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公开(公告)号：CN117070431A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202310342671.5
申请日：2023-03-31
申请人： 上海交通大学 , 合成生物学海河实验室
摘要： 本发明公开了一种基于生物发光的糖肽类抗生素全细胞生物传感器及其制备方法与应用；传感器中感应模块由来源于天蓝色链霉菌M1146中双组分系统VanS/VanR及其特异性基因调控元件组成；报告模块由来源于发光杆菌的荧光素酶编码基因簇luxCDABE组成。通过将感应模块与报告模块耦合至天蓝色链霉菌M1146的染色体上，使得构建的底盘宿主可以灵敏地感知糖肽类抗生素，且伴随着生物发光现象。以万古霉素为例，基于Hill模型，本发明利用非线性最小二乘法进一步表征和量化了WHY03对应的剂量‑效应关系。本发明的生物传感器背景响应值极低、耗时短、成本低，且特异性高，易于实现糖肽类抗生素的高通量筛查与定量检测。
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公开(公告)号：CN118813661A
公开(公告)日：2024-10-22
申请号：CN202410893594.7
申请日：2024-07-04
申请人： 上海交通大学 , 合成生物学海河实验室
摘要： 本发明公开了一种氯化瑞斯托霉素衍生物的生产菌株、构建方法和用途；具体是以含有瑞斯托霉素生物合成基因簇的菌株为底盘菌株、或以去甲基瑞斯托霉素苷元的生产菌株为底盘菌株，在其基因组中异源表达卤化酶基因，获得所述氯化瑞斯托霉素衍生物生产菌株；所述氯化瑞斯托霉素衍生物包括氯化瑞斯托霉素、氯化去甲基瑞斯托霉素苷元。目前暂无氯化瑞斯托霉素的生物合成报道，本发明通过异源表达卤化酶生物合成得到氯化瑞斯托霉素和氯化去甲基瑞斯托霉素苷元；本发明提供的氯化瑞斯托霉素和氯化去甲基瑞斯托霉素苷元生产菌株具有良好的遗传可操作性、生长快、发酵时间短，发酵2‑3天即可达到产素的高峰，具有优良的工业发展潜力。
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公开(公告)号：CN116574752A
公开(公告)日：2023-08-11
申请号：CN202310340508.5
申请日：2023-03-31
申请人： 上海交通大学 , 合成生物学海河实验室
摘要： 本发明公开了一种糖肽类抗生素可视化检测的生物传感器及其构建方法与应用；通过在模式菌株天蓝色链霉菌M1146中，对染色体上D‑丙氨酸‑D‑丙氨酸连接酶编码基因ddlA进行定点突变，并以突变后菌株为底盘宿主、以能够感知糖肽类抗生素的双组分系统VanS/VanR中所包含的特异性调控元件PvanHAX为报告基因启动子、以D‑丙氨酸‑D‑乳酸连接酶编码基因vanA为报告基因，通过将菌株生长状态与PvanHAX启动子的激活进行偶联，成功构建糖肽类抗生素全细胞生物传感器。该生物传感器不仅省去繁琐的样品预处理步骤，且检测限下降5.5倍，低至0.75μg/mL，具有检测价格便宜、检测限更低、检测流程简单等优点。
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公开(公告)号：CN111909946A
公开(公告)日：2020-11-10
申请号：CN201910379905.7
申请日：2019-05-08
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明公开了用于糖多孢菌的转座质粒及其应用；该转座质粒为Tn5转座质粒—pJTn1～pJTn6，这些转座质粒均可在红色糖多孢菌中进行高效转座，其中pJTn1及pJTn5成功在刺糖多孢菌中进行体内转座，得到31个插入位点均不同的转座突变子。通过转座突变子发酵、检测发酵液中多杀菌素产量，发现转座的插入对多杀菌素的产量有明显的影响。该转座体系对多杀菌素在刺糖多孢菌中的生物合成调控具有重要意义。
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公开(公告)号：CN106146637B
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN201610756269.1
申请日：2016-08-29
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C07K14/415 , C12N15/29 , A01H5/00 , A01H1/02 , A01H6/54 , A01H6/46 , A01H6/20 , A01H6/60 , A01H6/82
摘要： 本发明涉及一种植物学技术领域的提高植物耐盐能力的GmSLT蛋白及核酸和应用；所述GmSLT蛋白含如下氨基酸序列中的一种或多种：如SEQ ID NO.3所示的结构域ABS序列，如SEQ ID NO.4所示的TM序列，以及如SEQ ID NO.5所示的ZBS序列；本发明还涉及编码所述GmSLT蛋白的核酸序列以及所述核酸序列在增强植物耐盐能力中的应用。本发明通过生物信息学及基因时空表达分析，获得了耐盐基因GmSLT；将该基因转化酵母，可以明显提高酵母的耐盐能力；转化拟南芥和水稻，也能够增强相应植物的耐盐性；本发明的基因能够用于改良植物，提高其耐盐能力。
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公开(公告)号：CN106366168B
公开(公告)日：2020-09-15
