一种基于强化学习的蛋白质进化方法及装置

    公开(公告)号:CN116913393A

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202311172259.X

    申请日:2023-09-12

    Inventor: 张强 陈华钧

    Abstract: 本说明书实施例提供一种基于强化学习的蛋白质进化方法,方法包括:获取各样本蛋白质的特征信息,根据各样本蛋白质的特征信息构建蛋白质变异生成模型和评估模型;由蛋白质变异生成模型在初始蛋白质基础上得到一组变异蛋白质;每得到一组变异蛋白质,使用评估模型评估最新得到的该组变异蛋白质中各变异蛋白质的适应度,并判断适应度是否满足预设条件;若适应度不满足预设条件,则根据最新得到的该组变异蛋白质中各变异蛋白质的适应度对蛋白质变异生成模型进行强化学习,并由经强化学习后的蛋白质变异生成模型,在最新得到的变异蛋白质基础上得到新的一组变异蛋白质;若适应度满足预设条件,则从最新得到的该组变异蛋白质中得到目标进化蛋白质。

    基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法

    公开(公告)号:CN116913379A

    公开(公告)日:2023-10-20

    申请号:CN202310925090.4

    申请日:2023-07-26

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于迭代优化预训练大模型采样的定向蛋白质改造方法,包括:基于蛋白质预训练大模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测,得到候选突变氨基酸的概率分布;根据概率分布采用最优传输距离采样候选突变氨基酸以得到目标突变蛋白质;利用高通量实验设备合成目标突变蛋白质并进行生化测试,得到湿实验标注结果;将带有湿实验标注结果的目标突变蛋白质对模型进行有监督训练,利用训练后的模型对目标蛋白质关键突变位置进行预测并降序排序;依据降序排序筛选多个突变蛋白质,并结合天然蛋白质对大模型做无监督微调;利用微调后的蛋白质预训练大模型,重复上述过程直至达到蛋白质改造预期目标。该方法蛋白质改造效率和准确度高。

    基于多任务预训练逆强化学习的三维空间分子生成方法和装置

    公开(公告)号:CN115831261A

    公开(公告)日:2023-03-21

    申请号:CN202211426292.6

    申请日:2022-11-14

    Abstract: 本发明公开了一种基于多任务预训练逆强化学习的三维空间分子生成方法和装置,采用最小张成树算法依据化学分子构建真实分子生成序列;采用策略网络依据当前分子中间产物生成添加原子动作,以构建预测分子生成序列;以真实分子生成序列和基于策略网络生成的预测分子生成序列同时输入预训练的Transformer模型,基于Transformer模型的回归预测来构建奖励函数,通过奖励函数来训练策略网络,提高策略网络的预测鲁棒性,另外,在构建奖励函数时使真实样本的奖励值最大化且预测样本的奖励值最小化,优化时,智能体采取和专家行为类似的动作,缓解了奖励稀疏的问题,同时提升了参数优化效率。

    一种基于样本-任务关系图的元学习分子属性预测方法

    公开(公告)号:CN115394373A

    公开(公告)日:2022-11-25

    申请号:CN202211005317.5

    申请日:2022-08-22

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于样本‑任务关系图的元学习分子属性预测方法,基于构建的样本‑任务关系图显示地建立样本与任务属性之间的关系,该样本‑任务关系图是目前率先利用样本与任务之间的图结构指导元学习分子属性预测的方法,设计的辅助任务选择器能够顾针对不同的已知目标任务选择辅助任务,以便更好地利用辅助任务增强预测模型对目标任务的预测能力。设计的目标任务选择器能够选择预测模型训练时同一批次内的采样目标任务,作为对比损失函数的负样本挖掘技术。针对采样目标任务的对比损失函数,以便预测模型能够更好地区分不同采样目标任务的同时最大化同一采样目标任务的一致性。

    硅基调制深度可调双级联调制器及其微波光子链路高线性方法

    公开(公告)号:CN110768723B

    公开(公告)日:2020-12-08

    申请号:CN201910954076.0

    申请日:2019-10-09

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种硅基调制深度可调双级联调制器及其微波光子链路高线性方法,该方法通过两个基于载流子耗尽型的硅基MZM1、MZM2和一个TROPS;TROPS级联在MZM1和MZM2之间。激光器输出的光信号经过偏振控制器,通过光纤耦合器耦合到DSMZMs,调制小信号通过50/50的EPS加载DSMZMs上,在链路接收端用光电二极管直接检测。调整TROPS的分配比γ控制MZM2的调制深度,同时调控MZM1和MZM2直流反偏电压以及偏置工作点,使两个调制器中的IMD3信号相互抑制,从而实现了基于硅基调制器的高线性微波光子链路,并从理论上详细推导分析了DSMZMs的FH和IMD3信号变化与反偏直流电压以及γ之间的关系。

    一种具有定向阻尼的插装式溢流阀主阀

    公开(公告)号:CN105805073B

    公开(公告)日:2017-08-25

    申请号:CN201610372904.6

    申请日:2016-05-29

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开一种具有定向阻尼的插装式溢流阀主阀。它的主阀阀套上设置主阀进油口和主阀出油口,控制盖板上设置先导进油口、先导回油口、先导控制油口和控制腔;主阀阀套与控制盖板密封安装在一起,主阀阀芯置于主阀阀套内并伸入到控制腔中,主阀阀芯与主阀阀套间隙配合且主阀阀套侧壁设有主阀出油口;主阀阀芯始终位于控制腔内的部分的侧面上设有环形凹槽,环形凹槽内设置定向阻尼,定向阻尼包括阻尼座、阻尼片、销子和阻尼弹簧,阻尼片将控制腔分为上、下控制腔,阻尼片的上端面与环形凹槽的第二槽壁接触,阻尼片的侧面与控制腔的内壁面间隙配合。本发明能够减小压力超调,减少压力稳定时间,抑制主阀阀芯的高频振动,应用广泛。

    一种电渗增强桩加固软基装置及施工方法

    公开(公告)号:CN105297704A

    公开(公告)日:2016-02-03

    申请号:CN201510745963.9

    申请日:2015-11-05

    Abstract: 本发明公开了一种电渗增强桩加固软基装置及施工方法,包括导电复合材料,所述导电复合材料由粘贴有金属丝的条状碳纤维布组成,导电复合材料通过环氧树脂均匀竖向密贴于预制桩表面;预制桩底部设有钢制桩靴,导电复合材料底端互相联通并置于钢制桩靴内;在导电复合材料外部包裹有一层钢丝网,并沿预制桩每间隔一定距离设置一个固定钢环;导电复合材料顶端通过导线与直流电源的正极相连;预制桩之间的软土地基中插入有导电排水管,导电排水管一方面通过水平排水管与真空泵相连,另外一方面也通过导线与直流电源的负极相连。本发明的有益效果是:消散并且提高桩侧摩阻力,结构合理,质量可靠、施工效率高。

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