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公开(公告)号:CN119552964A
公开(公告)日:2025-03-04
申请号:CN202411601555.1
申请日:2024-11-11
Applicant: 上海源奇生物医药科技有限公司 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C12Q1/6813 , C40B50/06 , G16B20/50 , G16B30/00
Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域,尤其涉及一种无需获取淋巴瘤组织样本检测ctDNA的方法及应用。包括如下步骤:一、收集血液样本;二、构建杂交文库;三、生物信息学分析;所述血液样本来源于外周血。本发明基于二代测序技术,无需获取肿瘤组织样本,只通过采集淋巴瘤患者外周血样本,即可检测确定样本的ctDNA含量,结合ctDNA含量值和治疗过程中的当量值倍数变化,即可预测患者治疗的效果。通过采集血浆cfDNA和白细胞基因组DNA,采用UDI、UMI分子标签进行NGS测序文库构建。测序后联合cfDNA样本测序数据和白细胞基因组DNA样本测序数据,进行过滤分析,能够准确计算出样本的ctDNA当量。
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公开(公告)号:CN117935929A
公开(公告)日:2024-04-26
申请号:CN202410095766.6
申请日:2024-01-23
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本申请公开了免疫化疗结果预测方法、装置、设备及介质,涉及基因检测技术领域,包括:从免疫化疗对象的淋巴瘤组织的突变基因中筛选出包含肿瘤蛋白p53基因、Notch2基因和FBXW7抑癌基因的基因信息并获取免疫化疗对象的临床特征;将基因信息和临床特征输入至预设化疗结果预测模型,以基于临床特征对应的特征系数对基因信息进行赋分活动,并统计所有基因信息的总分数;基于总分数以及分数与化疗结果风险等级规则匹配对应的目标风险,以根据目标风险预测所述免疫化疗对象的化疗结果。在免疫化疗对象的治疗过程中通过预设化疗结果预测模型根据其临床特征和基因信息对该免疫化疗对象的当前化疗方案未来所形成的化疗结果进行准确预测。
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