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公开(公告)号：CN103333896A
公开(公告)日：2013-10-02
申请号：CN201310314563.3
申请日：2013-07-24
Applicant: 厦门大学
IPC: C12N15/115 , C12Q1/68 , A61K49/00 , A61K47/26 , A61P35/00
Abstract: 乳腺癌细胞MDA-MB-231的核酸适体LXL-1及其应用，涉及乳腺癌细胞。所述乳腺癌细胞MDA-MB-231的核酸适体LXL-1在0℃，0.157M/L Na+，0.005M/L Mg2+条件下具有独特的茎环结构。所述乳腺癌细胞MDA-MB-231的核酸适体LXL-1在制备乳腺癌诊断试剂、治疗乳腺癌药物、乳腺癌的肿瘤标志物等中，以及在研究乳腺癌与正常组织的差异性、乳腺肿瘤组织切片成像、乳腺肿瘤相关的活体成像、乳腺癌的靶向治疗等中的应用。
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公开(公告)号：CN119662779A
公开(公告)日：2025-03-21
申请号：CN202411914141.4
申请日：2024-12-24
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6841 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种时空转录组学方法，包括如下步骤：步骤一，构建空间转录组测序芯片，所述空间转录组测序芯片上设有具空间坐标的捕获探针；步骤二，采用核苷酸类似物进行代谢标记，标记完成后进行冷冻包埋切片，将切好的组织切片贴在测序芯片上，固定透化以使细胞释放mRNA被空间转录组测序芯片上的捕获探针原位捕获；步骤三，用核苷转化试剂处理进行处理，引起对应cDNA中碱基突变，从而将新生的RNA与原来的RNA区分开来；步骤四，分析不同外部刺激时间下RNA的动态变化。
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公开(公告)号：CN119506404A
公开(公告)日：2025-02-25
申请号：CN202411736983.5
申请日：2024-11-29
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/6841 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种时空分辨单细胞转录组检测方法，首先利用代谢标记技术对细胞在特定时间内新生成的RNA进行特异性标记，以确保能够精确识别和追踪新生RNA分子；随后，通过邻位滚环扩增技术(PLA‑RCA)实现新生RNA靶标的信号放大，提高检测灵敏度；最后，利用原位荧光测序技术实现对新生RNA的高通量分析，这一步骤能够对单细胞内的新生RNA进行精确的空间定位和定量。通过本发明，可为单细胞转录组提供时间及空间分辨率分析，从而帮助解析细胞分化、疾病发生以及细胞功能响应等复杂的生物学过程；而且对于揭示细胞生物学过程中的分子机制具有重要意义，为疾病诊断和治疗提供了新的视角和工具。
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公开(公告)号：CN114752476B
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202210366793.3
申请日：2022-04-08
Applicant: 厦门大学
IPC: C12M1/24 , C12M1/00 , B01L3/00 , C12Q1/6806 , C12Q1/6844
Abstract: 本发明涉及到用于单细胞捕获以及离心液滴生成的装置及其应用，该装置设计了双层微孔结构，方便完成单个细胞的捕获，解决了液滴MDA需要繁琐的单细胞分离的缺点。将该结构整合在管盖中，方便试剂的添加以及液体的转移。另外，还设计了一种离心驱动的液滴生成结构，通过单细胞捕获芯片分离出单个细胞并加入裂解液和PBS缓冲液，裂解释放细胞基因组DNA。随后加入终止缓冲液终止分裂，并加入MDA扩增试剂后生成乳化液滴。本发明方便液滴的生成，解决了传统液滴生成方法成本高，时间长，操作繁琐等缺点。此外，两种装置可以非常好的整合在一起，形成一管式平台，实现单细胞捕获，液滴生成等集成化操作。该平台有望广泛的应用于基础研究以及临床诊断。
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公开(公告)号：CN114354913B
公开(公告)日：2024-07-19
申请号：CN202111675939.4
申请日：2021-12-31
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了一种外泌体PD‑L1糖基化检测方法，包括如下步骤：1)用PD‑L1适体即序列PDL1‑S‑T1，标记外泌体PD‑L1；2)通过修饰环炔基DBCO的DNA即序列DBCO‑S‑T2，与代谢标记的外泌体表面糖上叠氮的无铜环加成反应标记外泌体的糖；3)加入DNA连接臂，所述的连接臂分别具有和序列PDL1‑S‑T1的至少一段互补的序列以及和序列DBCO‑S‑T2的至少一段互补的序列；4)加入探针H1和H2，其中，所述的探针H1和探针H2互补，且其中一探针分别具有和序列PDL1‑S‑T1的至少一段互补的序列以及和序列DBCO‑S‑T2的至少一段互补的序列；5)扩增，检测扩增信号，得到外泌体PD‑L1糖基化信息。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118109538A
