公开(公告)号：CN105154567A

公开(公告)日：2015-12-16

申请号：CN201510672118.3

申请日：2015-10-16

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 赵小东 ,  邵志峰 ,  康亚妮 ,  戚颖

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2531/119 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序的研究与目标蛋白结合的RNA的方法，提供了一种反转录随机引物，包括形成发卡结构的碱基序列以及随机碱基序列，形成发卡结构的碱基序列包括用于识别RNA链信息的条码碱基序列和与测序引物部分相同的碱基序列。还提供了一种双链接头，所述双链接头的一条链包括与测序引物碱基序列中的一部分相同的碱基序列，并且，相对于配对的另一条链，在3’端还具有突出的随机碱基序列。该方法主要包括以下步骤：将获得的与目标蛋白结合的RNA利用反转录随机引物反转录合成第一链cDNA；酶消化过量反转录随机引物并碱解RNA；双链接头与所述第一链cDNA退火杂交，引入已知序列，随后引入测序引物，最终形成双端测序文库用于测序。