一种血浆代谢标志物筛选方法、设备、介质及产品

    公开(公告)号:CN119068993A

    公开(公告)日:2024-12-03

    申请号:CN202411029230.0

    申请日:2024-07-30

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本申请公开了一种血浆代谢标志物筛选方法、设备、介质及产品,涉及血浆代谢标志物筛选技术领域,该方法包括:利用液相色谱质谱联用技术对血浆样本集合中每个血浆样本进行处理,得到每个血浆样本对应的原始代谢指纹图谱并进行第一特征提取处理,得到每个血浆样本对应的第一特征矩阵;以第一特征矩阵为输入,以标签为输出,对支持向量机模型进行训练,得到代谢特征序列;根据代谢特征序列,利用贪心算法和支持向量机模型确定血浆代谢标志物集合,本申请通过液相色谱质谱联用技术和贪心算法能够提高血浆代谢标志物筛选的合理性,进而为肾癌早期检测设备的制造提供基础,在降低肾癌筛查人员专业性的同时,提高肾癌早期筛查的自动化水平。

    一种N端延长型PTEN亚型PTENζ蛋白及其编码基因和应用

    公开(公告)号:CN112877309B

    公开(公告)日:2022-05-17

    申请号:CN202110191547.4

    申请日:2021-02-19

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 尹玉新 梁会 汪菡

    Abstract: 本发明提供了一种N端延长型PTEN亚型PTENζ蛋白及其编码基因和应用,属于功能蛋白技术领域。本发明提供的PTEN亚型是在PTEN蛋白基础上在N端连接有一段28aa的多肽,该多肽为一段高尔基定位信号肽段。PTENζ蛋白的翻译起始于5’‑UTR区域的一个非经典的AUG翻译起始位点‑ATT948,该位点下游的回文结构对翻译起始有重要作用。由ATT948起始翻译得到431个氨基酸序列的蛋白命名为PTENζ。PTENζ主要分布在高尔基体和细胞膜。本发明利用CRISPR‑Cas9特异性敲除Hela细胞中PTENζ,利用RUSH系统证实PTENζ特异性敲除导致内质网向高尔基体的囊泡运输时显著提高转运速度。

    一种用于肿瘤治疗靶点和诊断生物标志物的circPTEN1及其应用

    公开(公告)号:CN113215158A

    公开(公告)日:2021-08-06

    申请号:CN202110570178.X

    申请日:2021-05-25

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 尹玉新 梁会 郑林

    Abstract: 本发明提供了一种用于肿瘤治疗靶点和诊断生物标志物的circPTEN1及其应用,属于生物技术领域。用于肿瘤治疗靶点和诊断生物标志物的circPTEN1,核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,为PTEN mRNA第1~5外显子反向剪接形成的新的环状RNA。circPTEN1高表达显著抑制结直肠癌细胞的迁移和侵袭,circPTEN1的表达水平与结直肠癌患者淋巴结转移和远处转移呈负相关,且circPTEN1低表达的结直肠癌患者预后较差。因此,circPTEN1作为肿瘤治疗靶点和诊断生物标志物应用到肿瘤治疗、肿瘤诊断以及肿瘤预后作用评估中,并为治疗相关的药物及诊断产品提供了新思路和新策略。

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