本申请公开一种车身性能优化方法、系统及存储介质，车身性能优化方法包括：搭建基于CAE的基础模型，计算基础模型的车身性能选取车身的关键零部件，根据关键零部件的参数化变量，建立参数化模型，生成DOE矩阵表，求解计算并提取整理计算结果，形成包含车身性能的DOE矩阵表；构建神经网络模型，使用DOE矩阵表进行训练达到目标精度；根据训练完成的神经网络模型对参数化变量进行灵敏度分析，以获取对参数化变量的灵敏度分析结果；根据灵敏度分析结果，调整关键零部件的参数化变量，以优化车身性能。通过灵敏度分析与机器学习模型相结合，选择合理的参数化变量，从而达到车身性能和重量的平衡。