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公开(公告)号：CN116705163A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202310629526.5
申请日：2023-05-31
申请人： 扬州市疾病预防控制中心
摘要： 本发明公开了一种实时荧光PCR数据管理系统，包括：数据采集模块，用于自动读取各个监测设备上的荧光PCR数据；数据解析模块，用于对读取到的荧光PCR数据进行解析，获得解析数据；辅助研判模块，用于基于机器学习模型，对所述解析数据进行辅助研判。实现数据自动读取、辅助研判方案以及自动监测数据上报效果。
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公开(公告)号：CN116665787A
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN202310555404.6
申请日：2023-05-16
申请人： 广州先进技术研究所
摘要： 本发明提供一种合成生物实验观测数据分析处理方法及系统，该方法包括如下步骤：实时采集合成生物实验观测数据并转换成实验观测数据文件，将实验观测数据文件同步到HDFS存储；将实验观测数据文件映射成多个Flink Table，生成数据表；通过表间连接的方式连接具有关联信息的数据表，并对数据表进行数据预处理，生成明细宽表；根据明细宽表中的数据进行特征降维处理、实验参数阈值分析以及对合成生物进行分类与鉴定；采用交互式数据可视化工具对经过特征降维处理、实验参数阈值分析以及对合成生物进行分类与鉴定后生成的数据进行可视化展示。本发明适用于海量数据处理，可实时生成数据分析报告，可用于各种不同自动化合成生物实验观测数据的分析处理场景。
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公开(公告)号：CN116434837B
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN202310687440.8
申请日：2023-06-12
申请人： 广州盛安医学检验有限公司
IPC分类号： G16B30/10 , G16B40/20 , G16B45/00 , G06F18/2433
摘要： 本发明提供了一种基于NGS的染色体平衡易位检测分析系统，包括样品制备终端、NGS测序终端、样品数据处理终端和分析结果展示终端；样品制备终端用于将待检样品进行DNA提取并进行DNA文库制备；NGS测序终端用于将构建完成的DNA文库进行高通量测序，生成对应的原始测序数据；样品数据处理终端用于对原始测序数据进行易位检测数据处理，生成染色体易位信息；分析结果展示终端用于根据染色体易位信息生成并展示易位分析结果信息。本发明具有提高染色体平衡易位检测分析的准确性的效果。
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公开(公告)号：CN110534159B
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN201910662841.1
申请日：2019-07-22
申请人： 中国人民解放军总医院
摘要： 本发明涉及一种基因疾病关联分析系统的构建方法、装置、计算机设备和存储介质，所述方法包括：获取与每一种预设的疾病相关的基因数据；根据与每一种预设的疾病相关的基因数据，通过预训练的机器学习模型，构建与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表；根据与每一种预设的疾病对应的基因疾病数据表，构建基因疾病关联数据库；将基因疾病关联数据库进行图形化展示，以构建基因疾病关联分析系统。通过上述方法，可以构建一系统性、高质量的基因疾病关联分析系统，通过该系统，用户可以非常直观和便捷的根据某一类疾病的疾病名称或临床特征筛选出与该疾病相关联的候选基因，进而发现、识别某一类疾病在发生发展过程中的调控基因。
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公开(公告)号：CN116631509A
公开(公告)日：2023-08-22
申请号：CN202210133555.8
申请日：2022-02-14
申请人： 黄梦
摘要： 本发明公开一种用于单细胞测序数据的缺失值填充方法及系统，所述方法是基于单细胞测序技术，该方法包括:1)原始真实数据搜集，2)仿真数据生成，3)数据预处理，4)利用低秩矩阵对基因表达的缺失值进行填充，5)下游分析包括缺失值的掩码分析、可视化、聚类分析、细胞marker基因分析和基因表达的变异系数分析。本发明属于生物信息分析技术领域，本发明提供的基于单细胞转录组测序的细胞基因表达缺失值的填充方法，有效地填补了基因表达矩阵的缺失值，改善了细胞的低维表示和聚类，恢复了基因关系和标记基因的相关性，更好地保留细胞之间的基因表达变异性，能够降低现有单细胞测序数据分析中，基因表达的缺失值带来的细胞分类方法的局限性，有利于提高细胞分类准确率，达到减小分类误差的效果。
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公开(公告)号：CN113806402B
公开(公告)日：2023-08-15
申请号：CN202111077307.8
申请日：2021-09-14
