公开(公告)号：CN111254193A

公开(公告)日：2020-06-09

申请号：CN202010124607.6

申请日：2020-02-27

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  毛湛睿 ,  王昱欢 ,  康亦馨

IPC: C12Q1/6883 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供了一种DNA甲基化标志物PCYT1A在制备诊断PCOS试剂盒中的应用，属于生物医药技术领域。本发明首次发现相对于正常组织，PCYT1A基因的表达水平和启动子区DNA甲基化水平在PCOS患者卵巢颗粒细胞中呈现显著性差异，可作为PCOS相关的生物标志物，开发为PCOS诊断检测试剂盒；本发明还通过检测卵巢颗粒细胞样品中的，PCYT1A基因的表达水平和启动子区DNA甲基化水平，可以快速、准确及清楚的确定PCOS的发生。

公开(公告)号：CN105542024B

公开(公告)日：2018-11-20

申请号：CN201610006118.4

申请日：2016-01-06

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  赵小东 ,  邵志峰

IPC: C08B37/00 ,  A61K36/04 ,  A61P35/00

Abstract: 本发明公开了一种来自红藻类植物龙须菜的海洋中药龙须菜多糖，还首次揭示了其作为抗肿瘤药物，尤其是顺铂的增效剂的增效作用，可作为抗肿瘤药物的增效剂。还公开了该龙须菜多糖在制备治疗肿瘤的药物、保健品或食品中的应用，其主要通过抑制肿瘤细胞的生长和增殖达到抗肿瘤作用。对胃腺癌、肺癌和子宫颈癌都有抗肿瘤作用。本发明还公开了龙须菜多糖的制备方法，及其抗肿瘤作用的检测方法。本发明为龙须菜作为海洋药物资源的进一步利用提供了新的途径，本发明的龙须菜多糖在制备抗肿瘤药物、防癌保健品或食品中的用途，也为治疗或预防肿瘤的药物开发提供了新的选择。

公开(公告)号：CN108796057A

公开(公告)日：2018-11-13

申请号：CN201810698578.7

申请日：2018-06-29

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  赵小东 ,  邵志峰 ,  胡丛霞

IPC: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q2535/122 ,  C12Q2523/301 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2521/531

Abstract: 本发明公开了一种少量样品全基因组DNA甲基化的检测方法，涉及一种通过改进基于高通量测序的MeDIP‑Seq技术来检测少量样品(300pg DNA或50个细胞)全基因组DNA甲基化的方法。本发明通过在少量起始样品中补加含dUTP的λDNA以减少样品损失并提高建库和免疫沉淀反应的效率，通过USER酶对MeDIP‑DNA进行消化以除去补加的甲基化λDNA，避免了甲基化λDNA对待测甲基化样品测序文库的污染。本发明需样品量为300pg DNA或50个细胞，更加适用于少量来源样品的MeDIP‑Seq分析且本发明的MeDIP实验技术及其配套试剂盒的操作方法简便高效，不需要特定的商品化试剂盒和实验设备，成本较低，具有较广泛的适用性和通用性。

公开(公告)号：CN106074594A

公开(公告)日：2016-11-09

申请号：CN201610561746.9

申请日：2016-07-15

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 康亚妮 ,  赵小东 ,  邵志峰 ,  赖伊杰 ,  周盘婷 ,  杨炎昕

IPC: A61K31/715 ,  A61P35/00

CPC classification number: A61K31/715 ,  A61K36/04

Abstract: 本发明公开了龙须菜多糖作为抑癌基因甲基化抑制剂的新用途及其在制备抗肿瘤药物中的应用，还公开了一种含龙须菜多糖的去甲基化试剂盒。本发明首次从DNA甲基化角度揭示了海洋中药龙须菜多糖抗肺癌作用的表观遗传学调控机制，发现肺癌、胃癌和宫颈癌细胞中SHP1、RARβ、MGMT、GADD45A、RASSF1A等抑癌基因表现为高甲基化状态，其基因表达关闭或表现为低表达，而龙须菜多糖对这些抑癌基因具有去甲基化和恢复表达的转录调节作用，这表明龙须菜多糖是潜在的甲基化抑制剂，在制备抗肿瘤药物中的应用中具有可观前景。

公开(公告)号：CN105154567A

公开(公告)日：2015-12-16

申请号：CN201510672118.3

申请日：2015-10-16

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 赵小东 ,  邵志峰 ,  康亚妮 ,  戚颖

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6869 ,  C12Q2531/119 ,  C12Q2525/191 ,  C12Q2535/122

Abstract: 本发明公开了一种基于高通量测序的研究与目标蛋白结合的RNA的方法，提供了一种反转录随机引物，包括形成发卡结构的碱基序列以及随机碱基序列，形成发卡结构的碱基序列包括用于识别RNA链信息的条码碱基序列和与测序引物部分相同的碱基序列。还提供了一种双链接头，所述双链接头的一条链包括与测序引物碱基序列中的一部分相同的碱基序列，并且，相对于配对的另一条链，在3’端还具有突出的随机碱基序列。该方法主要包括以下步骤：将获得的与目标蛋白结合的RNA利用反转录随机引物反转录合成第一链cDNA；酶消化过量反转录随机引物并碱解RNA；双链接头与所述第一链cDNA退火杂交，引入已知序列，随后引入测序引物，最终形成双端测序文库用于测序。

公开(公告)号：CN104673785A

公开(公告)日：2015-06-03

申请号：CN201510076248.0

申请日：2015-02-12

Applicant: 上海交通大学

Inventor： 赵小东 ,  邵志峰 ,  康亚妮 ,  陈健

IPC: C12N15/10 ,  C12Q1/68 ,  C40B50/06

Abstract: 本发明公开了一种链特异性全基因组范围内研究APA的方法SS-3T-seq，该方法是用于在全基因组范围内研究APA变化，首先构建一种特殊的含有oligo dT的磁珠，用这种磁珠筛选含有多聚A的RNA，然后在磁珠上逆转录合成第一链cDNA，逆转录体系中用甲基化的dCTP替代正常的dCTP，然后用特殊的dNTP(dUTP代替dTTP)合成双链cDNA。经过断裂后磁珠上留下的即为含有APA位点的片段，再经过Gsu I酶切除去多聚A结构，将目的片段从磁珠上释放下来，两端经过修饰后添加Illumina测序接头，经过片段大小筛选，USER酶处理以除去第二链中dUTP，只剩余第一链做PCR扩增，即得到可用于Illumina二代测序的含有链的信息的文库。本方法实验操作简单，降低了步骤繁琐引起的损失，同时降低了实验难度和造价，非常适合推广。