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公开(公告)号：CN109101783A
公开(公告)日：2018-12-28
申请号：CN201810920673.7
申请日：2018-08-14
Applicant: 温州大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明公开了一种基于概率模型的癌症网络标志物确定方法及系统，该方法包括：利用概率密度函数，将获取的所有正常样本和疾病样本的基因表达数据矩阵均转化为似然度矩阵，并根据所有正常样本似然度矩阵，构建正常样本分布函数；然后将每个疾病样本似然度矩阵中的每个元素带入正常样本分布函数中，确定每个疾病样本的显著差异基因集合，并将每个疾病样本的显著差异基因集合映射到蛋白质-蛋白质相互作用网络中，确定每个疾病样本的网络标志物。应用本发明提供的方法或者系统，能够准确有效的获取癌症网络标志物，并利用这些癌症网络标志物对疾病进行亚型分类从而实现疾病的精准诊断和治疗。
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公开(公告)号：CN106599607B
公开(公告)日：2018-12-04
申请号：CN201611143308.7
申请日：2016-12-13
Applicant: 北京林业大学
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供了一种光合通路基因调控网络的构建方法，包括以下步骤：1)获得物种的光合通路基因的SNP数据；2)对物种的表型性状测定，得到表型数据；3)利用所述步骤1)得到的SNP数据和所述步骤2)得到的表型数据进行基因位点间的上位性模式检测，确定两两基因间的相互作用关系；4)验证所述步骤3)得到基因间的相关性；5)以所述步骤3)得到具有相关性的基因为候选基因，构建基因调控网络；所述步骤1)和步骤2)之间没有时间顺序限制。本发明提供的构建方法综合考虑基因位点变异及生物群体表型，通过计算位点间上位性，更精确地构建基因调控网络，并且对光合作用机理的研究及其改良具有重要的理论意义和实用价值。
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公开(公告)号：CN108846896A
公开(公告)日：2018-11-20
申请号：CN201810697956.X
申请日：2018-06-29
Applicant: 南华大学
Inventor： 曹朝晖
Abstract: 本发明属于医疗诊断技术领域，公开了一种自动分子蛋白质分子体学诊断系统，所述自动分子蛋白质分子体学诊断系统包括：蛋白质检测模块、DNA检测模块、主控模块、DNA测序模块、癌细胞检测模块、专家分析模块、数据存储模块、显示模块；蛋白质检测模块的检测方法包括根据磁共振或计算机断层成像体素数据的灰度或纹理特性，绘制蛋白质分子体外部边界轮廓线和内部组织边缘线。本发明通过DNA测序模块可以快速、准确、低成本进行DNA测序；同时通过癌细胞检测模块能够提供能在短时间内简便地检测末梢血中的癌细胞；通过专家分析模块可以更加专业的对检测数据进行分析，保障检测结果的可靠性。
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公开(公告)号：CN108733972A
公开(公告)日：2018-11-02
申请号：CN201811094639.5
申请日：2018-09-19
Applicant: 中国科学院烟台海岸带研究所
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供评估和预测有机磷酸酯阻燃剂对模拟生物膜损伤的方法，属于生态风险评估策略领域。包括以下步骤：通过交流阻抗法测定了16种典型OPFRs对模拟生物膜作用的阻抗值，阻抗值大小用于表征对膜的损伤程度。采用逐步回归和偏最小二乘法筛选分子描述符并构建了QSAR模型，用于解释OPFRs与模拟生物膜相互作用的微观作用机理，评估和预测应用域内OPFRs对模拟生物膜的损伤。本发明建立的QSAR模型具有良好的拟合优度和稳健性。本发明方法的数据易于获取，成本低廉，方便快捷，节省大量人力、物力和实验时间，能够准确分析OPFRs与膜的作用机制，为OPFRs的海洋监测和生态风险评估提供基础理论数据。
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公开(公告)号：CN108710784A
公开(公告)日：2018-10-26
申请号：CN201810469702.2
申请日：2018-05-16
Applicant: 中科政兴(上海)医疗科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基因转录变异几率及变异方向的算法，海量的高通量数据以及对检测结果的准确性要求使得InDel检测面临着大的挑战，若直接将短序列比对到参考序列上会出现两个问题，一个是映射过程中计算复杂需要很长时间，另一个是当read在参考序列上存在匹配时，read将会映射到其在参考序列的第一个匹配，这通常不是最佳匹配，为了解决以上两个问题，本发明先对滑窗方法产生的参考序列的seed集合进行构建哈希表，然后在比对时利用哈希表对read进行定位先对滑窗方法产生的参考序列的seed集合进行构建哈希表，由于参考序列信息量大，而哈希表耗内存，因此在创建哈希表的同时对序列进行了二进制压缩，使得内存占用大大减少。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108701170A