申请人： 北京八分量信息科技有限公司
IPC分类号： G06F16/2455 , G06F16/248 , G06F16/27 , G06F16/955 , G16B50/30 , G16B45/00
摘要： 本发明提供一种基于区块链的信息查询方法，信息输入单元、信息处理单元及区块链上的至少两个区块链节点；信息输入单元，能够信息处理单元传送输入信息并发出结果筛选和呈递的请求，输入信息能够包含多层级限定信息，其中，输入信息能够包含第一层关键词信息、第二层关键词信息、第三层关键词信息…第n层关键词信息；信息处理单元，能够接收信息输入单元的输入信息，并基于区块链的多层级筛选进行结果信息反馈和展示。本发明设计一种通过具有缓存区域的区块链节点进行合理的逻辑顺序录入多指令的方法，通过该方法进行信息筛选能够减少磁道的寻道，增加信息查询的效率。
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公开(公告)号：CN116580760A
公开(公告)日：2023-08-11
申请号：CN202310405969.6
申请日：2023-04-17
申请人： 安徽医科大学第一附属医院
摘要： 本发明提供一种依赖组蛋白修饰状态预测肾透明细胞癌预后和临床决策的风险模型及其建立方法和应用，涉及肿瘤标志物和生物医学检测技术领域。所述风险模型为从多个队列中获得完整转录信息和临床资料的样本，从MSigDB数据库下载组蛋白修饰相关通路，通路激活状态通过GSVA算法进行量化，确定组蛋白修饰差异最明显的簇间的差异表达基因，并选择模型构建基因，从生存差异、化疗反应和激活通路进行组间对比，建立列线图来量化不同患者的死亡概率，本发明克服了现有技术的不足，使用HiMG风险模型能很好的区分不同预后的患者，且对于化疗药物选择有指导意义，同时建立了具有高预测性能的列线图，为ccRCC的精准化治疗提供参考。
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公开(公告)号：CN116577472A
公开(公告)日：2023-08-11
申请号：CN202310850820.9
申请日：2023-07-12
申请人： 中国中医科学院中药研究所
IPC分类号： G01N33/00 , G01N15/10 , G01N27/62 , G01N30/02 , G01N30/32 , G01N1/44 , G16B20/00 , G16B40/00 , G16B45/00 , G16B10/00 , G16B15/20 , G16B40/30
摘要： 本发明公开一种植物细胞环境蛋白组学分析方法及应用，使用从植物分离的活细胞通过测量蛋白质组的热稳定性，能够有效地分析植物活细胞内蛋白质组水平上的蛋白结合或组装情况，特别是可以用于分析内质网内部的蛋白质翻译、折叠和加工、核糖体蛋白和光系统的成分、蛋白质组装以及基因复制和蛋白质进化等。
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公开(公告)号：CN116525005A
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202310323816.7
申请日：2023-03-30
申请人： 浙江大学医学院附属第一医院
摘要： 本发明涉及肝癌领域，尤其是涉及一种巨噬细胞标记基因在肝癌预后中的应用及其风险评估模型。巨噬细胞标记基因在肝癌预后中的应用，该巨噬细胞标记基因包括TPP1、FTL、CXCL8、CD68、ATP6V1F、CSTB、YBX1、LGALS3和APLP2。本申请基于TAM相关标记基因确定了3种分子亚型后，发现三种亚型之间的预后生存率和免疫特征存在着显著性差异。随后，9个基因风险预测模型（TPP1、FTL、CXCL8、CD68、ATP6V1F、CSTB、YBX1、LGALS3和APLP2）被确定为HCC患者的独立预后因素。与风险评分低的患者相比，风险评分高的患者生存率较低，免疫治疗获益较少。本申请构建了一个TAM相关的风险评估模型，该风险评估模型在预测HCC患者的预后生存率和免疫治疗反应方面具有极好的效果。
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公开(公告)号：CN116189897B
公开(公告)日：2023-07-25
申请号：CN202310445532.5
申请日：2023-04-24
申请人： 四川省医学科学院·四川省人民医院
IPC分类号： G16H50/30 , G16B50/00 , G06F16/22 , G06F16/245 , G06F16/2458 , G16B45/00
摘要： 本发明请求保护一种基于时序变化关系的病毒癌症风险预测方法和系统，通过感知到差异查询请求并响应，在风险预测系统的查询表单的第一输入框内查询第一预测条件的第一字段，感知到在第一字段上的第二查询请求并响应，在第二输入框内查询第二字段，感知到触发第一基因序列的索引的查询请求并响应于触发第一基因序列的索引的查询请求，在第二输入框内查询第一基因序列的基因信号通路，且完成字段更新。用户可以通过简单的点击来对癌症患者中病毒阳性组和病毒阴性组进行最新和最全面的肿瘤免疫浸润的分析和多种免疫浸润算法和可视化呈现，极大地促进了肿瘤病毒学方向免疫治疗领域的进一步发展，从而有助于释放当前数据资源的价值。
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