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公开(公告)号：CN117512138A
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202311710140.3
申请日：2023-12-13
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体公开了基于RPA技术检测缅甸蟒的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明筛选出两组缅甸蟒的RPA特异性引物与探针，结合侧流层析试纸条检测法，建立了一种缅甸蟒的RPA‑LFD检测方法。该方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视，且不需要精密仪器，在38℃、50min内即可得到检测结果，能够进行现场检测，省去运输时间，大大降低DNA污染可能。本发明不仅可以用于缅甸蟒组织样DNA的检测，还可以用于环境DNA样本的检测。
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公开(公告)号：CN109022597B
公开(公告)日：2021-12-14
申请号：CN201811062784.5
申请日：2018-09-12
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，具体公开了用于鉴定短颌鲚、湖鲚和刀鲚的SNP分子标记及其应用。发明人前期筛选得到120个在短颌鲚和刀鲚之间具有显著性差异的SNP位点，21个湖鲚和刀鲚之间的差异位点。本发明针对120个位点中分化指数为1的位点，从中挑选20个用于引物设计；针对21个位点中分化指数较高的位点，挑选出10个设计引物。研究结果表明：短颌鲚与刀鲚可以使用以上19个SNP分子标记中的任何一个完全分开。而用于区分湖鲚与刀鲚的10个SNP分子标记中有8个在所测样本中可以扩增并用于物种鉴定。本发明提供了稳定、高效和低成本识别短颌鲚和刀鲚、湖鲚和刀鲚的方法，为今后刀鲚的物种鉴定和资源保护提供了有效的工具。
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公开(公告)号：CN109022597A
公开(公告)日：2018-12-18
申请号：CN201811062784.5
申请日：2018-09-12
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q2600/156 , C12Q2600/16
Abstract: 本发明涉及生物技术领域，具体公开了用于鉴定短颌鲚、湖鲚和刀鲚的SNP分子标记及其应用。发明人前期筛选得到120个在短颌鲚和刀鲚之间具有显著性差异的SNP位点，21个湖鲚和刀鲚之间的差异位点。本发明针对120个位点中分化指数为1的位点，从中挑选20个用于引物设计；针对21个位点中分化指数较高的位点，挑选出10个设计引物。研究结果表明：短颌鲚与刀鲚可以使用以上19个SNP分子标记中的任何一个完全分开。而用于区分湖鲚与刀鲚的10个SNP分子标记中有8个在所测样本中可以扩增并用于物种鉴定。本发明提供了稳定、高效和低成本识别短颌鲚和刀鲚、湖鲚和刀鲚的方法，为今后刀鲚的物种鉴定和资源保护提供了有效的工具。
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公开(公告)号：CN117947174A
公开(公告)日：2024-04-30
申请号：CN202311714669.2
申请日：2023-12-13
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体公开了基于RPA技术野外快速检测鳄雀鳝的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明创新设计方法，筛选出三种优势鳄雀鳝RPA引物探针组合，结合环境DNA技术和侧流层析试纸条检测法，建立了一种鳄雀鳝的RPA‑LFD检测方法。该方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视，且不需要精密仪器，在38℃、50min内即可得到检测结果，适合野外快速监测。
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公开(公告)号：CN117683903A
公开(公告)日：2024-03-12
申请号：CN202311710130.X
申请日：2023-12-13
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于分子生物学和分子生态学技术领域，具体公开了基于RPA技术现场检测齐氏罗非鱼的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明创新设计方法，筛选出一组齐氏罗非鱼的RPA特异性引物与探针，结合侧流层析试纸条检测法，建立了一种齐氏罗非鱼的RPA‑LFD检测方法。该方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视，能够满足环境DNA样本的检测要求；且不需要精密仪器，在38℃、50min内即可得到检测结果，能够实现现场检测，适合野外快速监测。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117683902A
