本发明提供了一种用于核酸检测装置的温度控制方法及检测装置，所述温度控制方法包括如下步骤：S1，获取预先设置的多段温度设定值；S2，获取核酸检测装置采集的多点实时温度，计算得到温度平均值；S3，计算所述多段温度设定值与所述温度平均值的差值；S4，通过P I D控制增量式和所述差值计算或者设定PWM并输出占空比，控制温控模块进行升温和降温。本发明本通过优化温度控制系统，并采取分段温度控制方法，获取不同温度段内的温度差值，不同的温度分段采用不同的P I D控制参数，输出不同的PWM占空比，从而提高核酸检测装置温控系统的升降温速率和精度。