公开(公告)日：2018-10-23
申请号：CN201780015280.5
申请日：2017-03-08
Applicant: 索尼公司
IPC: G06F19/12
CPC classification number: A61B1/00193 , A61B1/00009 , A61B1/3132 , A61B90/36 , A61B2034/2065 , A61B2090/3612 , A61B2090/367 , A61B2090/371 , G06T7/11 , G06T7/593 , G06T11/008 , G06T2207/10021 , G06T2207/30004
Abstract: 本文公开了用于产生解剖部分的三维(3D)视图的图像处理系统和方法的各方面。所述系统包括图像处理装置，该图像处理装置被配置为接收与解剖部分相关联的多个二维(2D)图像，每个2D图像具有第一视场(FOV)值。从解剖部分的3D重构产生解剖部分的具有第二FOV值的第一3D视图。3D重构是通过使用从接收的多个2D图像选择的2D图像帧集合而获得的。第二FOV值大于解剖部分的所述多个2D图像中的每个的第一FOV值。基于产生的第一3D视图与解剖部分的术前状态所关联的3D数据的对齐来产生第二3D视图。
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公开(公告)号：CN106503482B
公开(公告)日：2018-10-09
申请号：CN201610826031.1
申请日：2016-09-14
IPC: G06F19/12
Abstract: 本发明提供一种定量分析方法，所述方法用于量化比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法整合模块不同维度(属性)的拓扑参数，构建量化模块变化的整体综合指标，定量分析比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法包括：1)分别构建药物干预前和药物干预后的生物分子网络，并分别进行模块的识别；2)匹配药物干预前和药物干预后的生物分子网络中变化的模块，确定变化模块对；3)整合表示模块不同维度的拓扑参数，结合所述拓扑参数的权值，构建模块综合评价体系，计算药物干预前后生物分子网络中模块整体构象的改变程度。本发明可应用于生物网络分析、新药研发设计、药理机制研究等领域。
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公开(公告)号：CN108348340A
公开(公告)日：2018-07-31
申请号：CN201680061373.7
申请日：2016-09-30
Applicant: 捷迈有限公司
Inventor： P·卡顿尔
CPC classification number: A61B17/1767 , A61B17/158 , A61B34/10 , A61B2017/00526 , A61B2034/102 , A61B2034/105 , A61B2034/108
Abstract: 一种用于创建用于髌骨表面修复术的患者特定夹具模型的系统包括：髌骨植入物定位模块，其用于获得髌骨植入物在髌骨的模型上的规划位置，该模型在解剖学上是患者特定的。髌骨表面修复计算器模块根据髌骨植入物的规划位置计算髌骨中的表面修复平面和附接孔的位置和/或取向。夹具模型生成器模块用于使用髌骨的表面修复平面和附接孔以及髌骨的模型生成和输出虚拟夹具模型，该夹具模型包括：至少一个患者特定接触表面，其对应于髌骨的用于互补接触的表面；至少一个钻引导件，其被相对于至少一个患者特定接触表面定位并且被配置成引导限定用于髌骨植入物的附接孔的工具；以及至少一个切割引导件，其被相对于至少一个患者特定接触表面定位并且被配置成在对髌骨进行表面修复中引导工具以形成规划表面修复平面。
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公开(公告)号：CN108345768A
公开(公告)日：2018-07-31
申请号：CN201810054474.2
申请日：2018-01-19
Applicant: 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本申请公开了一种确定婴幼儿肠道菌群成熟度的方法和标志物组合。本申请的方法，包括以提取自待测婴幼儿离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析，将标志物组合的定量分析结果，与基线参考标准相比较，确定肠道菌群的相对成熟度；标志物组合包括：X个分类学单元、Y个代谢通路、和/或Z个基因基线参考标准是以提取自标准婴幼儿个体的离体样品的核酸为基础，对肠道菌群成熟度的标志物组合进行定量分析的结果；标准婴幼儿个体符合(a)人体测量指标符合WHO儿童生长标准的正常范围；(b)顺产出生、断奶前为母乳喂养、采样前无抗生素暴露。本申请的方法可提高确定婴儿肠道菌群成熟度的准确性、精确性和稳健性。
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