肺癌多病灶诊断系统
    42.
    发明授权

    公开(公告)号:CN111304330B

    公开(公告)日:2022-08-23

    申请号:CN202010147633.0

    申请日:2020-03-05

    Inventor: 王凯 程春燕

    Abstract: 本发明涉及医学诊断领域,具体而言,涉及一种肺癌多病灶诊断系统,所述系统包括:样本信息处理模块、第一诊断模块、第二诊断模块以及信息输出模块,第一诊断模块、第二诊断模块根据肺癌致癌的驱动基因和热点突变对病灶来源于多原发还是转移进行判断,从而实现了对肺癌多病灶的分子判定。

    用于预测肿瘤类型的方法、电子设备和计算机存储介质

    公开(公告)号:CN111429968B

    公开(公告)日:2021-06-22

    申请号:CN202010166919.3

    申请日:2020-03-11

    Inventor: 姚鸣 张鹏 王凯

    Abstract: 本公开涉及一种用于预测肿瘤类型的方法、电子设备和计算机存储介质。该方法包括:获取关于待测肿瘤的特征信息;获取关于待测肿瘤的待测样本的基因组测序序列与参考基因组序列的比对结果信息;基于比对结果信息,生成关于多种预定突变类型的突变类型数据;基于特征信息和突变类型数据,生成用于输入预测模型的输入数据;以及经由预测模型,提取输入数据的特征值,以便基于所提取的特征值预测待测肿瘤的类型,预测模型经由对多个训练样本的机器学习模型训练而生成。本公开能够提高预测原发部位的肿瘤的类型的准确性。

    肿瘤免疫治疗预后标志物的筛选方法及应用

    公开(公告)号:CN111863130A

    公开(公告)日:2020-10-30

    申请号:CN202010650063.7

    申请日:2020-07-08

    Abstract: 本发明涉及一种肿瘤免疫治疗预后标志物的筛选方法,包括:获取针对待分析癌种的候选基因群的表达数据、突变数据及临床疗效数据;将所述候选基因群的突变情况与免疫基因组的表达情况做统计学独立性检验,找到与所述免疫基因组相关的基因突变,并按照关联程度由高到低对所述候选基因群中的基因进行排序;其中所述免疫基因组包括CD8A、GZMA、GZMB、IFNγ、EOMES、CXCL9、CXCL10和TBX21;根据前N个基因是否发生突变,分成突变组和非突变组并做生存分析,按照log-rank的变化,选取差异最为显著的M个基因进行保留;将所得基因在独立数据集中进行验证,以确定其突变和预后相关。

    基因变异顺反位置关系检测方法、装置、设备和存储介质

    公开(公告)号:CN111599408A

    公开(公告)日:2020-08-28

    申请号:CN202010295575.6

    申请日:2020-04-15

    Abstract: 本发明涉及一种能够提高检测效率且有利于提高检测结果准确性的基因变异顺反位置关系检测方法、装置、设备和存储介质。该检测方法包括获取基因变异测序数据;按照基因对所述基因变异测序数据中的变异情况进行分组,同一基因内的变异为同一组;针对同一组的任意两个待分析的目标变异,对各唯一比对read,分别获取各类型read的数目;根据获取的各类read的数目检测两个目标变异的顺反位置关系。通过使用上述基因变异顺反位置关系检测方法和装置可以对测序合格的基因变异测序数据进行自动化注释分析,直接判断两个变异是顺式位置关系还是反式位置关系,整个检测过程无需人工手动检测,节省人力成本,并且检测结果的误判或漏判率低。

    用于确定RNA基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质

    公开(公告)号:CN111243669A

    公开(公告)日:2020-06-05

    申请号:CN202010064342.5

    申请日:2020-01-20

    Inventor: 王凯 陈惠 袁少华

    Abstract: 本公开涉及一种用于确定RNA基因融合的方法、电子设备和计算机存储介质。该方法包括:获取关于RNA候选的基因组合的检测数据;响应于确定基因组合属于系统性非特异性组合基因,去除基因组合,系统性非特异性组合基因是基于多个正常样本的RNA候选的基因组合中重复出现的非特异性组合而确定;确定所留下的基因组合的断点是否满足预定条件;以及响应于确定所留下的基因组合的断点满足预定条件,基于组装后读长所对应的基因组合中的每一个基因的比对的唯一性,确定关于RNA融合的阳性结果。本公开能够明显有效降低RNA基因融合检测结果的假阳性。

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