申请号：CN201610744083.4
申请日：2016-08-26
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： C07K14/36 , C12N15/76 , C12N1/21 , C07K1/16 , A61K38/16 , A61P31/04 , A61P31/10 , A61P31/12 , A23K20/147 , C12R1/465
摘要： 本发明公开了一种羊毛硫肽类抗菌肽及其脱氢衍生物的制备方法。通过解析羊毛硫肽类抗菌肽Lexapeptide的生物合成基因簇的功能，对该抗菌肽生物合成基因簇进行基因工程改造，包括删除冗余基因和敲除特定的功能基因，然后将基因工程改造后的最小基因簇在优选的异源宿主中表达，分别发酵基因重组菌株即可以生产羊毛硫肽类抗菌肽Lexapeptide及其脱氢衍生物Lexapeptide Z。Lexapeptide和Lexapeptide Z均具有抑制细菌生长的作用，可以用作抗革兰氏阳性菌制剂，对临床普遍遇到的耐药性问题提供解决方案。
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公开(公告)号：CN106338558B
公开(公告)日：2019-08-23
申请号：CN201610711769.3
申请日：2016-08-23
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： G01N30/02
摘要： 本发明提供了一种气相色谱(GC)或气相色谱‑质谱联合(GC‑MS/MS)检测3,5,6‑三氯‑2‑吡啶酚的衍生化的方法，包括如下步骤：将含3,5,6‑三氯‑2‑吡啶酚的待测液经脱溶剂处理后，用丙酮(农残级)溶解，混匀后，进行离心去除固体杂质后，再次进行脱溶剂处理；然后分别加入乙酸酐(分析纯)和乙酸乙酯(农残级)，混匀，置于50～60℃水浴中反应30～50分钟，室温静置3～5min；加入丙酮(农残级)，反复进行混匀，得到待测样品；采用GC或GC‑MS对所述待测样品进行检测，控制GC起始温度为100℃，在2min内升温至150℃后，保持2min，然后继续升温至280℃，保持5min；通过二级质谱多离子反应监测选择至少两个特征碎片离子进行定性和定量测定。本发明的优点在于：选用原料成本低廉，反应条件温和。
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公开(公告)号：CN106338558A
公开(公告)日：2017-01-18
申请号：CN201610711769.3
申请日：2016-08-23
申请人： 上海交通大学
IPC分类号： G01N30/02
摘要： 本发明提供了一种气相色谱(GC)或气相色谱-质谱联合(GC-MS/MS)检测3,5,6-三氯-2-吡啶酚的衍生化的方法，包括如下步骤：将含3,5,6-三氯-2-吡啶酚的待测液经脱溶剂处理后，用丙酮(农残级)溶解，混匀后，进行离心去除固体杂质后，再次进行脱溶剂处理；然后分别加入乙酸酐(分析纯)和乙酸乙酯(农残级)，混匀，置于50～60℃水浴中反应30～50分钟，室温静置3～5min；加入丙酮(农残级)，反复进行混匀，得到待测样品；采用GC或GC-MS对所述待测样品进行检测，控制GC起始温度为100℃，在2min内升温至150℃后，保持2min，然后继续升温至280℃，保持5min；通过二级质谱多离子反应监测选择至少两个特征碎片离子进行定性和定量测定。本发明的优点在于：选用原料成本低廉，反应条件温和。
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公开(公告)号：CN102994585B
公开(公告)日：2014-12-24
申请号：CN201210376355.1
申请日：2012-09-28
申请人： 上海交通大学
摘要： 本发明公开了一种淡紫醌霉素及其甲酯的制备方法。以链黑菌素产生菌-柔毛链霉菌Streptomyces.flocculus CGMCC4.1223作为出发菌株，对该链黑菌素生物合成基因簇中的双氧化酶基因stnBl实行选择性敲除，获得相应的stnBl基因失活突变株ΔstnBl；对突变株发酵产物粗提物采用反相硅胶、凝胶等柱层析和半制备HPLC等色谱分析技术，制得淡紫醌霉素及其甲酯。本发明建立了利用链黑菌素产生菌通过基因工程手段制备淡紫醌霉素的方法，提高了淡紫醌霉素和淡紫醌霉素甲酯的产量，分别达到每5升培养基可以获得约1mg淡紫醌霉素和20mg淡紫醌霉素甲酯，并且经过菌种优化和发酵优化还有进一步提升的空间。
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公开(公告)号：CN103205481B
公开(公告)日：2014-03-19
申请号：CN201310112649.8
申请日：2013-04-02
申请人： 金河生物科技股份有限公司 , 上海交通大学
摘要： 本发明公开了提高金霉素产量的方法及其重组表达载体和基因工程菌，通过利用FADH2依赖型氯化酶基因ctcP和FAD还原酶基因ctcQ构建重组表达载体，将重组表达载体转化至金色链霉菌（Streptomycesaureofaciens）中获得高产金霉素的基因工程菌株，获得的工程菌株通过超量表达FADH2依赖型氯化酶基因ctcP和FAD还原酶基因ctcQ打破金霉素合成途径中氯代反应的瓶颈，从而提高金色链霉菌中金霉素的产量；该菌株的获得为提高金霉素产量、降低金霉素生产成本奠定了基础。
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