基于结构及药代动力学的物质结构优化指导方法和系统

    公开(公告)号:CN110648725A

    公开(公告)日:2020-01-03

    申请号:CN201910772506.7

    申请日:2019-08-21

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本申请涉及一种基于结构及药代动力学性质的物质结构优化指导方法及系统,选取了化合成药分析中的10条重要性质,针对根据性质和结构两方面因素为化合物匹配出已上市药物的研发中最相近的分子结构,并提供其从分子结构到成药的优化过程,用于指导新药化合物分子的结构优化。通过本发明的基于结构及药代动力学性质的物质结构优化指导方法及系统,可以为化合物匹配已上市药物的研发中最相近的分子结构,有助于药物研发人员对比化合物的基本情况。

    一种定量检测AKAP12甲基化水平的方法及其应用

    公开(公告)号:CN102021233B

    公开(公告)日:2014-06-04

    申请号:CN200910196054.9

    申请日:2009-09-22

    Abstract: 本发明属表观遗传学领域,涉及肿瘤的基因诊断,具体涉及AKAP12基因启动子区域的甲基化,尤其对人AKAP12基因甲基化程度的检测。本发明提供了一种定量检测AKAP12甲基化水平的方法,分别以样品和标准品的DNA为模板进行PCR扩增,进行高分辨率熔解曲线分析,然后根据每个标准品其差异显示的荧光强度建立标准曲线,最后将样品与标准品的曲线比较获得样品AKAP12甲基化百分比。本方法能检测低至1%的甲基化发生,且重复性高、简便易行,特别是对无法作组织取样的肿瘤患者的早期诊断、疾病进程的评估、微转移或复发等全方位监控,可以作为肿瘤,尤其是结直肠癌的辅助诊断、监测和治疗。

    一种从水稻中克隆出的Osfad8P启动子及其应用

    公开(公告)号:CN101886073B

    公开(公告)日:2012-10-24

    申请号:CN201010182410.4

    申请日:2010-05-12

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: Y02A40/14

    Abstract: 本发明属于分子生物学、基因工程技术领域,本发明提供了一种新的水稻中的冷诱导型启动子,即水稻叶绿体ω-3脂肪酸脱氢酶蛋白基因上游的启动子。将该启动子导入植物在低温度(4℃-15℃)处理下,能够促进下游基因的表达,在常温下对植物的基因表达没有影响。本发明的启动子可应用于低温诱导表达,包含其在特定的条件下启动下游基因的表达以及目的基因表达量随温度改变而改变,为水稻的分子育种-改造水稻抗性方面提出了新思路,可以通过温度的精确调控而提高其产量。

    一株含有基因组岛KpGI-2的肺炎克雷伯菌株

    公开(公告)号:CN101560480B

    公开(公告)日:2012-10-24

    申请号:CN200910006605.0

    申请日:2009-01-24

    Abstract: 本发明属于微生物动物细胞系领域,涉及一株携带有与细菌生长有关的新基因组岛KpGI-2的肺炎克雷伯临床耐药菌株HS04160。已于2008年6月25日保藏,保藏单位:CGMCC,北京市朝阳区大屯路,中国科学院微生物研究所,保藏编号:CGMCC No.2558,分类命名:肺炎克雷伯菌Klebsiella pneumoniae。本发明通过对肺炎克雷伯临床耐药菌株的筛选,得到6.4kb的基因序列并证明其属新的基因组岛,细菌活细胞计数试验证明KpGI-2中携带的基因对细菌的生长分别具有促进/抑制作用,提示该基因组岛与细菌生长相关。本发明实验显示,KpGI-2参与了肺炎克雷伯临床菌株感染的致病过程。所述的的含有基因组岛KpGI-2的菌株对于肺炎克雷伯菌株的致病与耐药有着重要影响。

