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公开(公告)号：CN102977358A
公开(公告)日：2013-03-20
申请号：CN201210442360.8
申请日：2012-11-07
IPC: C08G65/48 , C08G63/78 , C08G63/688 , C08G63/08 , C08G81/00 , C07D249/04 , C07C323/52 , C07C319/20
Abstract: 本发明公开了一种具有氢键序列特异性组合的模块化合物及其制备方法。所述模块化合物的结构式如下：其中，当R为（m为1～200中任一整数）时，该模块化合物为亲水模块化合物P2；当R为（n为2～140中任一整数）时，该模块化合物对应为疏水模块化合物BLOCK-1、BLOCK-2或BLOCK-3。本发明的模块化合物由于具有氢键序列特异性而且两种互补的单链可以相互特异性地识别、配对从而形成分子胶，所以利用分子胶集团可以方便地制备用其它方法不容易合成的嵌段共聚物。
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公开(公告)号：CN118239996A
公开(公告)日：2024-06-25
申请号：CN202410334815.7
申请日：2024-03-22
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C07H19/23 , C07H1/00 , C09K11/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种荧光标记核苷酸在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构#imgabs0#其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R为苯环；Cleavable Linker为偶氮连接单元；R1是将偶氮连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团，Dye是荧光染料。该结构式通过可裂解连接单元使荧光素与含有芳环的碱基相连。该类荧光标记核苷酸参与DNA延伸、断裂后，残留在碱基上的基团只有苯胺基。本发明在DNA合成测序及单分子测序中，荧光标记核苷酸在参与延伸并断裂反应后，在DNA链上的残基只有苯胺基，在单分子测序中的实验结果表明，有望发展为长读长DNA测序方法，且保持低错误率。
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公开(公告)号：CN117567537A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311526581.8
申请日：2023-11-15
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H23/00 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种基于pH敏感型连接单元的可逆终止核苷酸的合成及其用途，所述pH敏感型可逆终止核苷酸的典型结构是：#imgabs0#该结构式的特点为使用特定结构的pH敏感型三氮烯连接单元将dNTP(包含于#imgabs1#)和荧光素(R3)连接在一起形成可逆终止核苷酸。该可逆终止核苷酸在参与DNA链延伸后，仅需在酸性条件下即可快速发生断裂。断裂后，残留在碱基上的基团较小，有利于DNA合成测序的进行。实验表明该类可逆终止核苷酸具有很好的应用前景；在DNA合成测序及单分子测序中，连接单元断裂快速，反应干净彻底，几乎没有观察到副反应发生；且该类化合物合成简单方便，且可以大量合成，能够极大降低测序成本。
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公开(公告)号：CN117567536A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311527920.4
申请日：2023-11-15
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07H19/10 , C12Q1/6869 , C07H19/14 , C07H19/20 , C09K11/06
Abstract: 本发明公开了一种荧光标记核苷酸在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构#imgabs0#其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R为苯环、炔基或乙烯基；Cleavable Linker为三氮烯连接单元；R1是将三氮烯连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团，Dye是荧光染料。该类荧光标记核苷酸参与DNA延伸、断裂后，残留在碱基上的基团只有苯(胺)基、炔基、乙烯基等含π‑电子基团。本发明在DNA合成测序及单分子测序中，荧光标记核苷酸在参与延伸并断裂反应后，在DNA链上的残基只有苯(胺)基、炔基、乙烯基，有助于DNA测序读长更长且错误率更低。
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公开(公告)号：CN115058494A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210789003.2
申请日：2022-07-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6837 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12M1/38 , G02B21/00 , G02B21/06 , G01J5/48
