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公开(公告)号:CN113189071B
公开(公告)日:2022-11-22
申请号:CN202110477789.X
申请日:2021-04-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N21/64
Abstract: 本发明提供了一种用于完整器官血管三维网络精准成像的试剂盒及成像方法。具体地,包括:(A)抗凝血剂;(B)去血剂,所述去血剂包括抗凝血剂和血管扩张剂;(C)血管标记物,所述血管标记物包括荧光微球;(D)组织固定剂;和(E)荧光微球稀释液,其中所述荧光微球稀释液包括肝素钠和碳化二亚胺(EDAC)。本发明的试剂盒可实现实验动物或其组织器官的快速、完整、稳定的血管标记。
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公开(公告)号:CN108572099B
公开(公告)日:2021-03-26
申请号:CN201810368691.9
申请日:2018-04-23
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种实现生物组织快速染色的装置包括染色箱,其中,所述染色箱内部具有1‑100个电泳腔放置槽;所述的电泳腔放置槽具有电泳腔、温度传感器、离子浓度传感器、pH传感器、电流传感器和流速传感器。本发明的装置能够有效提高染色的效率,能大幅够减少染色的时间,显著提高染色的质量,具有简单、通用性强、易于组装、且成本低的优点。
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公开(公告)号:CN108192957A
公开(公告)日:2018-06-22
申请号:CN201711279201.X
申请日:2017-12-06
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/36 , C12M1/34
Abstract: 本发明公开了一种DNA合成测序方法和测序系统,所述方法包括:通过水溶性双功能连接单元将引物P1连接于基体表面;在基体表面加入含待测DNA模板的溶液,然后进行等温表面放大反应;再将引物Pe加入基体表面,然后在基体表面加入四种碱基的荧光标记可逆终止剂的延伸反应溶液,进行延伸反应;然后对延伸后的DNA双链进行成像之后,加入相应的化学试剂,使荧光标记可逆终止剂的连接单元断裂。重复DNA链延伸和断裂步骤,完成多次循环测序,即得待测DNA模板核苷酸的碱基序列。本发明测序方法可用于DNA高通量合成测序,在所述测序条件下实验结果其读长至少为73碱基;如果双端测序,其读长至少为146,准确率至少为99.98%。
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公开(公告)号:CN106769350A
公开(公告)日:2017-05-31
申请号:CN201710049563.3
申请日:2017-01-20
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种用于富含脂滴组织快速完全透明化的方法,具体地,本发明的方法包括以下步骤:提供一水凝胶固定处理后的富含脂滴的组织样品;对所述的组织样品进行透明化预处理,得到预处理样品;对所述的预处理样品进行透明化处理,得到透明化样品;以及对所述的透明化样品进行透明化后处理,得到透明化终样品。本发明的方法不会对生物组织的精细结构造成破坏,并且可以显著提高生物组织的光学成像的深度。
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公开(公告)号:CN104725453A
公开(公告)日:2015-06-24
申请号:CN201510031230.9
申请日:2015-01-21
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C07H19/10 , C07C247/10 , C07H1/00 , C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明提供了一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸及其用途,其结构式如式VI所示:其中,荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种;R1、R2、R3、R4、R6为各种取代基,R5为除-C2H5以外的取代基、且R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H;n为0~10的整数。与现有技术相比,本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端;该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的剪切,可用于DNA测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN103675252A
公开(公告)日:2014-03-26
申请号:CN201310661620.5
