公开(公告)号：CN114023381B

公开(公告)日：2022-03-22

申请号：CN202111677030.2

申请日：2021-12-31

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司

Inventor： 杨滢 ,  张娇 ,  李菲菲 ,  陶威 ,  张亚晰 ,  何骥 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: G16B20/30 ,  G16B30/10

Abstract: 本发明公开了一种肺癌MRD融合基因判定方法、装置、存储介质及设备，属于医学检测技术领域。包括接收肿瘤组织、肿瘤血细胞和血浆的测序数据；根据所述肿瘤组织的测序数据，利用第一检测软件和第二检测软件进行融合基因分析，得到第一融合基因序列和第二融合基因序列；在肿瘤血细胞和血浆的测序数据中追踪所述第一融合基因序列和第二融合基因序列，得到第一融合基因；对所述第一融合基因通过过滤血细胞中的融合基因，判定最终的经典融合基因。所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够对肺癌MRD融合基因进行准确判定。

公开(公告)号：CN112029861B

公开(公告)日：2021-09-21

申请号：CN202010927039.3

申请日：2020-09-07

Applicant: 臻悦生物科技江苏有限公司 ,  臻和(北京)生物科技有限公司

Inventor： 石贺欣 ,  于佳宁 ,  洪媛媛 ,  陈敏浚 ,  杨滢 ,  侯军艳 ,  吕红 ,  陈维之 ,  郑杉 ,  何骥 ,  杜波

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/50 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了一种基于捕获测序技术的肿瘤突变负荷检测装置及方法，其中，装置中包括：panel设计模块，用于在基因组中均匀增加人群SNP位点，筛选与WES一致性最高的基因区域；数据获取模块，用于获取目标对象的组织和血浆样本，获取其测序数据；比对模块，用于将测序数据与参考基因组比对，获取变异数据结果；体细胞突变分析模块，用于对变异数据结果进行体细胞分析得到体细胞突变结果；过滤模块，用于去除体细胞突变结果中的非真实突变位点；计算模块，用于计算肿瘤突变负荷TMB。其在充分提高设计panel与WES的TMB一致性的前提下，全面提高各个环节的准确性，尤其提高panel设计的针对性、准确性和可靠性；提高不同深度、不同纯度、不同肿瘤占比的特殊组织或血浆样本的检测准确性。

公开(公告)号：CN112029861A

公开(公告)日：2020-12-04

申请号：CN202010927039.3

申请日：2020-09-07

Applicant: 臻悦生物科技江苏有限公司 ,  臻和(北京)生物科技有限公司

Inventor： 石贺欣 ,  于佳宁 ,  洪媛媛 ,  陈敏浚 ,  杨滢 ,  侯军艳 ,  吕红 ,  陈维之 ,  郑杉 ,  何骥 ,  杜波

IPC: C12Q1/6886 ,  C12Q1/6869 ,  G16B20/50 ,  G16B40/00 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了一种基于捕获测序技术的肿瘤突变负荷检测装置及方法，其中，装置中包括：panel设计模块，用于在基因组中均匀增加人群SNP位点，筛选与WES一致性最高的基因区域；数据获取模块，用于获取目标对象的组织和血浆样本，获取其测序数据；比对模块，用于将测序数据与参考基因组比对，获取变异数据结果；体细胞突变分析模块，用于对变异数据结果进行体细胞分析得到体细胞突变结果；过滤模块，用于去除体细胞突变结果中的非真实突变位点；计算模块，用于计算肿瘤突变负荷TMB。其在充分提高设计panel与WES的TMB一致性的前提下，全面提高各个环节的准确性，尤其提高panel设计的针对性、准确性和可靠性；提高不同深度、不同纯度、不同肿瘤占比的特殊组织或血浆样本的检测准确性。

公开(公告)号：CN117576085A

公开(公告)日：2024-02-20

申请号：CN202410037266.7

申请日：2024-01-10

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  臻悦生物科技江苏有限公司

Inventor： 杨滢 ,  白雪娟 ,  张娇 ,  邓丽莎 ,  王宾 ,  陈维之

IPC: G06T7/00 ,  G06T7/70 ,  G16H50/30 ,  G16H50/20 ,  G01N21/64

Abstract: 本发明公开一种基于全局莫兰指数的结肠癌预后预测方法及系统，获取结肠癌组织样品切片的全切片数字图像，所述结肠癌组织样品切片经染色及荧光免疫标记处理；提取数字图像中核心肿瘤区域中所有细胞的坐标，以及每个细胞的荧光强度值，并预设阳性阈值，筛选出超过阳性阈值的荧光强度值；基于筛选出的荧光强度值及对应的坐标值计算核心肿瘤区域的莫兰指数；获取莫兰指数的最佳截断值，基于最佳截断值将样品划分至不同风险组。本发明的量化指标考虑了整个肿瘤区域内的T细胞分布情况，同时顾及T细胞表达量的影响，指标覆盖的信息更全面，为评估结肠癌患者的预后提供新的指标和方法。

公开(公告)号：CN116913380A

公开(公告)日：2023-10-20

申请号：CN202311168288.9

申请日：2023-09-12

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  武汉臻和医学检验实验室有限公司

Inventor： 李菲菲 ,  张娇 ,  杨滢 ,  马婷 ,  徐丽娣 ,  黄宇 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: G16B20/50 ,  G16B30/00

Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置，属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据，构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱；根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号；基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重，评估治疗对位点变异频率变化的贡献度，降低测序和分析造成波动的影响，对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量，评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定，可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。