公开(公告)号：CN110229902A

公开(公告)日：2019-09-13

申请号：CN201910550753.2

申请日：2019-06-24

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司

Inventor： 施巍炜 ,  牟硕 ,  王凯 ,  柳文进 ,  赵松辉

IPC: C12Q1/6886

Abstract: 本发明提供了一种用于胃癌预后预测的评估基因群的确定方法，其特征在于：基于调控RhoA蛋白活性的RhoA蛋白活性调控通路中包括的基因筛选得到含有多个基因的评估基因群，具体包括以下步骤：步骤1，将RhoA基因调控通路中包括的基因作为备选目标基因集合；步骤2，基于用于筛选的每个胃癌样本的备选目标基因集合中各个基因的表达数据以及RhoA基因的表达数据，按预定确定规则确定待定评估基因群；步骤3，基于包括多个胃癌验证样本的胃癌验证样本群根据预定限定方法确定各个胃癌验证样本得到的胃癌预后为良好的所有预后良好样本和所有胃癌预后为不好的预后不好样本的cox生存分析，确定待定评估基因群是否为能够用于胃癌预后的评估的评估基因群。

公开(公告)号：CN108009400B

公开(公告)日：2018-07-06

申请号：CN201810264479.8

申请日：2018-03-28

Applicant: 至本医疗科技(上海)有限公司

Inventor： 施巍炜 ,  王凯 ,  秦公炜 ,  张鹏

IPC: G06F19/18 ,  G06F19/24

Abstract: 本发明提供了一种全基因组肿瘤突变负荷预测方法、设备以及存储介质，其中的全基因组肿瘤突变负荷预测方法，其特征在于，包括以下步骤：存储用于预测全基因组肿瘤突变负荷的预测模型；获取基于样本探针的突变负荷获得过程得到的目标区域的目标肿瘤突变负荷；预测待测样本的全基因组肿瘤突变负荷，其中，采用预测模型，基于获取的目标肿瘤突变负荷的输入，预测得到待测样本的全基因组肿瘤突变负荷，预测模型的公式为：y=ax+b，式中，y为预测得到的全基因组肿瘤突变负荷；x为目标肿瘤突变负荷；a和b为模型参数；用于计算目标肿瘤突变负荷的测序长度的范围为1.0‑2.6MB。