申请日:2013-12-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/50 , A01N47/12 , A01P3/00 , A01N43/653 , A01N43/54
CPC classification number: G01N33/94 , A01N43/653 , A01N47/12 , A01N2300/00 , A01N43/54
Abstract: 一种基于工程建模的多种化学杀菌剂组合的优化方法,包括如下步骤:A、选择合适的农业病原菌试验体系,并确定两种以上杀菌剂;B、分别测量每种杀菌剂对病原菌的抑制率关于剂量的响应曲线;C、根据所得的响应曲线建立数据驱动模型;D、基于数据驱动模型优化出理想的杀菌剂组合。本发明通过建立病原菌对组合杀菌剂响应的模型,仅需要非常少量的实验次数就能找到最理想的杀菌剂组合,不但提高了抑制病原菌的效率,且相较于同效率的单个杀菌剂作用时的杀菌剂剂量减少,降低了化学杀菌剂使用对环境造成的危害,且由于采用多种杀菌剂联合使用,可以大大降低化学杀菌剂使用一段时间以后产生的耐药性。
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公开(公告)号:CN103539697A
公开(公告)日:2014-01-29
申请号:CN201310462509.3
申请日:2013-09-30
IPC: C07C245/08 , C07H19/10 , C07H1/00 , C12Q1/68
Abstract: 本发明公开了一种还原敏感偶氮连接单元的合成及其在DNA测序中的用途;该还原敏感偶氮连接单元结构式如下:其中m为0~44中任一整数,n为0~44中任一整数。该还原敏感偶氮连接单元与核苷酸及荧光素连接得到可逆终端,所述可逆终端用于DNA合成测序。与现有技术相比,本发明合成了一类新的可裂解连接单元,并用于合成了基于这种连接单元的可逆终端;该类可逆终端在温和的条件下可以实现高效率的裂解,可用于DNA合成测序;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
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公开(公告)号:CN110343612B
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN201810308292.3
申请日:2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , C12M1/34 , C12M1/00
Abstract: 本发明提供了一种基于多色荧光可逆终止核苷酸的DNA单分子测序系统及装置,所述测序系统包括引物、待测DNA模板、多色荧光可逆终止核苷酸测序试剂;所述引物固定在流通池反应器表面;将待测DNA模板与测序引物进行杂交,然后用多色荧光可逆终止核苷酸延伸引物后,检测延伸引物的荧光信号即可得到待测DNA序列信息;所述待测DNA模板的3’端不需要标记定位荧光。本发明通过利用测序循环过程中,延伸反应物的荧光作为下一次延伸的定位荧光,或采用固定在流通池反应器表面的定位荧光标记物作为定位荧光,无需对待测DNA模板的3’端标记定位荧光,从而有效避免了由于淬灭而导致定位信息丢失的问题,可进一步大幅延长测序读长并降低错误率。
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公开(公告)号:CN108572099A
公开(公告)日:2018-09-25
申请号:CN201810368691.9
申请日:2018-04-23
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 一种实现生物组织快速染色的装置包括染色箱,其中,所述染色箱内部具有1-100个电泳腔放置槽;所述的电泳腔放置槽具有电泳腔、温度传感器、离子浓度传感器、pH传感器、电流传感器和流速传感器。本发明的装置能够有效提高染色的效率,能大幅够减少染色的时间,显著提高染色的质量,具有简单、通用性强、易于组装、且成本低的优点。
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公开(公告)号:CN108424844A
公开(公告)日:2018-08-21
申请号:CN201810307850.4
申请日:2018-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12M1/34 , C12M1/00 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种单分子测序芯片及其制备方法,所述芯片包括流道板、基板和盖板,所述流道板设置在基板和盖板之间;所述流道板上设置流通池,所述流通池包括多个平行设置的流道;所述流通池的上方设置盖板、流通池的下方设置基板;所述流道的底部与基板表面连通;与流道板接触的所述基板的表面固定测序引物和定位用荧光标记物。该芯片表面负载有荧光寿命长、荧光强度高,荧光性能稳定的量子点或荧光微球,可以在测序过程中对目标DNA单分子进行定位。由于量子点或荧光微球在经过很多次的激发光照后仍然能够保持较高的荧光强度,解决了定位荧光信号无法长时间保持的问题,显著提高单分子测序读长,降低测序的错误率,并有效降低测序成本。
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