公开(公告)号：CN105349674A

公开(公告)日：2016-02-24

申请号：CN201510867756.0

申请日：2015-11-30

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  刘梅 ,  李波 ,  徐瑶 ,  蓝贤勇 ,  黄永震 ,  白跃宇

IPC: C12Q1/68

CPC classification number: C12Q1/6851 ,  C12Q1/6888 ,  C12Q2600/124 ,  C12Q2531/113 ,  C12Q2545/113 ,  C12Q2563/107

Abstract: 本发明公开了一种与秦川牛生长相关的CNV标记的检测方法与应用：所述的CNV标记是指牛SHH基因候选区域Chr 4:118264951-118267170的拷贝数变异，该检测方法是以秦川牛的基因组DNA为模板，以引物对P1和P2为引物，通过实时荧光定量PCR分别扩增秦川牛SHH基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，从而鉴定秦川牛SHH基因的拷贝数变异。本发明可在DNA水平上检测与秦川牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为秦川牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。

公开(公告)号：CN107034282B

公开(公告)日：2020-04-07

申请号：CN201710326788.9

申请日：2017-05-10

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  彭文文 ,  白跃宇 ,  蓝贤勇 ,  黄永震 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/6858 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明公开了一种快速检测黄牛KCNJ12基因SNP的RFLP方法及其应用，以黄牛全基因组DNA为模板，PCR扩增黄牛KCNJ12基因的相应序列，用限制性内切酶PstI消化PCR扩增产物，再对酶切后的片段进行琼脂糖凝胶电泳，根据琼脂糖凝胶电泳结果鉴定KCNJ12基因单核苷酸多态性。本发明提供的检测方法可用于中国黄牛生长性状的标记辅助选择，加快地方黄牛品种改良。

公开(公告)号：CN107130025B

公开(公告)日：2019-11-08

申请号：CN201710327145.6

申请日：2017-05-10

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  刘鲲鹏 ,  白跃宇 ,  杨嘉蒙 ,  孙雨佳 ,  蓝贤勇 ,  黄永震 ,  马玉林

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6858

Abstract: 本发明公开了一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用。该检测方法以待测黄牛全基因组DNA为模板，通过Touch‑down PCR程序同时扩增黄牛FoxO1基因第二内含子区插入缺失位点，根据琼脂糖凝胶电泳结果，同时鉴定黄牛FoxO1基因存在的2个插入缺失位点(Indel3：rs383545622；Indel4：rs525318770)的基因型。本发明提供的检测方法为FoxO1基因的2个Indel位点多态性与中国黄牛生长性状关系的建立奠定了基础，以便FoxO1基因的两个插入缺失突变可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

公开(公告)号：CN107130025A

公开(公告)日：2017-09-05

申请号：CN201710327145.6

申请日：2017-05-10

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  刘鲲鹏 ,  白跃宇 ,  杨嘉蒙 ,  孙雨佳 ,  蓝贤勇 ,  黄永震 ,  马玉林

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种同时检测黄牛FoxO1基因两个插入缺失位点的方法及其应用。该检测方法以待测黄牛全基因组DNA为模板，通过Touch‑down PCR程序同时扩增黄牛FoxO1基因第二内含子区插入缺失位点，根据琼脂糖凝胶电泳结果，同时鉴定黄牛FoxO1基因存在的2个插入缺失位点(Indel3：rs383545622；Indel4：rs525318770)的基因型。本发明提供的检测方法为FoxO1基因的2个Indel位点多态性与中国黄牛生长性状关系的建立奠定了基础，以便FoxO1基因的两个插入缺失突变可用于中国黄牛肉用生长性状的标记辅助选择，快速建立遗传资源优良的黄牛种群。

公开(公告)号：CN106755422A

公开(公告)日：2017-05-31

申请号：CN201611219653.4

申请日：2016-12-26

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  李波 ,  刘梅 ,  白跃宇 ,  蓝贤勇 ,  黄永震 ,  雷初朝

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种与黄牛生长性状相关的MEG3基因SNP的检测方法及其应用，根据黄牛MEG3基因外显子区单核苷酸突变位点所在位置，采用PCR‑RFLP、Tetra‑primer ARMS‑PCR技术对黄牛个体进行分型，分型结果与生长数据关联分析。本发明提供的检测方法是在DNA水平上检测与黄牛生产性状密切相关的SNP标记，可用于中国黄牛品种生长性状标记辅助选择中，加快建立优良黄牛种群。

公开(公告)号：CN105506111A

公开(公告)日：2016-04-20

申请号：CN201511030253.4

申请日：2015-12-31

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 陈宏 ,  刘梅 ,  白跃宇 ,  李波 ,  杨明娟 ,  蓝贤勇 ,  黄永震

IPC: C12Q1/68

Abstract: 本发明公开了一种检测南阳牛MAPK10基因CNV标记的方法及其应用：以南阳牛的血液全基因组DNA为模板，通过实时荧光定量PCR方法分别扩增南阳牛MAPK10基因CNV区域和内参基因BTF3，根据log22-ΔΔCt将结果分为插入型、缺失型和正常型，鉴定南阳牛MAPK10基因的拷贝数变异。与南阳牛生产数据的关联分析显示，MAPK10不同拷贝数对南阳牛的生长发育有显著影响，其中正常型个体的初生重、18月龄体高和24月龄体重和日增重均显著高于插入型和缺失型个体。本发明在DNA水平上检测与南阳牛生产性状密切相关的CNV标记，可作为中国南阳牛生长性状的标记辅助选择的重要候选分子标记。