得各种脊椎动物的线粒体全基因组，为建立脊椎动物环境DNA线粒体基因组数据库提供了可行的技术路线。