Abstract: 本发明提供一种全内反射单分子基因测序系统，涉及基因测序技术领域，包括：全内反射测序芯片、成像测温装置、照明装置以及精密位移台；全内反射测序芯片，包含棱镜基板、盖板、固定架以及多片流道板；其中，棱镜基板的上表面与下表面分别与一片流道板贴合，流道板又与一片盖板贴合，所述流道板的中间加工有贯穿上下表面的流道；成像测温装置，包含显微物镜、成像模块、对焦测温模块；照明装置，包含照明镜头、照明镜头位移器以及照明光偏折镜。本发明能够不依赖镜油进行单分子成像的全内反射单分子基因测序，可靠性高，且维护成本低。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108251516B
公开(公告)日：2021-04-02
申请号：CN201711280069.4
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种DNA单分子测序方法与测序系统，所述DNA单分子测序方法包括如下步骤：S1对基体表面进行修饰，将水溶性双功能连接单元连接于基体表面；然后将引物P1与水溶性双功能连接单元连接，即得固定有引物的基体；S2、将含待测DNA模板、聚合酶、四色荧光标记可逆终止剂的混合溶液置于固定有引物P1的基体上，进行延伸，形成含荧光素的引物/模板复合物；S3、对延伸后的引物/模板复合物进行成像，确定参与延伸的核苷酸碱基种类；S4、将参与延伸的核苷酸的可裂解连接单元断裂，进行下一次延伸；S5、重复上述步骤S2至步骤S4，获得待测DNA模板的碱基序列。本发明能够完美地做到一次测序循环只延伸一个可逆终止剂的效果。
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公开(公告)号：CN106177987B
公开(公告)日：2020-06-12
申请号：CN201610680172.7
申请日：2016-08-17
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K47/69 , A61K47/59 , A61K9/107 , A61K31/655 , A61P35/00 , A61K31/7068 , A61K31/7072 , A61K31/4745
Abstract: 本发明公开了一种小分子‑高分子轭合物自组装载药纳米颗粒及其制备方法；本发明采用简单高效的方法将小分子抗癌药和高分子链通过特定基团连接起来，形成自组装纳米胶束，同时利用疏水相互作用包裹一氧化氮前体药物于高分子链段中，得到具有酸敏感性的载药纳米颗粒，能够稳定地输送至肿瘤组织，在肿瘤细胞内酸性环境的刺激下分解释放抗癌药和一氧化氮，可以实现对肿瘤的协同治疗。与现有技术相比，本发明的小分子‑高分子轭合物自组装载药纳米颗粒能够在肿瘤细胞内环境中同时释放抗癌药和一氧化氮，有效降低肿瘤细胞的多药耐药性，明显提升肿瘤的治疗效果，因此在肿瘤的治疗方面有着广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN110343612A
公开(公告)日：2019-10-18
申请号：CN201810308292.3
申请日：2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种基于多色荧光可逆终止核苷酸的DNA单分子测序系统及装置，所述测序系统包括引物、待测DNA模板、多色荧光可逆终止核苷酸测序试剂；所述引物固定在流通池反应器表面；将待测DNA模板与测序引物进行杂交，然后用多色荧光可逆终止核苷酸延伸引物后，检测延伸引物的荧光信号即可得到待测DNA序列信息；所述待测DNA模板的3’端不需要标记定位荧光。本发明通过利用测序循环过程中，延伸反应物的荧光作为下一次延伸的定位荧光，或采用固定在流通池反应器表面的定位荧光标记物作为定位荧光，无需对待测DNA模板的3’端标记定位荧光，从而有效避免了由于淬灭而导致定位信息丢失的问题，可进一步大幅延长测序读长并降低错误率。
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公开(公告)号：CN106588722B
公开(公告)日：2018-08-03
申请号：CN201510684831.X
申请日：2015-10-20
Applicant: 上海交通大学
IPC: C07C323/52 , C07C319/20 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了种硫代缩酮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途。该连接单元的结构式为:其中R=OH或者COOH;R=R=甲基,或R=苯基、对甲氧基苯基、2,4,6‑三甲氧基苯基、萘基或对甲氧基萘基,R=H,或R、R共同构成环己基、环戊基。该连接单元与核苷酸及荧光素连接得到的荧光素标记核苷酸可用于DNA测序。与现有技术相比,本发明合成的基于硫代缩酮结构的连接单元的可逆终止剂用于DNA测序时,其延伸效率接近100%,并且在模板为连续多个相同碱基时,次只延伸个可逆终止剂;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号：CN108251516A
公开(公告)日：2018-07-06
申请号：CN201711280069.4
申请日：2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明提供了一种DNA单分子测序方法与测序系统，所述DNA单分子测序方法包括如下步骤：S1对基体表面进行修饰，将水溶性双功能连接单元连接于基体表面；然后将引物P1与水溶性双功能连接单元连接，即得固定有引物的基体；S2、将含待测DNA模板、聚合酶、四色荧光标记可逆终止剂的混合溶液置于固定有引物P1的基体上，进行延伸，形成含荧光素的引物/模板复合物；S3、对延伸后的引物/模板复合物进行成像，确定参与延伸的核苷酸碱基种类；S4、将参与延伸的核苷酸的可裂解连接单元断裂，进行下一次延伸；S5、重复上述步骤S2至步骤S4，获得待测DNA模板的碱基序列。本发明能够完美地做到一次测序循环只延伸一个可逆终止剂的效果。
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