-
公开(公告)号：CN1514008A
公开(公告)日：2004-07-21
申请号：CN03141814.7
申请日：2003-07-25
Applicant: 复旦大学 , 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明为一种普遍适用的植物果糖1，6－二磷酸醛缩酶编码基因保守区的快速克隆方法。其中，包括设计了二对兼并引物XF1和XF2，XR1和XR2，用于巢式PCR方法，对其第一链cDNA进行扩增。PCR得到的DNA片段与果糖1，6－二磷酸醛缩酶编码基因同源，翻译得到的氨基酸序列与果糖1，6－二磷酸醛缩酶高度同源。该序列可用于植物果糖1，6－二磷酸醛缩酶全长cDNA的克隆。
-
公开(公告)号：CN111073985A
公开(公告)日：2020-04-28
申请号：CN202010017846.1
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/10 , C12N15/11 , C12N15/63
Abstract: 本发明公开了一种针对沙门氏菌的快速恒温检测方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
-
公开(公告)号：CN106367501B
公开(公告)日：2020-02-21
申请号：CN201610780485.X
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/42
Abstract: 本发明公开了一种快速恒温检测沙门氏菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增沙门氏菌特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在沙门氏菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
-
公开(公告)号：CN106434900B
公开(公告)日：2020-02-14
申请号：CN201610780489.8
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/63
Abstract: 本发明公开了一种同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
-
公开(公告)号：CN106434900A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610780489.8
申请日：2016-08-30
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明公开了一种同时快速恒温检测创伤弧菌和霍乱弧菌的方法、引物组及试剂盒。所述方法为：从待测样品中提取基因组DNA；以所述基因组DNA为模板，以能扩增创伤弧菌和霍乱弧菌共有特异性序列的引物组为引物，在酶反应体系下进行恒温扩增反应；通过判断反应结果是否为阳性，确定待测样品中是否存在创伤弧菌和/或霍乱弧菌。本发明检测方法具有高灵敏度和高特异性，检测时间短，结果判定简单，操作便捷，成本低，具广泛应用前景。
-
Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN103186716B
公开(公告)日：2017-02-08
申请号：CN201110452666.7
申请日：2011-12-29
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G06F19/22
Abstract: 本发明提供一种基于元基因组学的未知病原的快速鉴定系统及分析方法，运用元基因组学的方法进行未知病原鉴定及分析：包括：测序质量控制系统：对测序数据进行质量分析，把测序质量不合要求的部分去除；Meta-All分析系统：本系统的主体部分,从测序数据分析元基因组中的物种组成结构；NeSSM第二代测序模拟系统：独立部分可以产生模拟的测序数据；病原数据库系统自动更新Meta-All分析系统需要用到的数据库资源；病原组成比较分析单元：根据物种组成表比较不同来源的元基因组病原组成结构的异同，找出与疾病相关性高的病原。本发明的优点在运行元基因组学的方法可以迅速缩小未知病原鉴定的范围，从而加速鉴定的速度，同时对完全未知的病原可以从相似病原进行分析。
-
公开(公告)号：CN103571964B
公开(公告)日：2015-06-10
申请号：CN201310594531.3
申请日：2013-11-21
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种基于RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR策略的基因表达校准值的检测方法，包括：选定外参基因；配制外参基因的RNA与DNA的预混合液；样品中加入预混合液，收集样品RNA和DNA；实时定量荧光PCR，检测待测基因和内参基因RNA拷贝数、内参基因DNA拷贝数以及外参基因RNA和DNA拷贝数，计算得到内参基因的表观表达水平后，再根据公式得到待测基因的表达校准值。本发明还公开了上述方法在PCR array以及表达谱芯片检测分析技术中的应用。本发明将基因的表观表达水平概念和检测方法与传统表达检测体系相结合，以更少的检测反应、更低廉的成本实现更精确的基因表达水平检测，修正由内参基因真实表达水平在不同样本间不恒定所造成的检测结果的不准确。
-
公开(公告)号：CN102789551B
公开(公告)日：2015-02-18
申请号：CN201110125025.0
申请日：2011-05-16
Applicant: 中国科学院上海生命科学研究院 , 上海生物信息技术研究中心 , 上海交通大学
IPC: G06F19/18
Abstract: 本发明公开了用图形处理单元加速元基因组的物种分析的方法和系统，在保持和现有Phymm系统相似准确性的同时，可以比现有的Phymm系统快至少两个数量级。其技术方案为：方法包括：从训练集中预先构建k阶马尔科夫模型；将构建好的k阶马尔科夫模型载入到图形处理单元中；将待分类的序列转换为寡核苷酸频数向量；将寡核苷酸频数向量载入到图形处理单元中；在图形处理单元中计算序列和每一个已知基因组的相似性分数；将这些相似性分数送回主内存；处理器用这些相似性分数最小的基因组的物种信息注释序列。
-
公开(公告)号：CN101538611B
公开(公告)日：2012-09-05
申请号：CN200910049306.5
申请日：2009-04-14
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
Abstract: 本发明涉及生物信息学领域，具体涉及一种RNA和DNA双外参实时定量荧光PCR检测方法及其应用，包括如下步骤：选定外参基因；制备外参基因的mRNA与DNA，配制外参基因的mRNA与DNA的预混合液；在抽提样品时加入预混合液，收集样品中的总mRNA和DNA部分；实时定量荧光PCR，计算待测基因和外参基因mRNA和DNA的拷贝数；数据处理和归一化。本发明还公开了上述方法在基因芯片分析基因表达技术中的应用。本发明改进了对基因转录水平检测的实验设计，可以得到某个基因的真实的转录水平而不是一个相对水平，为基因表达数据和基因拷贝数据的整合提供新的概念和框架。
-
公开(公告)号：CN102507883A
公开(公告)日：2012-06-20
申请号：CN201110364010.X
申请日：2011-11-16
Applicant: 上海生物信息技术研究中心
IPC: G01N33/15
Abstract: 本发明涉及一种基于生物过程预测药物新疗效的方法，以疾病为导向，基于生物过程谱的药物-疾病关联性来预测药物的潜在的新治疗功能，包括以下步骤：(1)构建疾病生物过程谱以及药物生物过程谱；(2)在生物过程谱层面上计算药物-疾病的关联性得分；(3)衡量关联性得分的显著性；(4)筛选有显著性的药物-疾病关系，用户可根据关联性得分排序结果，对药物的功能进行进一步的实验论证。还涉及上述方法在预测药物新疗效中的应用。本发明的预测方法设计巧妙，可以较为全面的评估药物-疾病的关系，对于寻找疾病新的治疗药物，药物潜在毒副作用发现，扩展现有药物的治疗功能空间以及“旧”药新用等有着重要的意义，适于大规模推广应用。
-
-
-
-
-
-
-
-
-
Search Results
60
records
(took 0.046 seconds)
