一种基于自回归式模型的药物设计方法

    公开(公告)号:CN118588196B

    公开(公告)日:2025-04-25

    申请号:CN202410754023.5

    申请日:2024-06-12

    Abstract: 本发明公开了一种基于自回归式模型的药物设计方法,属于药物设计技术领域。该方法包括:将子词分词算法应用于生物学文本处理,对数据集中的蛋白质与配体信息进行训练,得到蛋白质和配体的分词器,并在此基础上构建自回归模型的分词器;处理并转化数据集中的原始数据为适用于自回归模型的文本形式,再通过所得分词器进行编码,构建自回归模型所需的训练数据集;利用训练数据集训练自回归模型,使其能理解配体的SMILES表示,并学习蛋白质与配体之间的相互作用模式;利用训练过的自回归模型生成预测的配体数据,并通过化学信息工具进行后处理,以获得具有具体化学结构的候选配体;对得到的候选配体进行评估和优化,以确定有潜力成为有效药物的候选分子。

    多模态功能成像的一体化放疗监测装置

    公开(公告)号:CN114602067A

    公开(公告)日:2022-06-10

    申请号:CN202210077316.5

    申请日:2022-01-24

    Abstract: 一种多模态功能成像的一体化放疗监测装置,包括环形一体化载架,环形一体化载架安装于医用加速器机头的出束口,与医用加速器机头同体运动;环形一体化载架上安装有三维轮廓采集模块、CLI信号采集模块和生物光谱图像采集模块;三维轮廓采集模块用于在放疗过程中采集放疗靶区体表轮廓的三维点云数据;CLI信号采集模块用于在放疗过程中采集高能粒子照射生物体产生的切伦科夫光信号;生物光谱图像采集模块用于在放疗过程中采集放疗区域肿瘤组织产生的切伦科夫光谱图像。本发明联合使用TOF技术、生物光谱技术,将设备一体化集成于医用加速器机头,与加速器同体运动,保证采集角度始终一致,利于成像。

    一种基于自回归式模型的药物设计方法

    公开(公告)号:CN118588196A

    公开(公告)日:2024-09-03

    申请号:CN202410754023.5

    申请日:2024-06-12

    Abstract: 本发明公开了一种基于自回归式模型的药物设计方法,属于药物设计技术领域。该方法包括:将子词分词算法应用于生物学文本处理,对数据集中的蛋白质与配体信息进行训练,得到蛋白质和配体的分词器,并在此基础上构建自回归模型的分词器;处理并转化数据集中的原始数据为适用于自回归模型的文本形式,再通过所得分词器进行编码,构建自回归模型所需的训练数据集;利用训练数据集训练自回归模型,使其能理解配体的SMILES表示,并学习蛋白质与配体之间的相互作用模式;利用训练过的自回归模型生成预测的配体数据,并通过化学信息工具进行后处理,以获得具有具体化学结构的候选配体;对得到的候选配体进行评估和优化,以确定有潜力成为有效药物的候选分子。

    一种基于自回归式模型的药物设计方法

    公开(公告)号:CN116779060A

    公开(公告)日:2023-09-19

    申请号:CN202310711607.X

    申请日:2023-06-15

    Abstract: 一种基于自回归式模型的药物设计方法,将子词分词算法应用于生物学文本处理,对数据集中的蛋白质与配体信息进行训练,得到蛋白质和配体的分词器,并在此基础上构建自回归模型的分词器;处理并转化数据集中的原始数据为适用于自回归模型的文本形式,再通过所得分词器进行编码,构建自回归模型所需的训练数据集;利用训练数据集训练自回归模型,使其能理解配体的SMILES表示,并学习蛋白质与配体之间的相互作用模式;利用训练过的自回归模型生成预测的配体数据,并通过化学信息工具进行后处理,以获得具有具体化学结构的候选配体;对得到的候选配体进行评估和优化,利用化学或生物信息工具进行结构优化和活性预测,以确定有潜力成为有效药物的候选分子。

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