一种基于高通量的单细胞分泌物测序技术的解码分析方法

    公开(公告)号:CN117789833A

    公开(公告)日:2024-03-29

    申请号:CN202410030927.3

    申请日:2024-01-09

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 一种基于高通量的单细胞分泌物测序技术的解码分析方法,可将单细胞水平的下机测序数据转化细胞分泌物表达矩阵以供下游进一步生信解析。测序结果解码流程本质上分为条码提取、比对校准、质控定量、种群分离计算和分泌物谱图构建。条码提取步骤用于配对序列合并以及提取对应位置的条码。比对校准用于将提取的序列实际条码逐个匹配条码库已知参考序列并进行修剪校正。质控步骤中输出测序质量评估指标文件,定量步骤用于统计生成细胞分泌物表达矩阵。种群分离计算和分泌物谱图则用于测序技术可行性验证和应用解析。该分析方法适用于基于SCS‑seq高通量测序技术下的单细胞分泌物表达图谱解析,在单细胞分泌组学分析领域具有广泛的适用性。

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