本发明公开了一种低铵盐酱油及其制备方法，属于调味品制备技术领域；本发明提供的低铵盐酱油的制备方法包括以下步骤：将黄豆用盐水浸泡后蒸煮，得熟黄豆，随后将熟黄豆、小麦和曲霉混合制曲，得曲料；接着将曲料与食盐水混合自然发酵一段时间后添加耐盐酵母继续发酵，得酱醪；最后将酱醪压榨，得低铵盐酱油；本发明提供的低铵盐酱油中铵盐含量低、蛋白质利用率高。同时本发明提供的制备方法无需引入其他试剂、无需其他定制设备，因此，本发明提供的制备方法操作简单、设备常规且安全性高。