公开(公告)日：2024-03-12
申请号：CN202311710128.2
申请日：2023-12-13
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于分子生物学和分子生态学技术领域，具体公开了基于RPA技术现场检测巴西龟的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明创新设计方法，筛选出两组巴西龟的RPA特异性引物与探针，结合侧流层析试纸条检测法，建立了一种巴西龟的RPA‑LFD检测方法。该方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视，能够满足环境DNA样本的检测要求；且不需要精密仪器，在38℃、50min内即可得到检测结果，能够实现现场检测，适合野外快速监测。
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公开(公告)号：CN117625811A
公开(公告)日：2024-03-01
申请号：CN202311710137.1
申请日：2023-12-13
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12Q1/6804 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于分子生物学和分子生态学技术领域，具体公开了基于RPA技术现场检测食蚊鱼的引物探针组合、试剂盒及方法。本发明创新设计方法，筛选出两组食蚊鱼的RPA特异性引物与探针，结合侧流层析试纸条检测法，建立了一种食蚊鱼的RPA‑LFD检测方法。该方法操作简便、灵敏性高、特异性强、短时间内实现结果可视，能够满足环境DNA样本的检测要求；且不需要精密仪器，在38℃、50min内即可得到检测结果，能够实现现场检测，适合野外快速监测。
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公开(公告)号：CN115992204A
公开(公告)日：2023-04-21
申请号：CN202210999993.2
申请日：2022-08-19
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06 , G16B30/20
Abstract: 本发明属于生物技术领域，具体涉及线粒体DNA的基因文库的建立方法和获取线粒体基因组序列的方法。建立文库的方法为：(1)样本总DNA与RNA探针杂交后，捕获靶序列；(2)收集靶序列并进行扩增，获得扩增后的线粒体DNA。扩增后的DNA进行破碎、平末端修复、连接测序接头和索引PCR，构建文库。所获得基因文库进行测序，并对测序后的结果进行组装。本发明的方案，在构建测序文库之前即对原始的长片段线粒体DNA进行富集，可获得更多线粒体DNA数据，从而提高富集效率，提高线粒体基因组数据量占比和覆盖度，可实现完整组装；同时降低了组装所需的数据量，大大降低测序成本。本发明无需相应物种参考基因组，可以相对快速、经济地获得各种脊椎动物的线粒体全基因组，为建立脊椎动物环境DNA线粒体基因组数据库提供了可行的技术路线。
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公开(公告)号：CN109486924B
公开(公告)日：2022-03-01
申请号：CN201811406204.X
申请日：2018-11-23
Applicant: 上海海洋大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了基于Illumina测序的串联条形码、其标记的DNA文库及其构建方法，包括样本DNA序列破碎、修复序列平末端、序列末端加上串联条形码接头、修复序列空缺并延伸和PCR扩增的步骤构建DNA文库；其中串联条形码为6bp长度的DNA序列，且同时满足最小编辑长度3以内、包含不同碱基的片段、使用不同激光色的碱基且相邻碱基激光色不同和不含有AAA、ACA、CCC、CAC、GGG、GTG、TTT和TGT的碱基序列。通过提前引入串联条形码进行DNA标记，大大减少污染数据不能被识别的可能性，极大改善在DNA文库构建和基因富集过程中非常普遍的样本之间相互污染问题。
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公开(公告)号：CN110097343A
公开(公告)日：2019-08-06
申请号：CN201910380526.X
申请日：2019-05-08
Applicant: 上海海洋大学
Abstract: 本发明提供一种实验室智能办公报表系统，包括至少一用户终端、一云数据平台和至少一移动终端；所述用户终端包括一第一数据处理器和与所述第一数据处理器连接的一报表数据输入模块、一数据验证模块、一第一通信模块和一报表下载模块；所述用户终端和所述移动终端与所述云数据平台通信连接。本发明的一种实验室智能办公报表系统，可实现CMA资质实验室的智能化办公，可实现实验报告的自动生成，以及报告的下载和查询，节省办公人员重复机械繁琐的手动填写的时间。
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