公开(公告)日：2024-05-31
申请号：CN202410348667.4
申请日：2024-03-26
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明公开了一种用于提升酶促界面寡核苷酸链合成效率的方法，包括如下步骤：(1)通过DNA折纸技术合成自组装框架核酸结构，所述自组装框架核酸结构的顶部具有一DNA合成引发链，底面具有若干界面修饰基团；(2)将所述自组装框架核酸结构通过所述界面修饰基团共价修饰于反应界面，使得所述DNA合成引发链相对于所述反应界面垂直有序排布；(3)采用介导DNA合成的酶以所述DNA合成引发链为基础合成目标寡聚核苷酸链。本发明中的自组装框架核酸结构可以使引发链处于有序垂直状态，降低核苷酸合成的错误率，提升核苷酸链的酶促合成效率与合成链长。
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公开(公告)号：CN117789833A
公开(公告)日：2024-03-29
申请号：CN202410030927.3
申请日：2024-01-09
Applicant: 厦门大学
Abstract: 一种基于高通量的单细胞分泌物测序技术的解码分析方法，可将单细胞水平的下机测序数据转化细胞分泌物表达矩阵以供下游进一步生信解析。测序结果解码流程本质上分为条码提取、比对校准、质控定量、种群分离计算和分泌物谱图构建。条码提取步骤用于配对序列合并以及提取对应位置的条码。比对校准用于将提取的序列实际条码逐个匹配条码库已知参考序列并进行修剪校正。质控步骤中输出测序质量评估指标文件，定量步骤用于统计生成细胞分泌物表达矩阵。种群分离计算和分泌物谱图则用于测序技术可行性验证和应用解析。该分析方法适用于基于SCS‑seq高通量测序技术下的单细胞分泌物表达图谱解析，在单细胞分泌组学分析领域具有广泛的适用性。
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公开(公告)号：CN115449511B
公开(公告)日：2024-01-12
申请号：CN202211040291.8
申请日：2022-08-29
Applicant: 厦门大学
IPC: C12N5/09 , G01N33/569
Abstract: 本发明公开了一种基于代谢标记策略的新生肿瘤源外泌体选择性分离方法，包括如下步骤：1)非天然糖对肿瘤靶标进行糖代谢标记使得新生外泌体带有叠氮基团；2)分离外泌体或获取具有外泌体的样品；3)在步骤2)的外泌体或具有外泌体的样品中加入能与靶标蛋白以及叠氮基团反应的捕获连接体，所述的捕获连接体为DBCO‑肿瘤靶标蛋白适配体‑Biotin；4)接着加入单链DNA结合蛋白SSB；5)对修饰上捕获连接体的外泌体进行捕获及分离，得到的外泌体即定义为新生肿瘤源外泌体。本发明方法可以在不改变外泌体表面蛋白表达的情况下在混合体系样本中靶向亲和识别新生肿瘤源外泌体，从而更有效的进行新生肿瘤源外泌体分析。
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公开(公告)号：CN117071082A
公开(公告)日：2023-11-17
申请号：CN202311034957.3
申请日：2023-08-17
Applicant: 厦门大学
Abstract: 本发明公开了一种基于数字微流控芯片的单细胞双组学共建库方法，基于采用lift‑off工艺制成的数字微流控芯片进行。本发明能够构建甲基化组和转录组二合一测序文库，通过分析测序数据中的甲基化信息区分二者，无需物理分离DNA和RNA并分开制备文库；具有低成本、高比对率、高覆盖度和高文库复杂度的优点，在甲基化水平和基因表达相关性，细胞分群以及小鼠胚胎干细胞分化的应用研究中表现出色。
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公开(公告)号：CN115896241A
公开(公告)日：2023-04-04
申请号：CN202211486487.X
申请日：2022-11-24
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种基于数字微流控芯片的多个单细胞miRNA测序文库的制备方法，该数字微流控芯片具有依次连通且具有超疏水化表面的至少一储液区、至少一液滴生成通道、一单细胞捕获区和若干文库反应区，至少一储液区、至少一液滴生成通道、一单细胞捕获区和若干文库反应区均具有与数字微流控芯片的驱动电极电连接的电极，该单细胞捕获区具有均匀分布的若干亲水部，每一亲水部对应连通一文库反应区。本发明能够实现高效、自动化和具备选择性的多个单细胞同时分离，能够进行高度并行化的miRNA文库制备，并能够实现高灵敏、低污染和低成本的miRNA检出。
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