    水稻脂肪酸脱氢酶基因OsFAD2编码序列及其功能应用

    公开(公告)号:CN101812470B

    公开(公告)日:2012-05-23

    申请号:CN200910197202.9

    申请日:2009-10-15

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于分子生物学和基因工程技术领域,具体涉及一种在水稻中表达的脂肪酸脱氢酶基因OsFAD2及其应用。经检测显示,OsFAD2在植物的各个器官中均有表达;在根中,黑暗处理条件下OsFAD2在表皮细胞中的表达量有所上升,在叶中,OsFAD2在叶肉细胞和维管束组织中的表达量有所下调;而冷胁迫下OsFAD2的表达量与对照相比在各个组织中分布无明显变化。OsFAD2在激素处理后的水稻幼苗中的表达显示,OsFAD2对6-BA和KT较GA3更加敏感,mRNA表达量上升,对应的亚油酸积累量增加。转化OsFAD2的蛙卵细胞的荧光强度高,pH值升高,表示转化基因OsFAD2的蛙卵内存在油酸到亚油酸的转化。

    一种定量检测AKAP12甲基化水平的方法及其应用

    公开(公告)号:CN102021233A

    公开(公告)日:2011-04-20

    申请号:CN200910196054.9

    申请日:2009-09-22

    Abstract: 本发明属表观遗传学领域,涉及肿瘤的基因诊断,具体涉及AKAP12基因启动子区域的甲基化,尤其对人AKAP12基因甲基化程度的检测。本发明提供了一种定量检测AKAP12甲基化水平的方法,分别以样品和标准品的DNA为模板进行PCR扩增,进行高分辨率熔解曲线分析,然后根据每个标准品其差异显示的荧光强度建立标准曲线,最后将样品与标准品的曲线比较获得样品AKAP12甲基化百分比。本方法能检测低至1%的甲基化发生,且重复性高、简便易行,特别是对无法作组织取样的肿瘤患者的早期诊断、疾病进程的评估、微转移或复发等全方位监控,可以作为肿瘤,尤其是结直肠癌的辅助诊断、监测和治疗。

    蝴蝶兰PhAGCu基因编码序列及其应用

    公开(公告)号:CN101250532B

    公开(公告)日:2011-04-06

    申请号:CN200710047183.2

    申请日:2007-10-18

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于分子生物学、基因工程技术领域,具体为一种在蝴蝶兰中表达的AGAMOUS-like基因家族的PhAGCu基因的核苷酸编码序列及其在改变花发育,成花转变和形态构建方面的应用。本发明涉及的蝴蝶兰PhAGCu基因具有特定序列的DNA分子,全长950bp,包括一个717bp开放读框,其核苷酸序列为SEQ ID NO.1。本发明还包含上述基因的重组表达载体,转基因植株,获得此基因的核苷酸引物系列,用于检测内源表达模式的寡核苷酸探针序列,以及对蝴蝶兰此内源基因的表达模式进行分析鉴定的方法。将本发明所说基因转入烟草,所获得的转基因植株的花的形状及结的种子都发生明显变化,表明该基因可影响植株有性器官的发育。

    一种从水稻中克隆出的Osfad8P启动子及其应用

    公开(公告)号:CN101886073A

    公开(公告)日:2010-11-17

    申请号:CN201010182410.4

    申请日:2010-05-12

    Applicant: 复旦大学

    CPC classification number: Y02A40/14

    Abstract: 本发明属于分子生物学、基因工程技术领域,本发明提供了一种新的水稻中的冷诱导型启动子,即水稻叶绿体ω-3脂肪酸脱氢酶蛋白基因上游的启动子。将该启动子导入植物在低温度(4℃-15℃)处理下,能够促进下游基因的表达,在常温下对植物的基因表达没有影响。本发明的启动子可应用于低温诱导表达,包含其在特定的条件下启动下游基因的表达以及目的基因表达量随温度改变而改变,为水稻的分子育种-改造水稻抗性方面提出了新思路,可以通过温度的精确调控而提高其产量。

    蝴蝶兰PhPI9基因编码序列及其应用

    公开(公告)号:CN101200723A

    公开(公告)日:2008-06-18

    申请号:CN200710047185.1

    申请日:2007-10-18

    Applicant: 复旦大学

    Abstract: 本发明属于分子生物学和基因工程技术领域,具体为一种在蝴蝶兰中表达的花发育相关的MADS-box基因(PhPI9)的编码序列及其在改变植物花的形态和发育的应用。本发明涉及包含上述基因的重组表达载体。还涉及所说的表达载体转化植物细胞,以及由转化细胞产生的所说基因的转基因植物。本发明将所说基因在植物中表达,所获得的转基因植物花型较野生有明显改变,花筒和花瓣开裂,花瓣冗余,萼片雄蕊化与少量出现花瓣化雄蕊。

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