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公开(公告)号:CN109416932A
公开(公告)日:2019-03-01
申请号:CN201780040639.4
申请日:2017-06-19
Applicant: 皇家飞利浦有限公司
Inventor: D·普莱泰亚 , T·许尔森 , W·P·M·范德林登 , P·范利斯东克
CPC classification number: G06F21/6254 , G16B50/00
Abstract: 一种用于对来自至少一个个体的遗传数据进行匿名化的方法、系统和计算机程序产品,其中,所述遗传数据基于基因组途径网络被分组为遗传数据的与疾病直接相关的子集以及遗传数据的与疾病远有距离地相关的一个或多个子集,并且其中,遗传数据的与疾病有距离地相关的子集被匿名化。
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公开(公告)号:CN108491692A
公开(公告)日:2018-09-04
申请号:CN201810195831.7
申请日:2018-03-09
Applicant: 中国科学院生态环境研究中心 , 中国科学院大学
IPC: G06F19/28
CPC classification number: G16B50/00
Abstract: 本发明公开了生物技术领域的一种构建抗生素抗性基因数据库的生物信息学方法,该方法包括在基因数据库(GenBank)搜索抗性基因的蛋白序列;选择高度精确的序列作为初始序列;采用ClustalW方法比对;构建隐马尔可夫模型并搜索GenBank蛋白数据库,得到全部包含蛋白保守位点的序列;根据序列的E值和GenBank数据库中序列的注释信息,去除高度同源和不符合要求的序列;删除重复序列后添加物种注释信息;整合所有蛋白序列,完成数据库的构建。该方法能够综合衡量序列的注释信息和比对相似性,提高序列收集的速度和准确性。利用本发明提供的方法,可以完成抗生素抗性基因数据库的构建,为研究抗性基因的引物设计、数据分析和序列注释提供基础数据。
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公开(公告)号:CN106529213A
公开(公告)日:2017-03-22
申请号:CN201610973345.4
申请日:2016-11-04
Applicant: 成都鑫云解码科技有限公司
Abstract: 本申请提供了一种五官对应的基因的突变位点的获取方法及装置,涉及生物信息技术领域。该方法包括:将待测基因的多个短序列与参考基因组进行数据比对,获得待测基因的初步变异位点信息;根据初步变异位点信息,将多个初步变异位点中不满足预设保留条件的变异位点删除,将删除后获得的所述待测基因中的变异位点作为待检位点;将所述待检位点与五官基因库中的五官对应的基因的多个变异位点进行比较;当待检位点中存在与所述五官基因库中位置相同且突变碱基相同的变异位点,获得待测基因中五官对应的基因的位点突变情况。该方法及装置可以获得该待测基因中的变异位点中与五官相关的多个变异位点的突变情况。
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公开(公告)号:CN106460041A
公开(公告)日:2017-02-22
申请号:CN201580016184.3
申请日:2015-03-18
Applicant: 亚利桑那州立大学董事会
Inventor: 卡伦·安德森 , 伊曼纽尔·普鲁肖瑟曼
CPC classification number: G16B30/00 , G06F16/2455 , G06F16/285 , G16B20/00 , G16B50/00
Abstract: 本发明提供了用于鉴定被分至不同表型数据集的序列集之间的蛋白序列差异的基于计算机的生物信息学方法,所述方法涉及查询数据库以鉴定蛋白序列的第一表型数据集和另一表型数据集内的共同序列基序,计算每个数据集的基序之间的两两相关性,并计算数据集之间的变化以鉴定在给定数据集中保守的一个或多个基序并因此与该数据集的表型相关联(图1)。
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公开(公告)号:CN106414761A
公开(公告)日:2017-02-15
申请号:CN201580027276.1
申请日:2015-03-24
Applicant: 席恩赛斯有限公司
Inventor: 迈克尔·伊恩·萨多夫斯基 , 西恩·迈克尔·沃德
CPC classification number: G16B50/00
Abstract: 提供了用于实施生物过程的方法、系统和设备,其中,所述方法包括实施至少一个单元操作,并且其中,根据标准化元件结构定义所述单元操作,所述元件结构包括多个功能区块,并且其中,所述区块包括由导入、参数、数据、物理输入、要求、设置和执行步骤组成的组中的至少一种。
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公开(公告)号:CN104603788A
公开(公告)日:2015-05-06
申请号:CN201380027116.8
申请日:2013-05-23
Applicant: 艾弗诺泰普有限责任公司
CPC classification number: G06F16/9535 , C12Q1/6883 , C12Q2600/158 , G06Q30/02 , G06Q30/0251 , G06Q50/22 , G16B40/00 , G16B50/00 , G16H10/20
Abstract: 本发明提供一种用于建立社交行为与生物学表型测量值的初步整合的方法、数据库和装置。在一个实施例中,提供一种用于将来自样品数据库与调查数据库中的数据相关联的方法。该方法包括从个体获得包括生物分子的样品,同时从个体获得调查数据,将调查数据存储在调查数据库中,分析生物分子的样品以确定生物分子的组分,将来自该组分的数据存储在样品数据库中,以及将来自样品数据库的数据和来自调查数据库的数据相关联。
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公开(公告)号:CN101808573B
公开(公告)日:2011-12-28
申请号:CN200880109415.5
申请日:2008-09-24
Applicant: 微软公司
Inventor: E·J·霍维茨 , S·巴思彻 , D·E·赫克曼 , C·D·卡尔卡尼亚斯
Abstract: 提供了便于使用遗传工程设计的共生试剂对活体的状况或需求进行感测、检测或治疗的系统和方法。
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公开(公告)号:CN108681661A
公开(公告)日:2018-10-19
申请号:CN201810468822.0
申请日:2018-05-16
Applicant: 杭州迈迪科生物科技有限公司
IPC: G06F19/28
CPC classification number: G16B50/00
Abstract: 本发明涉及一种伴随实验生成样本ID的方法,包括用于生成ID的基因位点的挑选和伴随高通量测序流程生成样本编码ID两个步骤。通过缩小基因位点范围,快速筛选出一定数目的位点用于验证样本是否错误标记或者污染,可简单快速地判断样本是否一致,识别样本集或实验中意外样本混淆错误,保证实验结果的准确可靠。
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公开(公告)号:CN104272311B
公开(公告)日:2018-08-28
申请号:CN201380008411.9
申请日:2013-02-07
Applicant: 陶氏益农公司
IPC: G06F19/18
Abstract: 提供了用于数据分析的系统和方法。在一实施方案中,提供了一种分析方法,包括:电子接收序列数据;电子接收一个或多个与至少一个表达载体相关的参比数据序列;将所述序列数据与所述参比数据序列中的至少一个关联以鉴定转基因侧翼序列;在基因组中搜索所述转基因侧翼序列的一个或多个插入位点;以及当在所述搜索步骤中找到一个或多个插入位点时,注释所述基因组及该基因组内的所述一个或多个插入位点。
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公开(公告)号:CN107657150A
公开(公告)日:2018-02-02
申请号:CN201710801927.9
申请日:2017-09-07
Applicant: 北京荣之联科技股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种可视化生物信息分析工具生成方法和装置,所述方法包括:显示第一可视化编辑界面;所述第一可视化编辑界面包括至少一个配置栏;获取用户通过所述配置栏输入的输入信息;根据预设的生成规则,获取所述输入信息对应的代码段,并基于所述代码段生成生物信息分析工具。本发明通过在可视化界面上的简单操作即可快速高效的生成生物信息分析工具;此外,基于多个生成的生物信息分析工具,还能够方便的生成生物信息分析流程。
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